● Sequencing platforması: pacbio revio
● Ardıcıl rejimi: CCS (HiFi oxuyur)
● Hifi SMRT Bell Kitabxanasının hazırlanmasından əvvəl Amplicons bağlantısı ilə hədəf bölgənin gücləndirilməsi
●Ali taksonomik həlli: than qısa-amplicon ardıcıllıqla,Növlər səviyyəsində daha yüksək OTU təsnifat dərəcələrini aktivləşdirmək.
●Yüksək dəqiqlikli baza zəng edir: Pacbio CCS rejimi ardıcıllığı (HiFi oxuyur).
●Təcrid: Ətraflı nümunələrdə mikrob kompozisiyanın sürətli identifikasiyası.
●Geniş tətbiq olunur: Müxtəlif mikrob icma tədqiqatları.
●Hərtərəfli bioinformatik analiz: Ən son Qiime2 paketi (mikrobial ekologiyanı mikrob ekologiyası), məlumat bazası, annotasiya, utu / asv baxımından müxtəlif analizlər ilə.
●Geniş ekspertizası: Hər il də minlərlə amplicon ardıcıllıq layihələri ilə BMKgene on illik təcrübə, yüksək ixtisaslı analiz komandası, hərtərəfli məzmun və əla satışdan sonrakı dəstəyi gətirir.
Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur |
Amplicon | Pacbio revio | 10/30/50 K Teqlər (CCS) |
Konsentrasiya (NG / μl) | Ümumi məbləğ (μg) | Həcmi (μl) |
≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
Nümunələri 3-4 saat ərzində maye azotda dondurun və maye azot və ya -80 dərəcədə uzunmüddətli rezervasyona qədər saxlayın. Quru buz ilə nümunə göndərmə tələb olunur.
Aşağıdakı analiz daxildir:
● Xam məlumatların keyfiyyətinə nəzarət
● Otu çoxluq / səs-küy (asv)
● Otu annotasiyası
● Alpha Diversity Təhlili: Şennon, Simpson və Ace də daxil olmaqla birdən çox indekslər.
● BETA müxtəlifliyi təhlili
● Qruplararası analiz
● Korrelyasiya təhlili: ekoloji amillər və tərkibi və müxtəlifliyi arasında
● 16S funksional gen proqnozu
Taksonomik paylamasının histoqramı
İcma paylanması filogenetik ağac
Alpha Diversity Təhlili: Ace
BETA müxtəlifliyi təhlili: PCOA
İntergroup analizi: Anova
BMKgene'nin Amplicon'un ardıcıllıqla hazırlanmış nəşrlər toplusu vasitəsilə Pacbio ilə Amplicon ardıcıllıqla kömək etdiyi irəliləyişləri araşdırın.
GAO, X. və Wang, H. (2023) 'Alaşın Merino qoyunlarında fərqli fenologiyaya (Regreen vs otlu qoyunlara) uyğunlaşdırıcı analiz və funksiyaların müqayisəli təhlili, alp çəmənliyi üzərində iki artım, 9 ( 1), s. 16. Doi: 10.3390 / fermentation9010016 / S1.
Li, S. et al. (2023). DOI: 10.1038 / S41522-023-00439-8.
Mu, l. et al. (2022) 'Yağ turşusu duzlarının fermentasiya xüsusiyyətləri, bakterial müxtəlifliyi və qarışıq silosun aerobik sabitliyi, yonca saman və buğda bran', Qida və Kənd Təsərrüfatı Elmləri Jurnalı, 102 (4), PP. 1475- 1487. DOI: 10.1002 / JSFA.11482.
Yang, J. et al. (2023). Yetkin zebrafişdəki okazoston bağırsaq oksidləşdirici stressdə, antioksidanlar 2023, cild. 12, səhifə 192, 12 (1), s. 192. DOI: 10.3390 / Antiox12010192.