mRNA-seq (NGS) – Yenidən

mRNA ardıcıllığı hüceyrələrdəki bütün mRNT transkriptlərinin xüsusi şərtlər altında profilini yaratmağa imkan verir və müxtəlif tədqiqat sahələrində geniş istifadə olunan texnologiyadır. BMKCloud De novo mRNA-seq boru kəməri heç bir istinad genomu olmadıqda poli-A ilə zənginləşdirilmiş ardıcıllıq kitabxanalarını təhlil etmək üçün nəzərdə tutulmuşdur. Boru kəməri keyfiyyətə nəzarətdən başlayır, ardıncade novotranskript yığılması və unigen dəsti seçimi. Unigen struktur analizi kodlaşdırma ardıcıllığını (CDS) və sadə ardıcıllığın təkrarlarını (SSR) proqnozlaşdırır. Sonradan, diferensial ifadə təhlili sınaqdan keçirilmiş şərtlər arasında diferensial şəkildə ifadə edilmiş genləri (DEG) tapır, ardınca bioloji anlayışları çıxarmaq üçün funksional annotasiya və DEG-lərin zənginləşdirilməsi aparılır.