Illumina əvvəlcədən hazırlanmış kitabxanalar
Xüsusiyyətlər
●Platformalar:Illumina NovaSeq 6000 və NovaSeq X Plus
●Sıralama rejimləri:PE150 və PE250
●Ardıcıllıqdan əvvəl kitabxanaların keyfiyyətinə nəzarət
●Məlumatların ardıcıllaşdırılması QC və çatdırılma:Q30 oxunuşlarının demultipleksləşdirilməsi və filtrlənməsindən sonra QC hesabatının və xam məlumatların fastq formatında çatdırılması
Xidmət Üstünlükləri
●Ardıcıllıq xidmətlərinin çox yönlülüyü:müştəri zolağa, axın xanasına və ya tələb olunan məlumat miqdarına görə ardıcıllığı seçə bilər (qismən zolağın ardıcıllığı).
●Illumina sıralama platformasında geniş təcrübə:müxtəlif növlərlə minlərlə qapalı layihə ilə.
●QC hesabatının ardıcıllığının çatdırılması:keyfiyyət göstəriciləri, məlumatların dəqiqliyi və ardıcıllıq layihəsinin ümumi performansı ilə.
●Yetkin ardıcıllıq prosesi:qısa dönüş vaxtı ilə.
●Ciddi Keyfiyyətə Nəzarət: biz davamlı yüksək keyfiyyətli nəticələrin çatdırılmasına zəmanət vermək üçün ciddi QC tələblərini həyata keçiririk.
Nümunə Platformalar
| Platforma | Axın hüceyrəsi | Sıralama rejimi | Vahid | Təxmini çıxış |
| NovaSeq X | 10B (8 zolaqlı) | PE150 | Tək zolaqlı Qismən zolaq | 375 Gb / Zolaq |
| 25B (8 zolaqlı) | PE150 | Tək zolaqlı Qismən zolaq | 1000 Gb/zolaqlı | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow hüceyrəsi (2 zolaqlı) | PE250 | Axın hüceyrəsi Tək zolaqlı Qismən zolaq | 325-400 M oxunuş / Zolaq |
| S4 Axın hüceyrəsi (4 zolaqlı) | PE150 | Axın hüceyrəsi Tək zolaqlı Qismən zolaq | ~800 Gb / Zolaq |
Nümunə tələbləri
| Data Məbləği (X) | Konsentrasiya (qPCR/nM) | Həcmi | |
| Qismən zolaq sıralaması
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Zolaq ardıcıllığı | Zolaq başına | ≥ 1,5 nM / Kitabxana hovuzu | ≥ 25 μl / Kitabxana hovuzu |
Konsentrasiyaya və ümumi məbləğə əlavə olaraq, uyğun bir pik nümunəsi də tələb olunur.
Qeyd: Aşağı müxtəliflikli kitabxanaların zolağının ardıcıllığı möhkəm əsas zəngi təmin etmək üçün PhiX spike-in tələb edir.
Əvvəlcədən yığılmış kitabxanaları nümunə kimi təqdim etməyi tövsiyə edirik. Əgər BMKGENE-ə kitabxananın birləşdirilməsini həyata keçirməyi tələb edirsinizsə, lütfən baxın
qismən zolağın ardıcıllığı üçün kitabxana tələbləri.
Kitabxana ölçüsü (pik xəritə)
Əsas zirvə 300-450 bp daxilində olmalıdır.
Kitabxanaların tək əsas zirvəsi, adapterlə çirklənmə və primer dimerləri olmamalıdır.
Nümunələriniz başlanğıc material tələblərinə cavab vermirsə, bizimlə əlaqə saxlayın.
Xidmət iş axını
Kitabxana keyfiyyətinə nəzarət
Sıralama
Məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
Layihənin çatdırılması
Kitabxana QC hesabatı
Kitabxananın keyfiyyəti haqqında hesabat ardıcıllıqdan, kitabxananın miqdarını qiymətləndirmədən və parçalanmadan əvvəl təqdim olunur.
QC hesabatının ardıcıllaşdırılması
Cədvəl 1. Məlumatların ardıcıllığına dair statistik məlumatlar.
| Nümunə ID | BMKID | Raw oxuyur | Xam məlumat (bp) | Təmiz oxunuşlar (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Şəkil 1. Hər bir nümunədə oxunuşlar üzrə keyfiyyət bölgüsü
Şəkil 2. Əsas məzmunun paylanması
Şəkil 3. Məlumatların ardıcıllaşdırılmasında oxunan məzmunun paylanması
