Eukaryotik mRNT Analizi (İstinad əsaslı və de novo variantları mövcuddur)
Bu boru kəməri giriş kimi NGS RNT-Seq məlumatlarından istifadə edir və çoxlu aşağı axın analizlərindən nəticələr çıxarır, o cümlədən, lakin bunlarla məhdudlaşmır: məlumatların keyfiyyətinin qiymətləndirilməsinin ardıcıllaşdırılması,de novotranskripsiya sahəsinin annotasiyası, dəyişən splicing təhlili, diferensial ifadə təhlili, funksiya annotasiyası və zənginləşdirmə təhlili.
Uzun kodlaşdırmayan RNT Analizi
Uzun kodlaşdırmayan RNT-lər (lncRNA) 200 nt-dən çox uzunluqlu kodlaşdırılmayan transkriptlərdir və xromatinin təşkilində və tənzimlənməsində rol oynadıqları bilinir. Yüksək məhsuldarlıqlı ardıcıllaşdırma texnologiyaları və bioinformatika mühüm tənzimləyici funksiyaları olan lncRNA-ları müəyyən etmək üçün lncRNA ardıcıllıqlarını və yerləşdirmə məlumatlarını başa düşməmizi gücləndirdi. Bu boru kəməri Eukaryotik mRNT Analizi boru kəmərində qeyd olunan analizlərə əlavə olaraq lncRNA analizini təmin edir.
16S/18S/ITS amplikon ardıcıllığı
Amplicon Sequencing mikrob müxtəlifliyinin təhlili boru kəməri mikrob müxtəlifliyi layihəsinin təhlili üzrə illik təcrübə əsasında hazırlanmışdır. Boru kəməri cari mikrobioloji tədqiqatın əsas təhlili məzmununu və fərdiləşdirilmiş analizi əhatə edən standartlaşdırılmış əsas təhlili ehtiva edir. Təhlil hesabatı zəngin və əhatəlidir və müxtəlif şəxsi təhlillər aparmaq imkanı verir. Bundan əlavə, nümunələr və qruplar əlavə fərdiləşdirmə və nəzarət üçün tez dəyişdirilə bilər.
Ov tüfəngi metagenomikası təhlili
Ov tüfəngi metagenomik analiz boru kəməri ətraf mühit nümunələrindən çıxarılan qarışıq genomik materiallardan NGS məlumatlarından istifadə edir. Daxil edilən təhlillər növlərin müxtəlifliyi və bolluğu, populyasiya strukturu, filogenetik əlaqə, funksional genlər və ətraf mühit faktorları ilə korrelyasiya şəbəkələri haqqında ətraflı məlumat verir.
NGS-WGS Variant Analizi
NGS-WGS Variant Analizi verilənlərin keyfiyyətinə nəzarət, ardıcıllığın uyğunlaşdırılması, annotasiya və gen mutasiyalarının təhlilini həyata keçirən inteqrasiya olunmuş variant aşkarlama boru kəməridir. Boru kəməri SNP və InDel aşkarlanması üçün ən yaxşı GATK təcrübələrini izləyir və struktur variant çağırışı üçün Manta-dan istifadə edir.
Genom Geniş Assosiasiyası Araşdırması (GWAS)
GWAS boru kəməri əvvəllər yaradılan VCF fayllarını və bir qrup fərd üçün müvafiq fenotip məlumatlarını giriş kimi qəbul edən aşağı axın təhlilidir. Xüsusi statistik metodologiyalardan istifadə edərək, GWAS fenotipik fərqlərlə əlaqəli genom boyu nukleotid variasiyalarını aşkar etmək məqsədi daşıyır. O, mürəkkəb insan xəstəlikləri və bitki və heyvanların mürəkkəb əlamətləri ilə əlaqəli funksional genlərin tədqiqində mühüm rol oynayır.
Toplu Seqreqasiya Analizi (BSA)
BSA təhlili ekstremal fenotipik əlamətlərə malik fərdlərin ayrı-ayrı populyasiyadan birləşdirilməsini əhatə edir. Birləşdirilmiş nümunələr arasında diferensial lokusları müqayisə edərək, bu yanaşma hədəf genlərlə əlaqəli sıx əlaqəli molekulyar markerləri sürətlə müəyyən edir. Bitki və heyvanların genetik xəritələşdirilməsində geniş istifadə olunur, marker yardımı ilə yetişdirmə üçün qiymətli vasitədir.
Təkamül Genetika Analizi
Təkamül Genetika Analizi iş axını BMKGENE-nin genetik təkamül layihələrindəki geniş təcrübəsindən istifadə edir və filogenetik ağac tikintisi, əlaqənin tarazlığının təhlili, genetik müxtəlifliyin qiymətləndirilməsi, selektiv tarama identifikasiyası, qohumluq təhlili, əsas komponent təhlili və populyasiya strukturunun xarakteristikası daxildir.
