● التقاط بولي مرنا قبل إعداد المكتبة
● مستقل عن أي جينوم مرجعي: استنادًا إلى التجميع الجديد للنصوص، وإنشاء قائمة من الجينات غير الموضحة بقواعد بيانات متعددة (NR، Swiss-Prot، COG، KOG، eggNOG، Pfam، GO، KEGG)
● تحليل شامل للمعلومات الحيوية للتعبير الجيني وبنية النص
●خبرة واسعة: مع سجل حافل في معالجة أكثر من 600000 عينة في BMKGENE، والتي تشمل أنواعًا متنوعة من العينات مثل مزارع الخلايا والأنسجة وسوائل الجسم، يجلب فريقنا ثروة من الخبرة لكل مشروع. لقد نجحنا في إغلاق أكثر من 100000 مشروع mRNA-Seq في مجالات بحثية مختلفة.
●مراقبة الجودة الصارمة: نقوم بتنفيذ نقاط التحكم الأساسية في جميع المراحل، بدءًا من إعداد العينات والمكتبة وحتى التسلسل والمعلوماتية الحيوية. تضمن هذه المراقبة الدقيقة تقديم نتائج عالية الجودة باستمرار.
● شرح شامل: نحن نستخدم قواعد بيانات متعددة لتعليق الجينات المعبر عنها تفاضليًا (DEGs) وظيفيًا وإجراء تحليل التخصيب المقابل، مما يوفر نظرة ثاقبة حول العمليات الخلوية والجزيئية الكامنة وراء استجابة النسخ.
●دعم ما بعد البيع: يمتد التزامنا إلى ما بعد إكمال المشروع بفترة خدمة ما بعد البيع مدتها 3 أشهر. خلال هذا الوقت، نقدم متابعة المشروع، والمساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
بولي المخصب | الومينا PE150 DNBSEQ-T7 | 6-10 جيجابايت | Q30≥85% |
النيوكليوتيدات:
Conc. (نانوغرام / ميكرولتر) | المبلغ (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 يظهر تلوث محدود أو معدوم بالبروتين أو الحمض النووي على الجل. | للنباتات: RIN≥4.0؛ للحيوانات: RIN≥4.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0؛ ارتفاع خط الأساس محدود أو معدوم |
● النباتات:
الجذر أو الجذع أو البتلة: 450 ملغ
الأوراق أو البذور: 300 ملغ
الفاكهة: 1.2 جرام
● الحيوان:
القلب أو الأمعاء: 300 ملغ
الأحشاء أو الدماغ: 240 ملغ
العضلات: 450 ملغ
العظام والشعر والجلد: 1 جرام
● المفصليات:
الحشرات: 6 جرام
القشريات: 300 ملغ
● الدم الكامل: 1 أنبوب
● الخلايا: 106 الخلايا
الحاوية: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل (لا ينصح باستخدام ورق القصدير)
وضع العلامات على العينات: المجموعة + النسخ المتماثل، على سبيل المثال A1، A2، A3؛ ب1، ب2، ب3.
شحنة:
1. الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس ودفنها في الثلج الجاف.
2. أنابيب RNAstable: يمكن تجفيف عينات RNA في أنبوب تثبيت RNA (مثل RNAstable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
المعلوماتية الحيوية
تجميع النسخ واختيار unigene
شرح Unigene
عينة الارتباط وتقييم التكرارات البيولوجية
الجينات المعبر عنها تفاضليًا (DEGs)
الشرح الوظيفي للDEGs
الإثراء الوظيفي للDEGs
اكتشف التطورات التي سهلتها خدمات تسلسل NGS mRNA حقيقية النواة من BMKGene من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
شين، F. وآخرون. (2020) "تجميع نسخة دي نوفو والتعبير الجيني المتحيز جنسيًا في الغدد التناسلية لسمك السلور آمور (Silurus asotus)"، علم الجينوم، 112(3)، الصفحات من 2603 إلى 2614. دوى: 10.1016/J.YGENO.2020.01.026.
تشانغ، C. وآخرون. (2016) "تحليل النسخ لاستقلاب السكروز أثناء تورم البصلة وتطورها في البصل (Allium cepa L.)"، الحدود في علوم النبات، 7 (سبتمبر)، ص. 212763. دوى: 10.3389/FPLS.2016.01425/BIBTEX.
تشو، C. وآخرون. (2017) "تجميع De novo، والتوصيف والتعليق التوضيحي لنسخة Sarcocheilichthys sinensis"، PLoS ONE، 12(2). دوى: 10.1371/JOURNAL.PONE.0171966.
زو، L. وآخرون. (2021) "يوفر تحليل النسخ دي نوفو نظرة ثاقبة على تحمل الملح في Podocarpus macrophyllus تحت ضغط الملوحة"، BMC Plant Biology، 21(1)، الصفحات من 1 إلى 17. دوى: 10.1186/S12870-021-03274-1/FIGURES/9.