Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Giriş

Məhsul

Təkamül Genetikası

Təkamül Genetikası, snps, indellər, SV-lər və CNV-lər də daxil olmaqla, genetik dəyişikliklər əsasında, böyük bir qrup şəxs daxilində təkamülün dərin təfsiri təklif etmək üçün hazırlanmış hərtərəfli ardıcıllıqla xidmətdir. Bu xidmət əhalinin quruluşu, genetik müxtəlifliyinin və filogenetik münasibətlərin qiymətləndirilməsi də daxil olmaqla populyasiyaların təkamül növbələrini və genetik xüsusiyyətlərini və genetik xüsusiyyətlərini izah etmək üçün lazım olan bütün zəruri analizləri əhatə edir. Üstəlik, effektiv əhali ölçüsü və ayrılma vaxtının qiymətləndirmələrini təmin edən Gene axınına dair araşdırmalar aparır. Təkamül Genetika Tədqiqatları, növlərin mənşəyi və uyğunlaşmasına dair dəyərli anlayışlar verir.

BMKGene-də, böyük populyasiyalarda təkamülçü genetika tədqiqatlarının aparılması üçün iki prospekt təklif edirik: geniş populyasiyaların (WGS) (WGS) işləməsi və ya azaldılmış bir nümayəndəliyi, daxili inkişaf etmiş xüsusi-lokus gücləndirilmiş fraqment (SLAF). WGS daha kiçik genomlara uyğun olsa da, SLAF daha uzun populyasiyaları öyrənmək üçün səmərəli alternativ olaraq ortaya çıxır, daha uzun genomları ilə, ardıcıllıq xərclərini effektiv şəkildə minimuma endirir.

Bizimlə əlaqə saxlayın

Xidmət haqqında məlumat

Bioinformatika

Demo nəticələri

Xüsusi nəşrlər

Xidmət üstünlükləri

Takagi et al.,Bitki jurnalı, 2013

●Hərtərəfli bioinformatik analiz:növlərin təkamül potensialını əks etdirən və konvergent təkamülün və paralel təkamülün minimuma endirilməsi ilə növlər arasında etibarlı filogenetik əlaqəni aşkar edən genetik müxtəlifliyin qiymətləndirilməsinə imkan verir

●Könüllü xüsusi təhlil: Nukleotid və amin turşularının səviyyəsində dəyişkənliyə əsaslanan fikir ayrılığının və sürətinin qiymətləndirilməsi kimi.

●Geniş ekspertizası və nəşr qeydləri: BMKGene, 15 ildən çoxdur ki, 15 ildən çoxdur ki, əhali və təkamül genetika layihələrində kütləvi təcrübə toplandı, minlərlə növü və s. Təbiət rabitə, molekulyar bitkilər, bitki biotexnologiyası jurnalı və s.

● Yüksək bacarıqlı bioinformatika komandası və qısa analiz dövrü: Ətraflı genomika analizində böyük təcrübə ilə BMKgene komandası sürətli bir dönüş vaxtı ilə hərtərəfli analizlər təqdim edir.

● Satışdan sonrakı dəstək:Öhdəliklərimiz 3 aylıq satış müddəti ilə layihənin tamamlanması xaricində uzanır. Bu müddət ərzində, layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, nəticələrlə bağlı hər hansı bir sorğuya müraciət etmək üçün Layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması və Sessiyalar təklif edirik.

Xidmətin xüsusiyyətləri və tələbləri

Ardıcıllıq növü

Tövsiyə olunan əhali miqyası

Ardıcıllıq strategiyası

Nukleotid tələbləri

Bütün genom ardıcıllığı

≥ 30 şəxs, hər alt qrupdan 10 nəfər olan 10 şəxs

10x

Konsentrasiya: ≥ 1 ng / μl

Ümumi məbləği 30ng

Məhdud və ya heç bir deqradasiya və ya çirklənmə

Xüsusi lokus gücləndirilmiş fraqment (SLAF)

Etiket dərinliyi:

10x

Etiketlərin sayı:

<400 MB: WGS tövsiyə olunur

<1GB: 100k etiketlər

1GB

> 2GB: 300K Tags

Max 500k etiketi

Konsentrasiyası ≥ 5 ng / μl

Ümumi məbləğ ≥ 80 ng

Nanodrop od260 / 280 = 1.6-2.5

Agarose Geli: Yoxdur və ya məhdud bir deqradasiya və ya çirklənmə

Xidmət iş axını

Təcrübə dizaynı

Nümunə çatdırılma

Kitabxana inşası

Ardıcıllıq

Məlumat təhlili

Satış sonrası xidmətlər

Əvvəlki: Bulked segrugant analizi

Sonrakı: Metabolomiya

Xidmətə əhali quruluşunun (phylogogenetik ağac, pci, əhali təbəqə cədvəli), əhalinin müxtəlifliyi və əhali seçimi (Əhali Sahibelte, Seçim Sihirmələrinin seçmə süpürgəsi) təhlili daxildir. Xidmət də xüsusi analiz də (məsələn, ayrılma vaxtı, gen axını) da daxil ola bilər.

*Burada göstərilən demo nəticələri hamısı BMKgene ilə nəşr olunan genomlardan hamısıdır

1.Elovution analizi, phylogogenetik ağacın, əhalinin quruluşu və genetik dəyişikliyə əsaslanan PCA inşası ehtiva edir.

Filogenetik ağac ümumi əcdadlı növlər arasında taksonomik və təkamül münasibətləri təmsil edir.
PCA, alt populyasiyalar arasında yaxınlaşmağı hədəfləyir.
Əhali quruluşu allele tezliyi baxımından genetik olaraq fərqli alt əhalinin varlığını göstərir.

3-filogenetik ağac 3-2pca 3-3Populyasiya quruluşu

Chen, et. al.,Pnas, 2020

2. Doldurucu süpürgə

Seçim süpürgəsi, sərfəli bir saytın seçildiyi bir prosesə və əlaqəli neytral saytların tezliklərinin artırılması və həll edilməmiş saytlardan olanların azaldılması, nəticədə regional azaldılır.

Seçici süpürgə bölgələrində genom geniş aşkarlanması, müəyyən bir addım (10 KB) içərisində olan bir pəncərə (100 KB) olan bütün SNP-nin əhali genetik indeksini (π, fst, tacima d) hesablamaqla işlənir.

Nukleotide müxtəlifliyi (π)
4Nüpli-müxtəliflik (π)

Tacima d
5tajima's-d

Fiksasiya indeksi (FST)

6Fixation-Index (FST)

Wu, et. al.,Molekulyar bitki, 2018-ci il

3.gen axını

7gen axını

Wu, et. al.,Molekulyar bitki, 2018-ci il

4.Demoqrafik tarix

8Demoqrafik tarixi

Zhang, et. al.,Təbiət ekologiyası və təkamül, 2021

5.Divergence vaxtı

9İşləmə vaxtı

Zhang, et. al.,Təbiət ekologiyası və təkamül, 2021

BMKGene'nin təkamül genetik genetika xidmətləri tərəfindən asanlaşdırılan prokraynaları araşdırın.

Hassanyar, Ak et al. (2023) 'APIS Cerana Cerana Larvae-də Sacbroud Virus Müqaviməti ilə əlaqəli SNP molekulyar markerlərin və namizəd genlərinin kəşfi',Beynəlxalq Molekulyar Elmlər Jurnalı, 24 (7). DOI: 10.3390 / IJMS24076238.

Chai, J. et al. (2022) 'Vəhşi, genetik təmiz bir Çin nəhəng Salamanderin kəşfi yeni konservasiya imkanları yaradır',Zooloji tədqiqat, 2022, cild. 43, Sayı 3, Səhifələr: 469-480, 43 (3), s. 469-480. Doi: 10.24272 / J.Sissn.2095-8137.2022.101.

Han, M. et al. (2022) 'fhylogeogharoghical naxış və əhali təkamül tarixi, yerli elymus sibiricus L.-də Qinghai-Tibet PlateauBitki Elmində Sərhədlər, 13, s. 882601. DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.

Wang, J. et al. (2022) 'Uzunluq səviyyəsində Genom Məclisi və Əhali Uzun Genomics'in Longan Təkamülünə genomik anlayışlar',Bağçılıq Tədqiqatı, 9. Doi: 10.1093 / HR / UHAC021.