علم الوراثة التطورية
مزايا الخدمة
تاكاجي وآخرون ،مجلة النبات، 2013
●تحليل شامل للمعلومات الحيوية:تمكين تقدير التنوع الوراثي ، والذي يعكس الإمكانات التطورية للأنواع ، والكشف عن العلاقة التطورية الموثوقة بين الأنواع ذات التأثير الصحيح للتطور المتقارب والتطور المتوازي
●تحليل مخصص اختياري: مثل تقدير وقت الاختلاف والسرعة بناءً على الاختلافات على مستوى النوكليوتيدات والأحماض الأمينية.
●سجلات خبرة واسعة النشر: لقد تراكمت BMKGENE خبرة هائلة في مشاريع علم الوراثة في عدد السكان والوراثة التطورية لأكثر من 15 عامًا ، والتي تغطي الآلاف من الأنواع ، وما إلى ذلك وساهمت في أكثر من 1000 مشاريع عالية المستوى تم نشرها في الاتصالات الطبيعية ، والنباتات الجزيئية ، ومجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية ، إلخ.
● فريق المعلوماتية الحيوية عالية المهارات ودورة التحليل القصيرة: مع خبرة رائعة في تحليل الجينوم المتقدم ، يقدم فريق Bmkgene تحليلات شاملة مع وقت تحول سريع.
● دعم ما بعد البيع:يمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من إكمال المشروع مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة 3 أشهر. خلال هذا الوقت ، نقدم متابعة المشروع ، واستكشاف الأخطاء وإصلاحها ، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مواصفات ومتطلبات الخدمة
| نوع التسلسل | مقياس السكان الموصى به | استراتيجية التسلسل | متطلبات النوكليوتيدات |
| تسلسل الجينوم كله | ≥ 30 فردًا ، مع ≥ 10 أفراد من كل مجموعة فرعية
| 10x | التركيز: ≥ 1 نانوغرام/ ميكرولتر إجمالي المبلغ 30ng محدودة أو لا تدهور أو تلوث |
| شظية محددة مضخمة (SLAF) | عمق العلامة: 10x عدد العلامات: <400 ميغابايت: يوصى به WGS <1 جيجا بايت: 100 كيلو العلامات 1 جيجا بايت > 2 جيجابايت: 300k العلامات الحد الأقصى 500K العلامات | التركيز ≥ 5 نانوغرام/ميكرولتر إجمالي المبلغ ≥ 80 نانوغرام Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 جل الاغاروز: لا أو تحلل أو تلوث محدود
|
تدفق عمل الخدمة
تصميم التجربة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
تشمل الخدمة تحليل الهيكل السكاني (شجرة التطور ، PCA ، مخطط التقسيم الطبقي للسكان) ، التنوع السكاني ، واختيار السكان (اختلال الارتباط ، الاختيار الانتقائي للمواقع المفيدة). يمكن أن تضمنت الخدمة أيضًا تحليلًا مخصصًا (على سبيل المثال وقت الاختلاف ، تدفق الجينات).
*النتائج التجريبية الموضحة هنا كلها من الجينومات المنشورة مع bmkgene
1. يحتوي تحليل التطور على بناء شجرة phylogenetic ، والبنية السكانية و PCA على أساس الاختلافات الجينية.
تمثل شجرة التطور علم الوراثة العلاقات التصنيفية والتطورية بين الأنواع ذات الجد المشترك.
تهدف PCA إلى تصور التقارب بين السكان الفرعية.
يوضح البنية السكانية وجود السكان الفرعيين المتميزين وراثيا من حيث ترددات الأليل.
تشن ، وآخرون. آل ،pnas، 2020
2. اكتساح الانتقائي
تشير عملية المسح الانتقائية إلى عملية يتم من خلالها اختيار موقع مفيد وتزداد ترددات المواقع المحايدة المرتبطة وتنخفض تلك الموجودة في المواقع غير المرتبطة ، مما يؤدي إلى تقليل الإقليمية.
تتم معالجة الكشف على نطاق الجينوم على مناطق عملية المسح الانتقائية عن طريق حساب المؤشر الوراثي للسكان （π ， FST ، Tajima's D) لجميع SNPs داخل نافذة منزلق (100 كيلو بايت) في خطوة معينة (10 كيلو بايت).
تنوع النوكليوتيدات (π）
تاجيما د
فهرس التثبيت (FST)
وو ، وآخرون. آل ،النبات الجزيئي، 2018
3. تدفق الجين
وو ، وآخرون. آل ،النبات الجزيئي، 2018
4. تاريخ التخطيطي
تشانغ ، وآخرون. آل ،بيئة الطبيعة والتطور، 2021
5. وقت التقليل
تشانغ ، وآخرون. آل ،بيئة الطبيعة والتطور، 2021
استكشاف التطورات التي تسهلها خدمات الوراثة التطورية في BMKGENE من خلال مجموعة من المنشورات:
حسانيار ، AK et al. (2023) "اكتشاف العلامات الجزيئية SNP والجينات المرشحة المرتبطة بمقاومة فيروس Sacbrood في يرقات Apis Cerana Cerana بواسطة استئناف جينوم كامل" ،المجلة الدولية للعلوم الجزيئية، 24 (7). doi: 10.3390/ijms24076238.
Chai ، J. et al. (2022) "اكتشاف السمندر الصيني الصيني النقي وراثياً يخلق فرصًا جديدة للحفظ" ،أبحاث علم الحيوان، 2022 ، المجلد. 43 ، العدد 3 ، الصفحات: 469-480 ، 43 (3) ، ص. 469-480. doi: 10.24272/j.issn.2095-8137.2022.101.
هان ، م. وآخرون. (2022) "نمط الجغرافيا والتطور السكاني تاريخ elymus sibiricus L. على هضبة التبت في تشينغهاي" ،الحدود في علوم النبات، 13 ، ص. 882601. doi: 10.3389/fpls.2022.882601/bibtex.
وانغ ، ج. وآخرون. (2022) "رؤى جينومية في تطور Longan من مجموعة الجينوم على مستوى الكروموسوم وجينوم السكان من عروض Longan" ،أبحاث البستنة، 9. doi: 10.1093/hr/uhac021.
