Novo Bakterial Genom Məclisi
0 boşluqlara zəmanət verən tam bakterial genome montajlı bir xidmət təqdim edirik. Bu, Məclisin təsdiqlənməsi və səhvləri üçün Illumina ilə birlikdə Nanopore və Pacbio kimi uzun oxunan ardıcıllıq texnologiyalarının inteqrasiyası və Illumina ilə qısa oxu ardıcıllığı və ont oxunuşu düzəldilməsi üçün Illumina. Xidmətimiz, xüsusi tədqiqat məqsədlərini yerinə yetirərək montaj, funksional annotasiya və qabaqcıl bioinformatik analizdən tam bioinformatik iş axını təmin edir. Bu xidmət müxtəlif genetik və genomik tədqiqatlar üçün dəqiq istinad genomlarının inkişafına imkan verir. Bundan əlavə, süzgəc optimallaşdırılması, genetik mühəndislik və mikrob texnologiyası inkişafı kimi tətbiqlərin əsasını təşkil edir, elmi anlayış və biotexnoloji yeniliyin inkişaf etdirilməsi üçün etibarlı və boşluqsuz genomik məlumatların vacibdir.
Xidmət xüsusiyyətləri
● Genom tamlığının istədiyi dərəcədən asılı olaraq seçmək üçün iki mümkün variantla.
● Genome seçimi layihəsi: Illumina Novaseq PE150 ilə qısa oxu ardıcıllığı.
● 0 boşluğu Genomu tamamlayın.
● Nanopore Prometion 48 və ya Genom Məclisi üçün Pacbio Revio-da uzun oxu.
● Genom təsdiqlənməsi və səhv düzəldilməsi (nanopore) və ya Genome yaratmaq üçün Illumina Novaseq-da qısa oxu ardıcıllığı.
Xidmət üstünlükləri
●Sıfır boşluq Genom Zəmanətlidir: Bu, uzun oxu ardıcıllığı (nanopore və ya pacbio) ilə illumina ardıcıllığının inteqrasiyası ilə əlaqədardır.
●Tam Bioinformatika iş axını:Buraya Genom Məclisi və çoxsaylı genom elementləri, funksional gen annotasiyası və sirk süjetləri kimi genom vizual görüntüləri daxildir.
●Geniş ekspertizası: 20.000-dən çox mikroak genomu ilə BMKgene on ildən çox təcrübə, yüksək ixtisaslı analiz komandası, hərtərəfli məzmun və əla satışdan sonrakı dəstəyi gətirir.
●Satışdan sonrakı dəstək:Öhdəliklərimiz 3 aylıq satış müddəti ilə layihənin tamamlanması xaricində uzanır. Bu müddət ərzində, layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması, nəticələrlə bağlı hər hansı bir sorğuya müraciət etmək üçün Layihə təqibi, problemlərin aradan qaldırılması və Sessiyalar təklif edirik.
●Mövcud birdən çox ardıcıllıq strategiyası:Müxtəlif tədqiqat məqsədləri və genom tamlığının tələbləri üçün.
Xidmət xüsusiyyətləri
| Xidmət | Ardıcıllıq strategiyası |
| Genom layihəsi | Illumina pe150 100x |
| 0 gap Genome | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio HiFi 30x + Illumina PE150 100x (isteğe bağlı) |
Nümunə tələbləri:
| Konsentrasiya (NG / μl) | Ümumi məbləğ (μg) | Həcmi (μl) | OD260 / 280 | OD260 / 230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| İllumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bakteriya: ≥3.5x1010 mətbuat
Xidmət iş axını
Nümunə çatdırılma
Kitabxana inşası
Ardıcıllıq
Məlumat təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Aşağıdakı analiz daxildir:
● Məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
● Genom Məclisi
● Genom komponent analizi: CD və çox genom elementlərin proqnozlaşdırılması
● Çox ümumi verilənlər bazası (Go, Kegg və s.) Və qabaqcıl verilənlər bazası (kart, vfdb və s.) Olan funksional annotasiya
● Genom vizuallaşdırma
Genomu asanlıqla əldə edilə bilən FASTA formatında və Genome Annotasiya Faylında (GFF) təqdim edirik.
Gen annotasiyası - gedin
Gen annotasiyası - Cazy karbohidratlar
Genom Vizuallaşdırma - Circos Torpaq sahəsi
BMKgene'nin bakteriya genome montajı xidmətləri tərəfindən asanlaşdırılan prokraynaları araşdırın.
Dai, W. et al. (2023) 'F18-22, sağlam insan kolonundan xorasiya kolitinin müalicəsi üçün təhlükəsiz və roman bir probiotik bakteriya kimi bakteroidlərin formasıBeynəlxalq Molekulyar Elmlər Jurnalı, 24 (19), s. 14669. DOI: 10.3390 / IJMS241914669 / S1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Multidrug davamlı bir proteus mirabilis, Çində vəhşi həyatdan Blaoxa-1 və Blandm-1-i gəzdirir: ictimai sağlamlıq riski artır',İnteqrativ zooloq, 16 (6), s. 798-809. Doi: 10.1111/119-4877.12510.
Wang, tt et al. (2017) 'Endofyte Bacillus Flexus Klbmp 4941-in tam genome ardıcıllığıBiotexnologiya jurnalı, 260, s. 38-41. DOI: 10.1016 / J.Jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Klebsiella'nın birdən çox replikon müqavimət plazmələri, antimikrobiyal genlərin geniş yayılmasıMikrobiologiyada sərhədlər, 12, s. 754931. DOI: 10.3389 / FMICB.2021.754931 / Bibtex.
