16S / 18s / onun amplicon ardıcıllıqla-NGS
Xidmət xüsusiyyətləri
● Sıra platforması: Illumina Novaseq.
● Digər gücləndirmə hədəfləri arasında 16-cı, 18 və onun qısa bölgələrinin gücləndirilməsi.
● ampliconun çevik seçimləri.
● Birdən çox gücləndirici hədəfləri olan əvvəlki layihə təcrübəsi.
Xidmət üstünlükləri
●İzolyasiya pulsuz:Ekoloji nümunələrdə mikrob kompozisiyanın sürətli identifikasiyası.
●Yüksək qətnamə: Ətraf mühit nümunələrinin az bolluğunda.
●Geniş tətbiq olunur: Müxtəlif mikrob icma tədqiqatları.
●Hərtərəfli bioinformatik analiz: Ən son Qiime2 paketi (mikrobial ekologiyanı mikrob ekologiyası), məlumat bazası, annotasiya, utu / asv baxımından müxtəlif analizlər ilə.
●Geniş ekspertizası: Hər il 150 min amplicon ardıcıllıq layihəsi ilə, BMKgene on illik təcrübə, yüksək ixtisaslı analiz qrupu, hərtərəfli məzmun və əla satışdan sonrakı dəstəyi gətirir.
Xidmət xüsusiyyətləri
| Kitabxana | Ardıcıllıq strategiyası | Məlumat tövsiyə olunur |
| Amplicon | Illumina pe250 | 50/100 / 300K Tags (cüt oxu) |
Xidmət tələbləri
| Konsentrasiya (NG / μl) | Ümumi məbləğ (NG) | Həcmi (μl) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Torpaq / çamur: 1-2G
● Bağırsaq məzmunu-heyvan: 0.5-2G
● Bağırsaq məzmunu-böcək: 0,1-0.25g
● Bitki səthi (zənginləşdirilmiş çöküntü): 0,1-0.5g
● Fermentasiya bulyonu zənginləşdirilmiş çöküntü): 0,1-0.5g
● Nəcis (böyük heyvanlar): 0,5-2G
● Nəcis (siçan): 3-5 qoz
● Pulmoner Alveolyar Lavage Maye: Kağız Filtri
● vaginal swab: 5-6 swabs
● Dəri / Genital Swab / Tüpürcək / Şifahi Yumşaq Toxuma / Faringeal Swab / Rektal Swab: 2-3 Swabs
● Səthi mikroorqanizmlər: filtr kağızı
● Su və hava / biofilm: filtr kağızı
● Endofitlər: 1-2G
● Diş lövhəsi: 0.5-1g
Xidmət iş axını
Nümunə çatdırılma
Kitabxana inşası
Ardıcıllıq
Məlumat təhlili
Satış sonrası xidmətlər
Aşağıdakı analiz daxildir:
- Xam məlumat keyfiyyətinə nəzarət
- OTU Qruplama / Səs-küy (ASV)
- Otu annotasiyası
- Alpha Diversity Təhlili: Şennon, Simpson və Ace də daxil olmaqla birdən çox indekslər.
- BETA müxtəlifliyi təhlili
- Qruplararası analiz
- Korrelyasiya təhlili: Ətraf mühiti amilləri və tərkibi və müxtəlifliyi arasında
- 16S funksional gen proqnozu
Taksonomik paylamasının histoqramı
Taxonomik bolluq klasterləşdirmə istilik xəritəsi
Alpha Diversity Təhlili: Yağışlama əyri
BETA müxtəlifliyi təhlili: NMDS
İntergroup analizi: Lefse Biomarker Kəşf
BMKGene'nin Amplicon'un ardından istifadə edilən irəliləyişləri araşdırın.
Dong, C. et al. (2022) 'Məclis, Əsas Mikrobiota və Rizosfer Torpaq və Bark Mikrobiota funksiyası, eucombia ulmoides', mikrobiologiyada sərhədlər, 13. Doi: 10.3389 / FMICB.20222.855317 / Tamamilə.
Li, y. et al. (2023) 'Sintnerella vajinalis'in müalicəsi üçün sintetik bakteriya konsorsia nəqli, siçanlarda, mikrobiome, 11 (1), s. 1-14. DOI: 10.1186 / S40168-023-01497-Y
Yang, J., Fu, Y. və Liu, H. (2022) 'Hava Tozunun mikrobiomları Torpaq əsaslı Bioregenerativ Həyat Dəstəyi Təcrübəsi "Ayar Panace 365"', Ətraf Mühit Mikrobiçiləri, 17 (1), PP. 1-20. Doi: 10.1186 / S40793-022-00399-0 / rəqəmlər / 8.
Yin, S. et al. (2022) 'Bioresource Technology, 361, s. 127678. DOI: 10.1016 / J.BIIORTH.2022.127678.
