İstinad olmayan mRNA SEVENCING-NGS
Xüsusiyyət
● Kitabxana hazırlığından əvvəl POLY MRNA-nın tutulması
● Hər hansı bir istinad genomundan asılı olmayaraq: Birdən çox verilənlər bazası (NR, Swiss-prot, Kog, Kog, Eggnog, Pfam, Pfam, Get, Kegg) ilə əlaqəli olmayan bir ungenes siyahısının siyahısını hazırlamaq
● Gen ifadəsinin və transkript quruluşunun hərtərəfli bioinformatik təhlili
Xidmət üstünlükləri
●Geniş ekspertizası: Mobil mədəniyyətlər, toxumalar və bədən mayeləri kimi müxtəlif nümunə növləri olan BMQgene-də 600.000-dən çox nümunə işləmə izi ilə komandamız hər layihəyə zəngin bir təcrübə yaradır. Müxtəlif tədqiqat sahələrində 100.000 MRNA-SEQ layihələrini uğurla bağladıq.
●Ciddi keyfiyyət nəzarəti: Nümunə və kitabxana hazırlığının ardından və bioinformatika üçün hazırlanan bütün mərhələlər üzrə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk. Bu diqqətli monitorinq ardıcıl yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
● Hərtərəfli annotasiya: Fərqli olaraq ifadə edilmiş genləri (DEGS) işlətmək və müvafiq zənginləşdirmə analizini işlətmək üçün birdən çox məlumat bazasından istifadə edirik və transkripte cavabı əsas olan mobil və molekulyar proseslərdə fikirlərini təmin etmək üçün müvafiq zənginləşdirmə analizini yerinə yetirin.
●Satışdan sonrakı dəstək: Öhümüzdəki öhdəliklər, 3 aylıq satış müddəti ilə layihənin tamamlanması xaricində uzanır. Bu müddət ərzində, layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, nəticələrlə bağlı hər hansı bir sorğuya müraciət etmək üçün Layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması və Sessiyalar təklif edirik.
Nümunə tələbləri və çatdırılması
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur | Keyfiyyətə nəzarət |
| Poli bir zənginləşdirilmişdir | Illumina pe150 Dnbseq-t7 | 6-10 gb | Q30≥85% |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Conc. (NG / μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Bütövlük |
| ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Geldə göstərilən və ya bir protein və ya DNT çirklənməsi. | Bitkilər üçün: rin≥4.0; Heyvanlar üçün: Rin≥4.5; 5.0≥28S / 18s≥1.0; Məhdud və ya heç bir təmas yoxdur |
● bitkilər:
Kök, kök və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1.2 g
● Heyvan:
Ürək və ya bağırsaq: 300 mq
Viscera və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 450 mq
Sümüklər, saç və ya dəri: 1g
● Artropodlar:
Həşəratlar: 6g
Xərçəngkimilər: 300 mq
● Bütün qan: 1 boru
● Hüceyrələr: 106 mətbuat
Tövsiyə olunan nümunə çatdırılma
Konteyner: 2 ml sentrifuge borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: qrup + replikat, məsələn, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Göndərmə:
1. Quru buz: Nümunələr çantalarda qablaşdırılmalı və quru buzda dəfn edilməlidir.
2. RNastable borular: RNA nümunələri RNA sabitləşdirmə borusunda (məsələn, rnastable ®) qurudulmuş və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət iş axını
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılma
Rna ekstraksiya
Kitabxana inşası
Ardıcıllıq
Məlumat təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
Transcripte Məclisi və Ungene Seçimi
Ungene annotasiya
Nümunə korrelyasiya və bioloji replikaların qiymətləndirilməsi
Dilə gətirilən genlər (DEG)
Degs-in funksional annotasiyası
Degs-in funksional zənginləşdirilməsi
Bmkgene'nin eukaryotik NGS tərəfindən idarə olunan provardmanları araşdırın.
Shen, F. et al. (2020) 'De Novo transkripte Məclisi və Catfish (Silurus Asotus), Genomiklər, 112 (3), PP. 2603-2614. DOI: 10.1016 / J.Ygeno.2020.01.026.
Zhang, C. et al. (2016) 'Soğan (alium Cepa L.), 7 (sentyabr), 7 (sentyabr), soğan sahəsindəki sərhədləri (sentyabr), s. 212763. DOI: 10.3389 / FPLS.2016.01425 / BIBTEX.
Zhu, C. et al. (2017) 'Sarcocheilichyathys Sinensis'in transkriptinə görə Novo Məclisi, Xarakterisizatlaşdırma və Annotasiya', Pos One, 12 (2). DOI: 10.1371 / jurnal.pone.0171966.
Zou, L. et al. (2021) 'De Novo transcripte analizi, şoranlıq stresində podokarpus makrofillusunun duz tolerantlığına dair fikirlər verir', BMC bitki biologiyası, 21 (1), s. 1-17. Doi: 10.1186 / S12870-021-03274-1 / rəqəmlər / 9.
