تسلسل ثنائي كبريتات الجينوم الكامل (WGBS)
يُعد تسلسل ثنائي كبريتيت الجينوم الكامل (WGBS) المنهجية المعيارية الذهبية للاستكشاف المتعمق لمثيلة الحمض النووي، وتحديدًا المركز الخامس في السيتوزين (5-mC)، وهو منظم محوري للتعبير الجيني والنشاط الخلوي. يتضمن المبدأ الأساسي لـ WGBS معالجة ثنائي الكبريتيت، مما يؤدي إلى تحويل السيتوزينات غير الميثيلية إلى اليوراسيل (C إلى U)، مع ترك السيتوزينات الميثلية دون تغيير. توفر هذه التقنية دقة أحادية القاعدة، مما يسمح للباحثين بإجراء تحقيق شامل في الميثيلوم والكشف عن أنماط المثيلة غير الطبيعية المرتبطة بحالات مختلفة، ولا سيما السرطان. من خلال استخدام WGBS، يمكن للعلماء الحصول على رؤى لا مثيل لها في المناظر الطبيعية للمثيلة على نطاق الجينوم، مما يوفر فهمًا دقيقًا للآليات اللاجينية التي تكمن وراء العمليات والأمراض البيولوجية المتنوعة.
مميزات الخدمة
● يتطلب الجينوم المرجعي.
● تمت إضافة Lambda DNA لمراقبة كفاءة تحويل البيكبريتيت.
● التسلسل على Illumina NovaSeq.
مزايا الخدمة
●المعيار الذهبي لأبحاث مثيلة الحمض النووي: تتميز تقنية معالجة تحويل المثيلة الناضجة بدقة عالية وإمكانية تكرار نتائج جيدة.
●تغطية واسعة ودقة أحادية القاعدة:الكشف عن مواقع المثيلة على مستوى الجينوم.
●منصة كاملة:تقديم خدمة ممتازة شاملة بدءًا من معالجة العينات وإنشاء المكتبات والتسلسل وحتى تحليل المعلوماتية الحيوية.
●خبرة واسعة: مع إكمال مشاريع تسلسل WGBS بنجاح عبر مجموعة متنوعة من الأنواع، تتمتع BMKGENE بأكثر من عقد من الخبرة، وفريق تحليل ذو مهارات عالية، ومحتوى شامل، ودعم ممتاز لما بعد البيع.
●إمكانية الانضمام إلى تحليل النسخ: السماح بالتحليل المتكامل لـ WGBS مع بيانات omics الأخرى مثل RNA-seq.
مواصفات العينة
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | إخراج البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| معالجة بالبيسولفيت | الومينا PE150 | عمق 30x | Q30 ≥ 85% تحويل ثنائي الكبريتيت > 99% |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميليلتر) | المبلغ الإجمالي (ميكروغرام) | متطلبات إضافية | |
| الحمض النووي الجينومي | ≥ 5 | ≥ 400 نانوغرام | تدهور أو تلوث محدود |
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
تسليم البيانات
يتضمن التحليل التالي:
● مراقبة جودة التسلسل الأولي؛
● رسم الخرائط للجينوم المرجعي؛
● الكشف عن قواعد ميثليته 5mC؛
● تحليل توزيع المثيلة والشروح.
● تحليل المناطق الميثيلية التفاضلية (DMRs)؛
● الشرح الوظيفي للجينات المرتبطة DMRs.
الكشف عن مثيلة 5mC: أنواع المواقع الميثيلية
خريطة الميثيل. 5mC توزيع مثيلة الجينوم على نطاق واسع
شرح للمناطق شديدة الميثيل
مناطق ميثيلية تفاضلية: الجينات المرتبطة بها
مناطق ميثيلية تفاضلية: شرح للجينات المرتبطة (علم الجينات)
استكشف التطورات البحثية التي سهلتها خدمات تسلسل ثنائي كبريتيت الجينوم الكاملة من BMKGene من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
فان، Y. وآخرون. (2020) "تحليل ملامح مثيلة الحمض النووي أثناء نمو العضلات الهيكلية للأغنام باستخدام تسلسل ثنائي كبريتيت الجينوم الكامل"،علم الجينوم BMC، 21(1)، ص 1-15. دوى: 10.1186/S12864-020-6751-5.
تشاو، X. وآخرون. (2022) "اضطرابات مثيلة الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين الجديدة لدى العمال المعرضين لكلوريد الفينيل"،علم السموم والصحة الصناعية، 38(7)، ص 377-388. دوى: 10.1177/07482337221098600
زو، J. وآخرون. (2020) "العلاقات بين مثيلة الجينوم، ومستويات الحمض النووي الريبي (RNA) غير المشفر، والحمض الريبي النووي المرسال (mRNA) والمستقلبات في نضج ثمار الطماطم"،مجلة النبات، 103(3)، الصفحات من 980 إلى 994. دوى: 10.1111/TPJ.14778.
