mRNA-seq (NGS) – من جديد

يسمح تسلسل mRNA بتنميط جميع نصوص mRNA في الخلايا في ظل ظروف محددة وهي تقنية مستخدمة على نطاق واسع في مجالات بحثية مختلفة. تم تصميم خط أنابيب BMKCloud De novo mRNA-seq لتحليل مكتبات التسلسل المخصب poly-A عند عدم توفر جينوم مرجعي. يبدأ خط الأنابيب بمراقبة الجودة، تليهامن جديدتجميع النص واختيار مجموعة unigene. يتنبأ تحليل بنية unigene بتسلسل الترميز (CDS) وتكرار التسلسل البسيط (SSR). وفي وقت لاحق، يجد تحليل التعبير التفاضلي الجينات المعبر عنها تفاضلياً (DEGs) بين الظروف التي تم اختبارها، تليها شرح وظيفي وإثراء DEGs لاستخراج الأفكار البيولوجية.