Eukaryotik mrna ardıcıllıq-NGS
Xüsusiyyət
● Kitabxana hazırlığından əvvəl POLY MRNA-nın ələ keçirilməsi
● Könüllü yönlü MRNA Kitabxana hazırlığı
● Gene ifadəsinin və transkript quruluşunun bioinformatik təhlili
Üstünlük
●Geniş ekspertizası: Komandamız, mobil mədəniyyətlər, toxumalar və bədən mayeləri kimi müxtəlif nümunə növləri olan BMKgene-də 600 mindən çox nümunə işləyib. Hər bir layihəyə bir çox təcrübə gətirir və müxtəlif tədqiqat sahələrində 100.000 MRNA-SEQ layihələrini uğurla başa vurduq.
●Ciddi keyfiyyət nəzarəti: Nümunə və kitabxana hazırlığının ardından və bioinformatika üçün hazırlanan bütün mərhələlər üzrə əsas nəzarət nöqtələrini həyata keçiririk. Bu diqqətli monitorinq, layihənizin etibarlı əllərdə olduğuna inanaraq ardıcıl yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasını təmin edir.
●Hərtərəfli annotasiya: Fərqli olaraq dilə gətirilən genləri (DEGS) işlətmək və müvafiq zənginləşdirmə təhlillərini yerinə yetirmək üçün birdən çox verilənlər bazasından istifadə edirik. Bu hərtərəfli yanaşma, layihənin nəticələri haqqında tam məlumat verilməsini təmin edərək, transkripte cavabı, mobil və molekulyar proseslərə fikir verir.
●Satışdan sonrakı dəstək: Öhümüzdəki öhdəliklər, 3 aylıq satış müddəti ilə layihənin tamamlanması xaricində uzanır. Bu müddət ərzində, layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, nəticələrlə bağlı hər hansı bir sorğuya müraciət etmək üçün Layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması və Sessiyalar təklif edirik.
Nümunə tələbləri və çatdırılması
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur | Keyfiyyətə nəzarət |
| Poli bir zənginləşdirilmişdir | Illumina pe150 Dnbseq-t7 | 6 -10 gb | Q30≥85% |
Nümunə tələbləri:
Nukleotidlər:
| Conc. (NG / μl) | Məbləğ (μg) | Saflıq | Bütövlük | |
| Standart kitabxana | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Geldə göstərilən və ya bir protein və ya DNT çirklənməsi. | Bitkilər üçün: rin≥4.0; Heyvanlar üçün: Rin≥4.5; 5.0≥28S / 18s≥1.0; Məhdud və ya heç bir təmas yoxdur |
| İstiqamətləndirici kitabxana | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Geldə göstərilən və ya bir protein və ya DNT çirklənməsi. | Bitkilər üçün: rin≥4.0; Heyvanlar üçün: Rin≥4.5; 5.0≥28S / 18s≥1.0; Məhdud və ya heç bir təmas yoxdur |
● bitkilər:
Kök, kök və ya ləçək: 450 mq
Yarpaq və ya toxum: 300 mq
Meyvə: 1.2 g
●Heyvan:
Ürək və ya bağırsaq: 300 mq
Viscera və ya beyin: 240 mq
Əzələ: 450 mq
Sümüklər, saç və ya dəri: 1g
● Artropodlar:
Həşəratlar: 6g
Xərçəngkimilər: 300 mq
● Bütün qan: 1 boru
● hüceyrələr: 106 mətbuat
Tövsiyə olunan nümunə çatdırılma
Konteyner: 2 ml sentrifuge borusu (qalay folqa tövsiyə edilmir)
Nümunə etiketləmə: qrup + replikat, məsələn, A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Göndərmə:
1. Quru buz: Nümunələr çantalarda qablaşdırılmalı və quru buzda dəfn edilməlidir.
2. RNAS masa boruları: RNA nümunələri RNA sabitləşdirmə borusunda (məsələn, rnastable ®) qurudulmuş və otaq temperaturunda göndərilə bilər.
Xidmət iş axını
Təcrübə dizaynı
Nümunə çatdırılma
Rna ekstraksiya
Kitabxana inşası
Ardıcıllıq
Məlumat təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Bioinformatika
Eukaryotik MRNA ardıcıllıqla analiz iş axını
Bioinformatika
ØXam məlumat keyfiyyətinə nəzarət
Øİstinad Genome hizalanması
ØTranskript quruluşu analizi
Øİfadə kəmiyyəti
ØDiferensial İfadə Təhlili
ØFunksiya annotasiyası və zənginləşdirmə
İstinad Genome hizalanması
Məlumat doyması
Nümunə korrelyasiya və bioloji replikaların qiymətləndirilməsi
Dilə gətirilən genlər (DEG)
Degs-in funksional annotasiyası
Degs-in funksional zənginləşdirilməsi
Bmkgene'nin eukaryotik NGS tərəfindən idarə olunan provardmanları araşdırın.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan və TricloCarban, qoxuan tanınması, qoxulu siqnal köçürülməsini pozaraq qızıl balıq tutumunu zəiflədir və qeyri-adi məlumat emalı', su tədqiqatı, 233, s. 119736. DOI: 10.1016 / J.WATRES.2023.119736.
Jia, lj et al. (2023) '2023)' Aspergillus Fumigatus, insan p11, göbələk ehtiva edən phagosomes'i dəyişdirməyən phagosomes'i, hüceyrə sahibi və mikrob, 31 (3), 31 (3), s. 373-388.E10. DOI: 10.1016 / J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'TCP transkripsiyası amilləri MA Bamboo (Dendrocalamus Lətiflorus Munro), 13, səh. 884443. Doi: 10.3389 / Fpls.2022.884443 / Bibtex.
Wen, x. et al. (2022) 'Chrysanthemum Lavandulifolium Genome və müxtəlif kapitulum növləri', bağırsaqçılıq tədqiqatları, 9.1093 / saat / uhhab022.
Zhang, Yujie et al. (2023). 101798. DOI: 10.1016 / J.Nantod.2023.101798.
