
Pacbio transcriptome كامل الطول
يتيح تسلسل Pacbio كامل الطول ، ISOSEQ ، تحديدًا دقيقًا للإسويات الإسوية النصية ، وإلقاء الضوء على polyadenylation البديل والربط ، مما يؤدي إلى تحليل تعبير جيني أكثر دقة. تم تصميم خط أنابيب BMKCloud Pacbio كامل الطول لتحليل مكتبات [كدنا] في وضع تسلسل الإجماع الدائري (CCS) ويحدد تسلسلات غير محملة (FLNC) كاملة الطول ، والتي يتم تجميعها بعد ذلك في محلات غير مبدئية. يقوم تحليل BUSCO اللاحق بتقييم اكتمال مجموعة النسخ. من النصوص المجمعة ، يتم إجراء تحليلات متعددة: الربط البديل ، تكرار التسلسل البسيط (SSR) ، التنبؤ بـ LNCRNA والجينات المستهدفة المقابلة ، التنبؤ بالجينات الجديدة ، تحليل عائلة الجينات ، تحليل عامل النسخ ، والتعليق الوظيفي للنسخ.
المعلوماتية الحيوية
