Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Giriş

Məhsul

Hi-C əsaslı xromatin qarşılıqlı əlaqəsi

Hi-C əsaslı xromatin qarşılıqlı təsiri görüntü

Hi-C, yaxınlıq əsaslı qarşılıqlı əlaqələri və yüksək ötürmə ardıcıllığını araşdırmaqla genomik konfiqurasiyanı ələ keçirmək üçün hazırlanmış bir üsuldur. Metod, formaldehid ilə xromatin ilə müqayisədə, həzm və yenidən livasiya ilə yalnız kovalental əlaqələndirilən parçaları lication məhsulları meydana gətirəcəkdir. Bu ligitor məhsullarını ardıcıllıqla görə, genomun 3D təşkilatını öyrənmək mümkündür. Hi-C, yüngül şəkildə toplanmışdır (bölmə, euchromatin) və daha çox transkript olaraq aktiv olma və daha sıx bir şəkildə dolu olan (B bölmə, hetochromatin) olan bölgələrin paylanmasını öyrənməyə imkan verir. Hi-C həm də toplu quruluşlar qatlanmış və oxşar ifadə nümunələri olan genomun bölgələrini, həkimə və xromatin döngələrini, DNT bölgələrini müəyyənləşdirmək və budur ki, bu da zülallarla birlikdə Tez-tez tənzimləmə elementlərində zənginləşdirilmişdir. BMKGene'nin Hi-C ardıcıllığı xidməti, genom tənzimləməsi və sağlamlıq və xəstəlikdə olduğu üçün yeni prospektlərin açılması üçün yeni prospektlərin açılması, yeni prospektlərin açılması üçün tədqiqatçılar genişləndirir.

Bizimlə əlaqə saxlayın

Xidmət haqqında məlumat

Bioinformatika

Demo nəticələri

Xüsusi nəşrlər

Xidmət xüsusiyyətləri

● PE150 ilə Illumina Novaseq-da ardıcıllıqla.

● Xidmət, çıxarılmış nukleik turşuların əvəzinə, formaldehid ilə keçid və DNT-protein qarşılıqlı təsirlərini qorumaq üçün toxuma nümunələrini tələb edir.

● Hi-C təcrübəsi Biotin ilə məhdudiyyət və sonunmanın məhdudlaşdırılmasını ehtiva edir, ardınca qarşılıqlı əlaqələri qoruyarkən yaranan kəskin ucların dairəsi. DNT daha sonra streptavidin muncuqları ilə aşağı çəkilir və sonrakı kitabxana hazırlığı üçün təmizlənir.

Xidmət üstünlükləri

●Optimal məhdudiyyət fermenti dizaynı: 93% -ə qədər etibarlı qarşılıqlı cütlər olan müxtəlif növlərdə yüksək hi-C səmərəliliyini təmin etmək.

●Geniş ekspertiza və nəşr qeydləri:BMKGene, 800 fərqli növ və müxtəlif patentdən 2000 Hi-C ardıcıllıqla layihələri ilə geniş təcrübəyə malikdir. 900-dən çox yığılmış təsir faktoru olan 100-dən çox nəşr olunan hal.

●Yüksək ixtisaslı bioinformatika komandası:Hi-C təcrübələri və məlumatların təhlili və öz-özünə inkişaf etmiş vizuallaşdırma məlumat proqramı üçün daxili patent və proqram müəllif hüquqları ilə.

●Satışdan sonrakı dəstək:Öhdəliklərimiz 3 aylıq satış müddəti ilə layihənin tamamlanması xaricində uzanır. Bu müddət ərzində, layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, nəticələrlə bağlı hər hansı bir sorğuya müraciət etmək üçün Layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması və Sessiyalar təklif edirik.

●Hərtərəfli annotasiya: Müəyyən edilmiş dəyişikliyi olan genləri funksional olaraq qeyd etmək və müvafiq zənginləşdirmə təhlili ilə bir çox məlumat bazasından istifadə edirik.

Xidmət xüsusiyyətləri

Kitabxana

Ardıcıllıq strategiyası

Tövsiyə olunan məlumatlar çıxışı

Hi-c siqnal həlli

Hi-C kitabxanası

Illumina pe150

Chromatin Loop: 150x

TAD: 50x

Chromatin Loop: 10kb

TAD: 40KB

Xidmət tələbləri

Nümunə növü	Tələb olunan məbləğ
Heyvan toxuması	≥2g
Bütün qan	≥2ml
Göbələk	≥1g
Bitki - gənc toxuma	1g / Aliquot, 2-4 aliqotexnika tövsiyə olunur
Mullu hüceyrələr	≥1x10⁷

Əvvəlki: Tguide ağıllı maqnit zavodu rna dəsti

Sonrakı: DNBSEQ əvvəlcədən hazırlanmış kitabxanalar

Aşağıdakı analiz daxildir:

● Xam məlumat QC;

● Xəritəçəkmə və Hi-C kitabxanası QC: etibarlı qarşılıqlı əlaqə cütləri və qarşılıqlı kəsmə eksponentləri (ides);

● Genom geniş qarşılıqlı profilləmə: MDB / Trans analizi və Hi-C qarşılıqlı xəritəsi;

● A / B bölməsinin paylanmasının təhlili;

● Tads və xromatin döngələrinin müəyyənləşdirilməsi;

● Nümunələr arasındakı 3D xromatin quruluş elementləri və əlaqəli genlərin müvafiq funksional annotasiyası üzrə differensial təhlil.

MDB və TRANS nisbətinin paylanması

Nümunələr arasındakı xromosomal qarşılıqlı əlaqələrin istilik xəritəsi

A / B bölmələrinin genom geniş yayılması

Xromatin döngələrinin genom geniş yayılması

Tads vizuallaşdırılması

BMKgenene'nin Hi-C ardıcıllıqla xidmətlərin idarə etdiyi tədqiqatların araşdırılmasını araşdırın.

Meng, T. et al. (2021) 'Müqayisəli inteqrasiya edilmiş çoxmetr analizi CA2-ni Chordoma üçün bir roman hədəfi kimi müəyyənləşdirir',Neyro-onkologiya, 23 (10), s. 1709-1722. DOI: 10.1093 / Neuonc / Noab156.

Xu, L. et al. (2021) '3D-nin 3D nizamsızlaşdırılması və yenidən qurulması, HI-C, Nanopore və RNT ardıcıllığı ilə NAFD-in patogenezinə fikir verir',ACTA Pharmaceutica Sinica b, 11 (10), s. 3150-3164. DOI: 10.1016 / J.APSB.2021.03.022.