تسلسل شظية مضخم محدد (SLAF-SEQ)
سير العمل
المخطط الفني
ميزات الخدمة
● التسلسل على نوفاسيك مع PE150.
● تحضير المكتبة مع باركود مزدوج ، مما يتيح تجميع أكثر من 1000 عينة.
● يمكن استخدام هذه التقنية مع أو بدون جينوم مرجعي ، مع خطوط أنابيب حيوية مختلفة لكل حالة:
مع الجينوم المرجعي: SNP و Indel Discovery
بدون جينوم مرجعي: تجميع العينة واكتشاف SNP
● فيفي السيليكويتم فحص مجموعات إنزيم التقييد المتعددة قبل التصميم للعثور على تلك التي تولد توزيعًا موحدًا لعلامات SLAF على طول الجينوم.
● أثناء التجريبية المسبقة ، يتم اختبار ثلاث مجموعات إنزيم في 3 عينات لإنشاء 9 مكتبات SLAF ، وهذه المعلومات تستخدم لاختيار مجموعة إنزيم التقييد المثلى للمشروع.
مزايا الخدمة
●اكتشاف العلامة الجينية العالية: يتيح دمج نظام الباركود المزدوج ذو الإنتاجية العالية التسلسل المتزامن للسكان الكبار ، والتضخيم الخاص بالموضع يعزز الكفاءة ، مما يضمن أن أرقام العلامات تلبي المتطلبات المتنوعة لأسئلة البحث المختلفة.
● انخفاض الاعتماد على الجينوم: يمكن تطبيقه على الأنواع مع أو بدون جينوم مرجعي.
●تصميم مخطط مرن: يمكن اختيار الإنزيم الفردي ، والإنزيم المزدوج ، والهضم متعدد الأنزيم ، وأنواع مختلفة من الإنزيمات لتلبية أهداف أو أنواع البحث المختلفة. الفي السيليكويتم التصميم المسبق لضمان تصميم الإنزيم الأمثل.
● كفاءة عالية في الهضم الأنزيمي: توصيلفي السيليكوأكد التصميم قبل التصميم والتصميم الأمثل قبل توزيع علامات SLAF على الكروموسوم (1 SLAF TAG/4KB) وتسلسل متكرر مخفض (<5 ٪).
●خبرة واسعة: يجلب فريقنا ثروة من الخبرة في كل مشروع ، مع سجل حافل من إغلاق أكثر من 5000 مشروع SLAF-SEQ على مئات الأنواع ، بما في ذلك النباتات والثدييات والطيور والحشرات والكائنات المائية.
● سير العمل الحيوي المتطور ذاتيا: طور Bmkgene سير عمل متكامل للمعلومات الحيوية لـ SLAF-Seq لضمان موثوقية ودقة الناتج النهائي.
مواصفات الخدمة
| نوع التحليل | مقياس السكان الموصى به | استراتيجية التسلسل | |
| عمق تسلسل العلامة | رقم العلامة | ||
| الخرائط الوراثية | 2 والدين و 150 ذرية | الآباء: 20x WGS Offsping: 10x | حجم الجينوم: <400 ميغابايت: يوصى به WGS <1 جيجا بايت: 100 كيلو العلامات 1-2 جيجابايت :: 200k العلامات > 2 جيجابايت: 300k العلامات الحد الأقصى 500K العلامات |
| دراسات الارتباط على نطاق الجينوم (GWAS) | ≥200 عينات | 10x | |
| التطور الوراثي | ≥30 عينات ، مع> 10 عينات من كل مجموعة فرعية | 10x | |
متطلبات الخدمة
التركيز ≥ 5 نانوغرام/ميكرولتر
إجمالي المبلغ ≥ 80 نانوغرام
Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5
جل الاغاروز: لا أو تحلل أو تلوث محدود
توصيل العينة الموصى به
الحاوية: أنبوب الطرد المركزي 2 مل
(بالنسبة لمعظم العينات ، نوصي بعدم الحفاظ على الإيثانول)
عينة العلامات: يجب أن تكون العينات موضحة ومتطابقة بشكل واضح لنموذج معلومات العينة المقدمة.
الشحنة: الجليد الجاف: يجب أن تكون العينات معبأة في أكياس أولاً ودُفن في الجليد الجاف.
سير عمل الخدمة
عينة QC
تجربة تجريبية
Slaf-Experiment
تحضير المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يشمل التحليل التالي:
- تسلسل البيانات QC
- تطوير علامة SLAF
رسم الخرائط للإشارة إلى الجينوم
بدون جينوم مرجعي: التجميع
- تحليل علامات SLAF: الإحصائيات ، التوزيع عبر الجينوم
- اكتشاف العلامة: SNP ، indel ، SNV ، CV وشرح التعليقات التوضيحية
توزيع علامات SLAF على الكروموسومات:
توزيع SNPs على الكروموسومات:
التعليق التوضيحي SNP
| سنة | مجلة | IF | عنوان | التطبيقات |
| 2022 | اتصالات الطبيعة | 17.694 | الأساس الجيني للكروموسومات Giga و Giga genome من الفاوانيا الشجرة بايونيا أوستي | Slaf-gwas |
| 2015 | أخصائي نباتي جديد | 7.433 | أقدام المتدينات مرساة المناطق الجينية ذات الأهمية الزراعية في فول الصويا | Slaf-gwas |
| 2022 | مجلة الأبحاث المتقدمة | 12.822 | التعهدات الاصطناعية على نطاق الجينوم من Gossypium Barbadense في G. hirsutum تكشف عن مواقع متفوقة للتحسين المتزامن لجودة ألياف القطن والعائد سمات | علم الوراثة السلفي التطوري |
| 2019 | النبات الجزيئي | 10.81 | يكشف التحليل الجيني للسكان وجمعية دي نوفو عن أصل الأعشاب الأرز كلاعب تطوري | علم الوراثة السلفي التطوري |
| 2019 | علم الوراثة الطبيعة | 31.616 | تسلسل الجينوم والتنوع الوراثي للكارب المشترك ، Cyprinus carpio | خريطة Slaf-Linkage |
| 2014 | علم الوراثة الطبيعة | 25.455 | يوفر جينوم الفول السوداني المزروع نظرة ثاقبة على الأنماط النووية للبقوليات ، polyploid التطور وتدجين المحاصيل. | خريطة Slaf-Linkage |
| 2022 | مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية | 9.803 | يكشف تحديد ST1 عن اختيار ينطوي على تشويش مورفولوجيا البذور ومحتوى الزيت أثناء تدجين فول الصويا | تنمية العلامات السلفية |
| 2022 | المجلة الدولية للعلوم الجزيئية | 6.208 | تحديد هوية وعلامة الحمض النووي لقمح القمح Mollis 2ns (2D) استبدال الكروموسوم الأزياء | تنمية العلامات السلفية |
| سنة | مجلة | IF | عنوان | التطبيقات |
| 2023 | الحدود في علوم النبات | 6.735 | رسم خرائط QTL وتحليل النص لمحتوى السكر أثناء نضج الفاكهة من Pyrus Pyrifolia | الخريطة الوراثية |
| 2022 | مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية | 8.154 | يكشف تحديد ST1 عن اختيار يتضمن تورطًا لمورفولوجيا البذور ومحتوى الزيت أثناء تدجين فول الصويا
| استدعاء SNP |
| 2022 | الحدود في علوم النبات | 6.623 | ارتباط الجينوم على نطاق الجينوم بالكاد الأنماط الظاهرية في بيئة الجفاف.
| GWAS |
