تحليل mRNA حقيقي النواة (تتوفر خيارات قائمة على المرجع وخيارات جديدة)
يستخدم خط الأنابيب هذا بيانات NGS RNA-Seq كمدخلات وينتج نتائج من تحليلات متعددة بما في ذلك على سبيل المثال لا الحصر: تقييم جودة البيانات التسلسلية،جديدشرح موقع النسخ، تحليل الربط المتغير، تحليل التعبير التفاضلي، شرح الوظيفة وتحليل الإثراء.
تحليل الحمض النووي الريبي (RNA) الطويل غير المشفر
إن RNAs الطويلة غير المشفرة (lncRNA) عبارة عن نصوص غير مشفرة بأطوال أطول من 200 nt ومعروفة بأنها تلعب أدوارًا في تنظيم وتنظيم الكروماتين. لقد مكنت تقنيات التسلسل عالية الإنتاجية والمعلوماتية الحيوية فهمنا لتسلسلات lncRNA ومعلومات تحديد المواقع لتحديد lncRNAs ذات الوظائف التنظيمية الحاسمة. يوفر خط الأنابيب هذا تحليل lncRNA بالإضافة إلى التحليلات المذكورة في خط أنابيب تحليل mRNA حقيقيات النواة.
16S/18S/ITS تسلسل amplicon
تم تطوير خط أنابيب تحليل التنوع الميكروبي Amplicon Sequencing بناءً على سنوات من الخبرة في تحليل مشروع التنوع الميكروبي. يحتوي خط الأنابيب على تحليل أساسي موحد، والذي يغطي محتوى التحليل السائد للأبحاث الميكروبية الحالية والتحليل الشخصي. تقرير التحليل غني وشامل، مع خيار إجراء تحليل شخصي متنوع. بالإضافة إلى ذلك، يمكن تعديل العينات والمجموعات بسرعة لمزيد من التخصيص والتحكم.
تحليل ميتاجينوميكس البندقية
يستخدم خط أنابيب تحليل Shotgun Metagenomic بيانات NGS من مواد جينومية مختلطة مستخرجة من العينات البيئية. توفر التحليلات المشمولة معلومات مفصلة عن تنوع الأنواع ووفرتها، والتركيبة السكانية، والعلاقة التطورية، والجينات الوظيفية، وشبكات الارتباط مع العوامل البيئية.
تحليل متغير NGS-WGS
يعد تحليل المتغيرات NGS-WGS بمثابة خط أنابيب متكامل للكشف عن المتغيرات والذي يقوم بمراقبة جودة البيانات ومحاذاة التسلسل والتعليقات التوضيحية وتحليل طفرة الجينات. يتبع خط الأنابيب أفضل ممارسات GATK لاكتشاف SNP وInDel ويستخدم Manta لاستدعاء المتغيرات الهيكلية.
دراسة رابطة الجينوم الواسعة (GWAS)
خط أنابيب GWAS عبارة عن تحليل نهائي يأخذ ملفات VCF التي تم إنشاؤها مسبقًا وبيانات النمط الظاهري المقابلة لمجموعة من الأفراد كمدخلات. باستخدام منهجيات إحصائية محددة، تهدف GWAS إلى الكشف عن اختلافات النوكليوتيدات على مستوى الجينوم والمرتبطة بالاختلافات المظهرية. إنه يلعب دورًا حاسمًا في استكشاف الجينات الوظيفية المرتبطة بالأمراض البشرية المعقدة والصفات المعقدة في النباتات والحيوانات.
تحليل الفصل بالجملة (BSA)
يتضمن تحليل مساحة سطح الجسم تجميع الأفراد ذوي السمات المظهرية المتطرفة من مجموعة معزولة. ومن خلال مقارنة المواقع التفاضلية بين العينات المجمعة، يحدد هذا النهج بسرعة العلامات الجزيئية المرتبطة ارتباطًا وثيقًا بالجينات المستهدفة. ويستخدم على نطاق واسع في رسم الخرائط الجينية للنباتات والحيوانات، وهو أداة قيمة للتربية بمساعدة العلامات.
تحليل الوراثة التطورية
يستفيد سير عمل تحليل علم الوراثة التطوري من خبرة BMKGENE الواسعة في مشاريع التطور الوراثي ويتضمن بناء شجرة النشوء والتطور، وتحليل اختلال الارتباط، وتقييم التنوع الوراثي، وتحديد المسح الانتقائي، وتحليل القرابة، وتحليل المكونات الرئيسية، وتوصيف التركيبة السكانية.
