Genom miqyaslı Assosiasiya Təhlili
İş axını
Xidmət Üstünlükləri
●Geniş Ekspertiza və nəşr qeydləri: GWAS-da toplanmış təcrübə ilə BMKGene populyasiya GWAS tədqiqatında yüzlərlə növ layihələrini tamamladı, tədqiqatçılara 100-dən çox məqalə dərc etməyə kömək etdi və məcmu təsir faktoru 500-ə çatdı.
● Hərtərəfli bioinformatika təhlili: iş axınına bir sıra namizəd genləri və onların müvafiq funksional annotasiyasını təqdim edən SNP-xüsusiyyət assosiasiyasının təhlili daxildir.
●Yüksək ixtisaslı bioinformatika komandası və qısa analiz dövrü: qabaqcıl genomik analizdə böyük təcrübəyə malik olan BMKGene komandası sürətli dönüş vaxtı ilə hərtərəfli təhlillər təqdim edir.
●Satışdan sonra dəstək:Bizim öhdəliyimiz 3 aylıq satış sonrası xidmət müddəti ilə layihənin tamamlanmasından kənara çıxır. Bu müddət ərzində biz nəticələrlə bağlı istənilən sualları həll etmək üçün layihənin təqibi, problemlərin aradan qaldırılması üçün yardım və sual-cavab sessiyaları təklif edirik.
Xidmətin spesifikasiyası və tələbləri
| Ardıcıllığın növü | Tövsiyə olunan əhali miqyası | Ardıcıllıq strategiyası | Nukleotid tələbləri |
| Bütün genom ardıcıllığı | 200 nümunə | 10x | Konsentrasiya: ≥ 1 ng/µL Ümumi məbləğ≥ 30 ng Məhdud və ya heç bir deqradasiya və ya çirklənmə |
| Xüsusi Lokus Gücləndirilmiş Fraqment (SLAF) | Etiket dərinliyi: 10x Teqlərin sayı: < 400 Mb: WGS tövsiyə olunur < 1Gb: 100K teq 1Gb > 2Gb: 300K teq Maksimum 500k etiket | Konsentrasiya ≥ 5 ng/µL Ümumi məbləğ ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1,6-2,5 Agaroza gel: deqradasiya və ya çirklənmə yoxdur və ya məhduddur
|
Material seçimi
Müxtəlif növlər, alt növlər, torpaqlar/genbanklar/qarışıq ailələr/vəhşi resurslar
Müxtəlif növlər, alt növlər, landracelər
Yarım sib ailə/tam sib ailə/vəhşi resurslar
Xidmət İş Akışı
Eksperiment dizaynı
Nümunə çatdırılması
RNT çıxarılması
Kitabxana tikintisi
Sıralama
Məlumatların təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Aşağıdakı təhlili ehtiva edir:
- Genom miqyaslı assosiasiya analizi: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM modeli
- Namizəd genlərin funksional annotasiyası
SNP-xüsusiyyət birliyinin təhlili - Manhetten süjeti
SNP-xüsusiyyət birliyinin təhlili - QQ süjeti
Seçilmiş nəşrlər toplusu vasitəsilə BMKGene-nin de GWAS xidmətləri tərəfindən təmin edilən irəliləyişləri araşdırın:
Lv, L. et al. (2023) 'Genom miqyaslı assosiasiya araşdırması ilə ülgüc sinonovacula constricta-da ammonyak tolerantlığının genetik əsaslarına dair fikir',Akvakultura, 569, səh. 739351. doi: 10.1016/J.AKVAULTURA.2023.739351.
Li, X. və başqaları. (2022) '398 tülkü quyruğu darı birləşməsinin multi-omik analizləri evcilləşdirmə, metabolit xüsusiyyətləri və antiinflamatuar təsirlərlə əlaqəli genomik bölgələri aşkar edir',Molekulyar Bitki, 15(8), səh. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Quraqlıq Mühitində Hulless Fenotiplərin Geniş Genom Dərnəyi Xəritəçəkməsi',Bitki Elmində Sərhədlər, 13, səh. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. və başqaları. (2021) 'Sulfotransferazanı kodlayan GmST1, soya mozaika virusunun G2 və G3 ştammlarına qarşı müqavimət göstərir',Bitki, Hüceyrə və Ətraf Mühit, 44(8), səh. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
