خريطة الحرارة
تقبل أداة HeatMap ملف بيانات المصفوفة كمدخل وتتيح للمستخدمين تصفية البيانات وتطبيعها وتجميعها. حالة الاستخدام الأساسي لخرائط الحرارة هي تحليل الكتلة لمستوى التعبير الجيني بين العينات المختلفة.
تعليق الجينات
تؤدي أداة التعليقات التوضيحية للجينات إلى توضيح الجينات بناءً على محاذاة تسلسل ملفات Fasta الإدخال مقابل قواعد البيانات المختلفة.
أداة البحث المحلية الأساسية (Blast)
أداة Blast هي إصدار متكامل لـ BMKCloud من NCBI Blast ويمكن استخدامه لأداء نفس الوظائف باستخدام البيانات التي تم تحميلها إلى حساب BMKCloud.
التنبؤ CDS_UTR
تم تصميم أداة التنبؤ CDS_UTR للتنبؤ مناطق الترميز (CDS) والمناطق غير الترميز (UTR) في تسلسلات النص المعطى بناءً على نتائج الانفجار مقابل قواعد بيانات البروتين المعروفة ونتائج التنبؤ ORF.
مؤامرة مانهاتن
تتيح أداة مؤامرة مانهاتن عرض تجارب عينة عالية وتستخدم عادة في دراسات الارتباط على نطاق الجينوم (GWAS).
مخطط السيرك
توفر أداة مخطط Circos تصورًا فعالًا لكيفية توزيع الميزة الجينومية عبر الجينوم. تشمل الميزات الشائعة المواقع الكمية ، SNPs ، Indels ، المتغيرات الهيكلية والنسخ.
علم الجينات (GO) إثراء
توفر أداة إثراء GO تحليلًا وظيفيًا للإثراء. البرنامج الأساسي في هذه الأداة هو حزمة Topgo-Bioconductor ، والتي تتضمن تحليل التعبير التفاضلي ، وتحليل إثراء GO وتصور النتائج.
تحليل شبكة التعبير الجيني المرجحة (WGCNA)
WGCNA هي طريقة استخراج البيانات المستخدمة على نطاق واسع لاكتشاف وحدات التعبير الجيني. ينطبق على مجموعة بيانات التعبير المختلفة بما في ذلك بيانات التعبير الجيني للميكروأري و NGS.
Interproscan
توفر أداة Interproscan تحليل وتصنيف البروتين بين البروتين.
اذهب إلى إثراء Kegg
أداة إثراء Go Kegg هي التصميم لإنشاء رسم بياني للإثراء GO ، ورسم كيف إثراء KEGG ومسار إثراء KEGG استنادًا إلى مجموعة الجينات المقدمة والتعليقات التوضيحية المقابلة.