تحليل الارتباط على نطاق الجينوم
سير العمل
مزايا الخدمة
●سجلات خبرة واسعة النشر: من خلال الخبرة المتراكمة في GWAS ، أكملت Bmkgene مئات مشاريع الأنواع في أبحاث GWAS السكانية ، ومساعدة الباحثين في نشر أكثر من 100 مقالة ، ووصل عامل التأثير التراكمي إلى 500.
● تحليل المعلوماتية الحيوية الشاملة: يتضمن سير العمل تحليل جمعية SNP للسمات ، وتقديم مجموعة من الجينات المرشحة والتعليقات الوظيفية المقابلة لها.
●فريق المعلوماتية الحيوية ذات المهارات العالية ودورة التحليل القصيرة: مع خبرة رائعة في تحليل الجينوم المتقدم ، يقدم فريق Bmkgene تحليلات شاملة مع وقت تحول سريع.
●دعم ما بعد البيع:يمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من إكمال المشروع مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة 3 أشهر. خلال هذا الوقت ، نقدم متابعة المشروع ، واستكشاف الأخطاء وإصلاحها ، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مواصفات ومتطلبات الخدمة
| نوع التسلسل | مقياس السكان الموصى به | استراتيجية التسلسل | متطلبات النوكليوتيدات |
| تسلسل الجينوم كله | 200 عينة | 10x | التركيز: ≥ 1 نانوغرام/ ميكرولتر إجمالي المبلغ 30ng محدودة أو لا تدهور أو تلوث |
| شظية محددة مضخمة (SLAF) | عمق العلامة: 10x عدد العلامات: <400 ميغابايت: يوصى به WGS <1 جيجابايت: 100K العلامات 1 جيجا بايت > 2 جيجابايت: 300k العلامات الحد الأقصى 500K العلامات | التركيز ≥ 5 نانوغرام/ميكرولتر إجمالي المبلغ ≥ 80 نانوغرام Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 جل الاغاروز: لا أو تحلل أو تلوث محدود
|
اختيار المواد
أصناف مختلفة ، أنواع فرعية ، لاندرس/بنات الجينات/العائلات المختلطة/الموارد البرية
أصناف مختلفة ، أنواع فرعية ، أرضية
العائلة نصف العائلة/العائلة الكاملة/الموارد البرية
تدفق عمل الخدمة
تصميم التجربة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يشمل التحليل التالي:
- تحليل الارتباط على نطاق الجينوم: LM ، LMM ، Emmax ، نموذج Fastlmm
- التعليق التوضيحي الوظيفي للجينات المرشحة
تحليل جمعية SNP للسمات-مؤامرة مانهاتن
تحليل جمعية SNP للسمات-مؤامرة QQ
استكشاف التطورات التي تسهلها خدمات Bmkgene's De Gwas من خلال مجموعة من المنشورات المنسقة:
LV ، L. et al. (2023) "نظرة ثاقبة على الأساس الوراثي للتحمل الأمونيا في حلاقة Clam Sinonovacula Constricta من خلال دراسة الجينوم على نطاق الجينوم" ،تربية الأحياء المائية، 569 ، ص. 739351. doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li ، X. et al. (2022) "تحليلات متعددة الأوبك من 398 من إتمام الدخن من Foxtail تكشف عن مناطق جينية مرتبطة بالتدجين ، وسمات الأيض ، والتأثيرات المضادة للالتهابات" ،النبات الجزيئي، 15 (8) ، ص 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
لي ، ج. وآخرون. (2022) "رسم خرائط للجينوم على نطاق الجينوم للهوفيس بالكاد الأنماط في بيئة الجفاف" ،الحدود في علوم النبات، 13 ، ص. 924892. doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex.
Zhao ، X. et al. (2021) 'GMST1 ، الذي يشفر sulfotransferase ، يمنح مقاومة لفيروس فول الصويا الفوسويا G2 و G3' ،النبات والخلايا والبيئة، 44 (8) ، ص 2777-2792. doi: 10.1111/pce.14066.
