Pacbio tam uzunluqlu transkript

Pacbio Tam Uzunluqlu Transkripte Sequencing, ISOSEQ, transkript izoformlarının dəqiq müəyyənləşdirilməsini, alternativ poladenilasyon və yayma işığının dəqiq müəyyənləşdirilməsini və daha dəqiq gen ifadəsinə səbəb olmağa imkan verir. BMKCloud Pacbio Tam Uçuş Transkripte Boru Kəməri, dairəvi konsensus ardıcıllıqla (CCS) rejimində ardıcıllıqla CDNA kitabxanalarını təhlil etmək üçün hazırlanmışdır və daha sonra lazımsız transkriptlərə klasterləşdirilmiş tammetraj olmayan (flnc) ardıcıllığı müəyyənləşdirir. Sonrakı Busco analizi transkript məclisinin tamlığını qiymətləndirir. Yığılmış transkripsiyadan çoxlu analizlər aparılır: alternativ parçalanma, sadə ardıcıllıqla təkrarlama (SSR), lncrna və müvafiq hədəf genlərinin proqnozu, roman genləri, gen genlərinin proqnozu, gen genlərinin proqnozu, transkripsiya faktoru təhlili və transkripsiyaların funksional analizi.