كامل طول تسلسل مرنا-نانوبوري
سمات
● التقاط بولي-A مرنا متبوعاً بتوليف [كدنا] وإعداد المكتبة
● تسلسل النصوص الكاملة
● تحليل المعلومات الحيوية على أساس المواءمة مع الجينوم المرجعي
● لا يشمل تحليل المعلومات الحيوية التعبير على مستوى الجينات والإسوفورم فحسب، بل يتضمن أيضًا تحليل lncRNA، ودمج الجينات، وتعدد الأدينيلات، وبنية الجينات
مزايا الخدمة
●القياس الكمي للتعبير على المستوى الإسوي: تمكين تحليل التعبير التفصيلي والدقيق، وكشف النقاب عن التغيير الذي قد يكون ملثما عند تحليل التعبير الجيني بأكمله
●انخفاض طلبات البيانات:بالمقارنة مع تسلسل الجيل التالي (NGS)، يُظهر تسلسل Nanopore متطلبات بيانات أقل، مما يسمح بمستويات مكافئة من تشبع القياس الكمي للتعبير الجيني مع بيانات أصغر.
●دقة أعلى لتقدير التعبير: سواء على مستوى الجينات والإسوفورم
●تحديد المعلومات النسخية الإضافية: عديد الأدينيلات البديل وجينات الاندماج وlcnRNA والجينات المستهدفة
●خبرة واسعة: يقدم فريقنا ثروة من الخبرة لكل مشروع، حيث أكمل أكثر من 850 مشروعًا كاملاً لنسخة Nanopore وقام بمعالجة أكثر من 8000 عينة.
●دعم ما بعد البيع: يمتد التزامنا إلى ما بعد إكمال المشروع بفترة خدمة ما بعد البيع مدتها 3 أشهر. خلال هذا الوقت، نقدم متابعة المشروع، والمساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
متطلبات العينة والتسليم
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| بولي المخصب | الومينا PE150 | 6/12 جيجابايت | متوسط نقاط الجودة: Q10 |
متطلبات العينة:
النيوكليوتيدات:
| Conc. (نانوغرام / ميكرولتر) | المبلغ (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 يظهر تلوث محدود أو معدوم بالبروتين أو الحمض النووي على الجل. | للنباتات: RIN≥7.0؛ للحيوانات: RIN≥7.5؛ 5.0≥28S/18S≥1.0؛ ارتفاع خط الأساس محدود أو معدوم |
● النباتات:
الجذر أو الجذع أو البتلة: 450 ملغ
الأوراق أو البذور: 300 ملغ
الفاكهة: 1.2 جرام
● الحيوان:
القلب أو الأمعاء: 300 ملغ
الأحشاء أو الدماغ: 240 ملغ
العضلات: 450 ملغ
العظام والشعر والجلد: 1 جرام
● المفصليات:
الحشرات: 6 جرام
القشريات: 300 ملغ
● الدم الكامل: 1 أنبوب
● الخلايا: 106 الخلايا
أوصى تسليم العينة
الحاوية: أنبوب طرد مركزي سعة 2 مل (لا ينصح باستخدام ورق القصدير)
وضع العلامات على العينات: المجموعة + النسخ المتماثل، على سبيل المثال A1، A2، A3؛ ب1، ب2، ب3.
شحنة:
1. الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس ودفنها في الثلج الجاف.
2. أنابيب RNAstable: يمكن تجفيف عينات RNA في أنبوب تثبيت RNA (مثل RNAstable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
تدفق عمل الخدمة
النيوكليوتيدات:
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
تدفق عمل الخدمة
منديل:
تصميم التجربة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
● معالجة البيانات الخام
● تحديد النص
● الربط البديل
● القياس الكمي للتعبير في مستوى الجينات ومستوى الشكل الإسوي
● تحليل التعبير التفاضلي
● شرح الوظيفة وإثرائها (DEGs وDETs)
تحليل الربط البديل
التحليل البديل بعديد الأدينيلات (APA)
التنبؤ بـ lncRNA
شرح الجينات الجديدة
تجميع DETs
شبكات البروتين البروتين في DEGs
اكتشف التطورات التي سهلتها خدمات تسلسل mRNA كاملة الطول من Nanopore من BMKGene من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
غونغ، B. وآخرون. (2023) "التنشيط اللاجيني والنسخي للكيناز الإفرازي FAM20C باعتباره أحد الجينات المسرطنة في الورم الدبقي"، مجلة علم الوراثة وعلم الجينوم، 50(6)، الصفحات من 422 إلى 433. دوى: 10.1016/J.JGG.2023.01.008.
هو، Z. وآخرون. (2023) "يكشف تسلسل النسخ الكامل للخلايا الليمفاوية الذي يستجيب لـ IFN-γ عن استجابة مناعية منحرفة لـ Th1 في السمك المفلطح (Paralichthys olivaceus)"، علم مناعة الأسماك والمحاريات، 134، ص. 108636. دوى: 10.1016/J.FSI.2023.108636.
ما، Y. وآخرون. (2023) "تحليل مقارن لطرق تسلسل PacBio وONT RNA لتحديد سم Nemopilema Nomurai"، علم الجينوم، 115(6)، ص. 110709. دوى: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
يو، د. وآخرون. (2023) "يكشف تحليل Nano-seq عن اتجاه وظيفي مختلف بين الإكسوسومات والحويصلات الدقيقة المستمدة من hUMSC"، أبحاث الخلايا الجذعية والعلاج، 14 (1)، ص 1-13. دوى: 10.1186/S13287-023-03491-5/الجداول/6.
