T2T Genom Məclisi, Gap Pulsuz Genom
1stİki düyü genomu1
Başlıq: Xian / Indica düyü üçün iki boşluqsız istinad genomunun montajı və təsdiqlənməsi zavod Centromere memarlığına anlayışları ortaya qoyur
Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Göndərilən vaxt: 01 yanvar 2021-ci il.
İnstitut: Huazhong Kənd Təsərrüfatı Universiteti, Çin
Material
O. Sativa Xian / IndicaDüyü sortları 'Zhenshan 97 (ZS97)' və 'Minghui 63 (MH63)
Ardıcıllıq strategiyası
NGS oxunur + HiFi oxunur + CLR oxunur + Bionano + Hi-C
Məlumat:
ZS97: 8.34 GB (~ 23x) HiFi oxuyur + 48.39 GB (~ 131x) CLR + 25 GB (~ 69x) NGS + 2 byono irys hüceyrələri oxunur
MH63: 37.88 GB (~ 103x) HiFi oxuyur + 48.97 GB (~ 132x) CLR + 28 GB (~ 76x) NGS + 2 byono irys hüceyrələri oxunur
Şəkil 1 Düyü (MH63 və ZS97) iki boşluqsuz genomı
2ndBanan genomu2
Başlıq: Nanopore ardıcıllıqla istifadə edən telomere-to-telomere boşluq xromosomları
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
Göndərilən vaxt: 17 aprel 2021.
İnstitut: Université Paris-Saclay, Fransa
Material
İkiqat haploidMusa akuminatasppmalakkensis(Dh-pahang)
Ardıcıl strategiya və məlumatlar:
HiseQ2500 PE250 MODE + Minion / Prometion (93GB, ~ 200x) + Optik xəritə (DLE-1 + BSPQ1)
Cədvəl 1 Musa Acuminata (DH-Pahang) Genome Assambleyalarının müqayisəsi
Şəkil 2 Musa Genomes Memarlıq müqayisəsi
3rdPhaeodactylum tricornutum genomu3
Başlıq: Telomere-to-Telomere Genome MəclisiP
Haeodaktyum Tricornutum
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
Göndərilən vaxt: 04 May 2021
İnstitut: Qərb Universiteti, Kanada
Material
Phaeoodaktyum tricornutum(Yosunlar və Protozoa CACAP Mədəniyyət toplanması 1055/1)
Ardıcıl strategiya və məlumatlar:
1 Oxford Nanopore Minion Flow Cell + A 2 × 75 Cüt böhtanları Sonrakı Orta Çıxış Nextseq 550 RUN
Şəkil 3 Telomere-to-Telomere Genome Məclisi üçün iş axını
4thİnsan CHM13 Genom4
Başlıq: Bir insanın genomunun tam ardıcıllığı
Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
Göndərilən vaxt: 27 May 2021
İnstitut: Milli Səhiyyə İnstitutları (NIH), ABŞ
Materiallar: CHM13 hüceyrə xətti
Ardıcıl strategiya və məlumatlar:
30 × Pacbio dairəvi konsensus ardıcıllığı (HIFI), 120 × Oxford Nanopore ultra uzun oxu ardıcıllığı, 100 × İllumina PCR pulsuz sequencing (İlmn), 70 × Illumina / Arima Genomics Hi-C (Hi-C), Bionano Optik Xəritələr, və strand-seq
Cədvəl 2 GRCH38 və T2T-CHM13 insan genom məclislərinin müqayisəsi
İstinad
1.Segey Nurk et al. Bir insan genomunun tam ardıcıllığı. Biorxiv 2021.05.26.445798; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.26.445798
2.Karine Belser et al. Nanopore ardıcıllıqla istifadə edərək, telomere-to-to-tomere banandan banan xromosomları. Biorxiv 2021.04.16.440017; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al. Phaeoodaktyum Tricornutumun telomere-to-to -meere montajı. Biorxiv 2021.05.04.442596; Doi:https://doi.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.Jia-ming mahnısı et al. Xian / Indica düyü üçün iki boşluqsuz bir istinad genomunun montajı və təsdiqlənməsi zavod Centromere memarlığında fikirləri aşkar edir. Biorxiv 2020.12.24.424073; Doi:https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073
Time: Jan-06-2022