تفاعل الكروماتين القائم على HI-C
ميزات الخدمة
● التسلسل على Illumina Novaseq مع PE150.
● تتطلب الخدمة عينات من الأنسجة ، بدلاً من الأحماض النووية المستخرجة ، إلى الارتباط المتقاطع مع الفورمالديهايد والحفاظ على تفاعلات بروتين الحمض النووي.
● تتضمن تجربة HI-C تقييدًا وإصلاح النهايات اللزجة مع البيوتين ، تليها تعميم الأطراف الفاتحة الناتجة مع الحفاظ على التفاعلات. ثم يتم سحب الحمض النووي مع حبات الستربتافيدين وتنقيتها لإعداد المكتبة اللاحق.
مزايا الخدمة
●التصميم الأمثل لتصميم الإنزيم: لضمان كفاءة HI-C عالية على الأنواع المختلفة التي تصل إلى 93 ٪ من أزواج التفاعل الصالحة.
●سجلات خبرة واسعة النشر:يتمتع Bmkgene بخبرة واسعة مع> 2000 مشاريع تسلسل HI-C من 800 نوع مختلف ومختلف براءات الاختراع. أكثر من 100 حالة منشورة مع عامل التأثير التراكمي لأكثر من 900.
●فريق المعلوماتية الحيوية عالية المهارات:مع براءات الاختراع الداخلية وحقوق الطبع والنشر للبرامج لتجارب HI-C وتحليل البيانات وبرنامج بيانات التصور المطورة ذاتيًا.
●دعم ما بعد البيع:يمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من إكمال المشروع مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة 3 أشهر. خلال هذا الوقت ، نقدم متابعة المشروع ، واستكشاف الأخطاء وإصلاحها ، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
●شرح شامل: نستخدم قواعد بيانات متعددة لتوضيح الجينات وظيفيًا مع اختلافات محددة وأداء تحليل الإثراء المقابل ، وتوفير رؤى حول مشاريع البحث المتعددة.
مواصفات الخدمة
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | إخراج البيانات الموصى بها | دقة إشارة HI-C |
| مكتبة HI-C | Illumina PE150 | حلقة الكروماتين: 150x تاد: 50x | حلقة الكروماتين: 10 كيلو بايت تاد: 40 كيلو بايت |
متطلبات الخدمة
| نوع العينة | المبلغ المطلوب |
| الأنسجة الحيوانية | ≥2g |
| دم كامل | ≥2ml |
| الفطريات | ≥1g |
| الأنسجة الشابة النباتية | 1G/ALIQUOT ، 2-4 قسامات موصى بها |
| الخلايا المثقف | ≥1x107 |
يشمل التحليل التالي:
● البيانات الخام QC ؛
● رسم الخرائط و HI-C مكتبة QC: أزواج التفاعل الصالحة وتفاعل التفاعل (IDES) ؛
● التنميط التفاعلي على نطاق الجينوم: تحليل CIS/Trans وخريطة التفاعل HI-C ؛
● تحليل توزيع مقصورة A/B ؛
● تحديد TADs وحلقات الكروماتين ؛
● التحليل التفاضلي على عناصر بنية الكروماتين ثلاثية الأبعاد بين العينات والتعليقات الوظيفية المقابلة للجينات المرتبطة بها.
CIS وتوزيع النسبة العابرة
خريطة الحرارة للتفاعلات الكروموسومية بين العينات
التوزيع على نطاق الجينوم لمقصورات A/B
التوزيع على نطاق الجينوم لحلقات الكروماتين
تصور Tads
استكشف التطورات البحثية التي تسهلها خدمات تسلسل HI-C من BMKGene من خلال مجموعة من المنشورات المنسقة.
منغ ، ت. وآخرون. (2021) "تحليل مقارنات متعددة الأوبك المتكاملة يحدد CA2 كهدف جديد للورم المولد" ،علم الأعصاب، 23 (10) ، ص. 1709-1722. doi: 10.1093/neuonc/noab156.
Xu ، L. et al. (2021) "عدم التنظيم ثلاثي الأبعاد وإعادة ترتيب الجينوم يوفرون نظرة ثاقبة على التسبب في NAFLD من خلال تسلسل HI-C و Nanopore و RNA المتكامل" ،Acta Pharmaceutica Sinica B، 11 (10) ، ص. 3150-3164. doi: 10.1016/j.apsb.2021.03.022.
