Nanopore tam uzunluqlu transcriptome

Nanopore transcriptome sequencing, transkript izoformlarını dəqiq müəyyənləşdirən və kəmiyyətinin dəqiqləşdirilməsi və kəmiyyətinin dəyişdirilməsi üçün güclü bir üsuldur. BMKCloud Nanopore Tam Uzunluqlu Transkripte Boru Kəməri, həm gen, həm də transkript səviyyəsində keyfiyyətli və kəmiyyət təhlili təmin edən Nanopore platformasında yaradılan RNT-SEQ məlumatlarını təhlil etmək üçün hazırlanmışdır. Keyfiyyətə nəzarətdən sonra tammetrajlı olmayan səadətçi olmayan (FLNC) ardıcıllığı əldə edilir və konsensus ardıcıllığı, lazımsız transkriptləri çıxarmaq üçün istinad genomuna göndərilir. Bu transkript dəsti, ifadə kəmiyyət və dilə gətirilən gen və transkriptlər müəyyənləşdirilmiş və funksiya edilmiş və funksional olaraq qeyd olunur. Boru kəmərinə alternativ poladenilasiya (APA) təhlili, alternativ yayan analizi, sadə ardıcıllıqla təkrarlanan (SSR) təhlili, lncrna və müvafiq hədəflərin proqnozu, kodlaşdırma ardıcıllığı (CD), genen ailə analizi, transkripsiya faktoru təhlili, roman genlərinin proqnozlaşdırılması da daxildir və transkriptlərin funksional annotasiyası.