Amplikon Sıralaması (16S/18S/ITS)

Illumina ilə Amplikon (16S/18S/ITS) ardıcıllığı mikrob profillərini ardıcıllıqlarına görə müəyyən etməklə və sonra hər bir nümunə daxilində və nümunələr arasında icma zənginliyini və müxtəlifliyini deşifrə etməyə cəhd etməklə mikrob müxtəlifliyini təhlil etmək üsuludur. BMKCloud Amplicon (NGS) boru kəməri 16S, 18S, ITS və çoxsaylı funksional genlərin təhlilinə imkan verir. Bu, altı müxtəlif analiz bölməsində istifadə olunan Əməliyyat Taksonomik Bölmələri (OTU) yaratmaq üçün oxunuşun kəsilməsi, cütləşdirilmiş oxu montajı və keyfiyyətin qiymətləndirilməsi ilə başlayır. Taksonomik annotasiya hər bir nümunənin nisbi bolluğu və tərkibi haqqında məlumat verir, alfa və beta müxtəliflik analizləri isə müvafiq olaraq nümunələr daxilində və nümunələr arasında mikrob müxtəlifliyinə diqqət yetirir. Qruplar arasında diferensial təhlil həm parametrik, həm də qeyri-parametrik testlərdən istifadə etməklə fərqlənən OTU-ları tapır, korrelyasiya təhlili isə bu fərqləri ətraf mühit faktorları ilə əlaqələndirir. Nəhayət, funksional gen bolluğu hər bir nümunədə funksiya və ekologiya haqqında məlumat verən marker gen bolluğuna əsasən proqnozlaşdırılır.