تقليل تمثيل تسلسل بيسلفيت (RRBS)
برز تقليل التسلسل Bisulfite (RRBs) كبديل فعال وفعال من حيث التكلفة لتسلسل Bisulfite الكامل (WGBS) في أبحاث مثيلة الحمض النووي. بينما توفر WGBS رؤى شاملة من خلال فحص الجينوم بأكمله بدقة قاعدة واحدة ، يمكن أن تكون تكلفته العالية عاملاً محددًا. RRBs يخفف بشكل استراتيجي من هذا التحدي من خلال تحليل جزء تمثيلي من الجينوم بشكل انتقائي. تعتمد هذه المنهجية على إثراء المناطق الغنية بجزيرة CPG بواسطة انشقاق MSPI تليها اختيار حجم شظايا 200-500/600 نقطة أساس. وبالتالي ، يتم تسلسل المناطق القريبة فقط من جزر CPG ، بينما يتم استبعاد تلك التي لديها جزر CPG البعيدة من التحليل. تتيح هذه العملية ، إلى جانب تسلسل البيسولفيت ، الكشف عالي الدقة لمثيلة الحمض النووي ، وتركز نهج التسلسل ، PE150 ، على وجه التحديد على نهايات الإدراج بدلاً من الوسط ، مما يزيد من كفاءة التنسيق في الميثيل. RRBS هي أداة لا تقدر بثمن تتيح أبحاث مثيلة الحمض النووي الفعالة من حيث التكلفة والتقدم في معرفة الآليات اللاجينية.
ميزات الخدمة
● يتطلب جينوم مرجعي.
● يستخدم DNA Lambda لمراقبة كفاءة تحويل Bisulfite.
● تتم مراقبة كفاءة هضم MSPI أيضًا.
● هضم إنزيم مزدوج لعينات النبات.
● التسلسل على Illumina Novaseq.
مزايا الخدمة
●بديل فعال من حيث التكلفة وفعال لـ WGBS: تمكين التحليل يتم تنفيذها بتكلفة أقل ومع متطلبات العينة المنخفضة.
●منصة كاملة:توفير خدمة ممتازة واحدة من معالجة العينات ، وبناء المكتبات ، والتسلسل إلى تحليل المعلوماتية الحيوية.
●خبرة واسعة: مع الانتهاء من مشاريع تسلسل RRBS بنجاح عبر مجموعة متنوعة من الأنواع ، يجلب BMKGene أكثر من عقد من الخبرة ، وفريق تحليل ذي مهارة عالية ، ومحتوى شامل ، ودعم ممتاز بعد البيع.
مواصفات الخدمة
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | إخراج البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| مكتبة MSPI ومكتبة Bisulfite المعالجة | Illumina PE150 | 8 غيغابايت | Q30 ≥ 85 ٪ تحويل Bisulfite> 99 ٪ كفاءة خفض MSPI> 95 ٪ |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميكرولتر) | المبلغ الإجمالي (ميكروغرام) |
| |
| الحمض النووي الجيني | ≥ 30 | ≥ 1 | تدهور أو تلوث محدود |
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يشمل التحليل التالي:
● مراقبة جودة التسلسل الخام ؛
● رسم الخرائط للإشارة إلى الجينوم ؛
● الكشف عن قواعد ميثيل 5 مللي ثانية وتحديد العزر ؛
● تحليل توزيع المثيلة ومقارنة العينة ؛
● تحليل المناطق الميثيل التفاضلية (DMRs) ؛
● التعليق التوضيحي الوظيفي للجينات المرتبطة بـ DMRs.
مراقبة الجودة: كفاءة الهضم (في رسم خرائط الجينوم)
مراقبة الجودة: تحويل بيسلفيت (في استخراج معلومات المثيلة)
خريطة الميثيل: توزيع على نطاق الجينوم 5MC
مقارنة العينة: تحليل المكون الرئيسي
تحليل المناطق الميثيل التفاضلية (DMRS): خريطة الحرارة
استكشف التطورات البحثية التي تسهلها خدمات تسلسل Bmkgene بأكملها من خلال مجموعة من المنشورات المنسقة.
لي ، ز. وآخرون. (2022) "إعادة برمجة العالية إلى خلايا تشبه ليديج عن طريق تنشيط كريسبر وعوامل الباراكرين" ،PNAS Nexus، 1 (4). doi: 10.1093/pnasnexus/pgac179.
تيان ، هـ. وآخرون. (2023) "تحليل مثيلة الحمض النووي على نطاق الجينوم لتكوين الجسم في التوائم أحادية الزيجوت الصينية" ،المجلة الأوروبية للتحقيق السريري، 53 (11) ، ص. E14055. doi: 10.1111/eci.14055.
وو ، ي. وآخرون. (2022) "مثيلة الحمض النووي ونسبة الخصر إلى الورك: دراسة ارتباط على نطاق واسع في التوائم أحادية الزيجوت الصينية" ،مجلة التحقيق الغدد الصماء، 45 (12) ، ص. 2365-2376. doi: 10.1007/s40618-022-01878-4.
