Metagenomika (NGS)

Illumina ilə ov tüfəngi metagenomikası həm taksonomik, həm də funksional müxtəlifliyin öyrənilməsinə imkan verən mürəkkəb nümunələrdən birbaşa DNT ardıcıllığı ilə mikrobiomları öyrənmək üçün məşhur vasitədir. BMKCloud metagenomic (NGS) boru kəməri keyfiyyətə nəzarət və metagenom montajı ilə başlayır, buradan genlər proqnozlaşdırılır və çoxlu verilənlər bazasından istifadə edərək funksiya və taksonomiya üçün şərh edilən lazımsız məlumat dəstlərinə yığılır. Bu məlumat nümunə daxilindəki taksonomik müxtəlifliyi (alfa müxtəlifliyi) və nümunələrarası müxtəlifliyi (beta müxtəlifliyi) təhlil etmək üçün istifadə olunur. Qruplar arasında diferensial təhlil həm parametrik, həm də qeyri-parametrik testlərdən istifadə etməklə iki qrup arasında fərqlənən OTU və bioloji funksiyaları tapır, korrelyasiya təhlili isə bu fərqləri ətraf mühit faktorları ilə əlaqələndirir.