تسلسل الحمض النووي الريبي بدائية النواة
سمات
● معالجة عينة الحمض النووي الريبي تنطوي على استنفاد الرنا الريباسي متبوعًا بإعداد مكتبة RNA الاتجاهي.
● تحليل المعلوماتية الحيوية على أساس التوافق مع الجينوم المرجعي
● يشمل التحليل التعبير الجيني و DEGs ولكن أيضًا بنية النص وتحليل الحمض النووي الريبي
مزايا الخدمة
●مراقبة جودة صارمة: نقوم بتنفيذ نقاط التحكم الأساسية في جميع المراحل ، من إعداد العينة والمكتبة إلى التسلسل والمعلوماتية الحيوية. تضمن هذه المراقبة الدقيقة تقديم نتائج عالية الجودة باستمرار.
●بيانات التسلسل الخاصة بالحبال: بسبب إعداد مكتبة الحمض النووي الريبي ، يكون الاتجاه ، مما يتيح تحديد النصوص المضادة للرسائل.
●تحليل كامل مصمم للنسخ بدائية النواة: لا يتضمن خط أنابيب المعلومات الحيوية تحليل التعبير الجيني فحسب ، بل يتضمن أيضًا تحليل بنية النص ، بما في ذلك تحديد الأوبرا ، UTRS والمروجين. ويشمل أيضًا تحليل SRNAs ، وهي التعليقات التوضيحية والتنبؤ بالهيكل الثانوي والأهداف.
●دعم ما بعد البيع: يمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من إكمال المشروع مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة 3 أشهر. خلال هذا الوقت ، نقدم متابعة المشروع ، واستكشاف الأخطاء وإصلاحها ، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
عينة المتطلبات والتسليم
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| مكتبة الاتجاه المنضب الرنا الريباسي | Illumina PE150 | 1-2 جيجابايت | Q30≥85 ٪ |
متطلبات العينة:
| كونك. (نانوغرام/ميكرولتر) | كمية (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
| ≥ 50 | ≥ 1 | OD260/280 = 1.8-2.0 OD260/230 = 1.0-2.5 تلوث بروتين محدود أو بدون حمض الحمض النووي يظهر على هلام. | RIN≥6.5 |
توصيل العينة الموصى به
الحاوية: أنبوب الطرد المركزي 2 مل (لا ينصح برقائق القصدير)
عينة العلامات: المجموعة+النسخ المتماثل على سبيل المثال A1 ، A2 ، A3 ؛ B1 ، B2 ، B3.
شحنة:
1. الجليد الجاف: يجب أن تكون العينات معبأة في أكياس ودفن في الجليد الجاف.
2. أنابيب Rnastable: يمكن تجفيف عينات الحمض النووي الريبي في أنبوب تثبيت الحمض النووي الريبي (مثل Rnastable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
سير العمل التحليل الحيوي
يشمل التحليل التالي:
● مراقبة جودة البيانات الخام
● التوافق مع الجينوم المرجعي
● تقييم جودة المكتبة: العشوائية تجزئة الحمض النووي الريبي ، حجم الإدراج وتشبع التسلسل
● التعليق التوضيحي الوظيفي لجينات الترميز المتوقعة
● تحليل التعبير: الارتباط وتحليل المكون الرئيسي (PCA)
● التعبير الجيني التفاضلي (DEGS)
● التعليق التوضيحي الوظيفي وإثراء DEGs
● تحليل الحمض النووي الريبي: التنبؤ ، التعليق التوضيحي ، الهدف ، والتنبؤ بالهيكل الثانوي
● تحليل هيكل النص: الأوبرا ، وظائف البدء والنهاية ، والمنطقة غير المترجمة (UTS) ، والمروج ، وتحليل SNP/Indel
تسلسل التشبع
التعليق التوضيحي الوظيفي لجينات الترميز
العلاقة بين العينات
تحليل الجينات المعبأة التفاضلية (DEGS)
تحليل الإثراء الوظيفي
التعليق التوضيحي للرنا
استكشف التطورات التي تسهلها خدمات تسلسل MRNA الكاملة الطول في BMKGENE في هذا المنشور المميز.
Guan ، CP et al. (2018) "تغييرات النسخ العالمية للمكورات العنقودية المكونة للمكورات البيولوجية التي تستجيب لقلويدات إجمالية من ثعلبة Sophorea" ،المجلة البولندية لعلم الأحياء الدقيقة، 67 (2) ، ص. 223. DOI: 10.21307/PJM-2018-024.
