تسلسل mRNA كامل الطول -PacBio
سمات
● توليف [كدنا] من بولي-A مرنا متبوعاً بإعداد المكتبة
● التسلسل في وضع CCS، وتوليد قراءات HiFi
● تسلسل النصوص الكاملة
● لا يتطلب التحليل وجود جينوم مرجعي؛ ومع ذلك، فإنه قد يتم توظيفها
● يتيح تحليل المعلومات الحيوية تحليل نصوص lncRNA المتماثلة، ودمج الجينات، وتعدد الأدينيلات، وبنية الجينات
مزايا الخدمة
●دقة عالية: يقرأ HiFi بدقة أكبر من 99.9% (Q30)، مقارنةً بـ NGS
● تحليل الربط البديل: تسلسل النصوص بأكملها يتيح تحديد الشكل الإسوي وتوصيفه
●خبرة واسعة: مع سجل حافل بإكمال أكثر من 1100 مشروع نسخة كاملة من PacBio ومعالجة أكثر من 2300 عينة، يجلب فريقنا ثروة من الخبرة لكل مشروع.
●دعم ما بعد البيع: يمتد التزامنا إلى ما بعد إكمال المشروع بفترة خدمة ما بعد البيع مدتها 3 أشهر. خلال هذا الوقت، نقدم متابعة المشروع، والمساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
متطلبات العينة والتسليم
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| مكتبة PolyA المخصب mRNA CCS | باكبيو تتمة الثاني باكبيو ريفيو | 20/40 جيجابايت 5/10 م CCS | Q30≥85% |
متطلبات العينة:
النيوكليوتيدات:
● النباتات:
الجذر أو الجذع أو البتلة: 450 ملغ
الأوراق أو البذور: 300 ملغ
الفاكهة: 1.2 جرام
● الحيوان:
القلب أو الأمعاء: 300 ملغ
الأحشاء أو الدماغ: 240 ملغ
العضلات: 450 ملغ
العظام والشعر والجلد: 1 جرام
● المفصليات:
الحشرات: 6 جرام
القشريات: 300 ملغ
● الدم الكامل: 1 أنبوب
● الخلايا: 106 الخلايا
| Conc. (نانوغرام / ميكرولتر) | المبلغ (ميكروغرام) | نقاء | نزاهة |
| ≥ 100 | ≥ 1.0 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 يظهر تلوث محدود أو معدوم بالبروتين أو الحمض النووي على الجل. | للنباتات: RIN≥7.5؛ للحيوانات: RIN≥8.0؛ 5.0≥ 28S/18S≥1.0؛ ارتفاع خط الأساس محدود أو معدوم |
أوصى تسليم العينة
حاوية: 2 مل أنبوب الطرد المركزي (لا ينصح باستخدام ورق القصدير)
وضع العلامات على العينات: المجموعة + النسخ المتماثل، على سبيل المثال A1، A2، A3؛ ب1، ب2، ب3.
شحنة:
1. الثلج الجاف: يجب تعبئة العينات في أكياس ودفنها في الثلج الجاف.
2. أنابيب RNAstable: يمكن تجفيف عينات RNA في أنبوب تثبيت RNA (مثل RNAstable®) وشحنها في درجة حرارة الغرفة.
تدفق عمل الخدمة
تصميم التجربة
تسليم العينة
استخراج الحمض النووي الريبي
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
● مراقبة جودة البيانات الأولية
● التحليل البديل بعديد الأدينيلات (APA)
● تحليل نص الانصهار
● تحليل الربط البديل
● تحليل المقارنة المعيارية لتقويم العظام العالمي ذو النسخة الواحدة (BUSCO).
● تحليل نص الرواية: التنبؤ بتسلسلات الترميز (CDS) والشرح الوظيفي
● تحليل lncRNA: التنبؤ بـ lncRNA والأهداف
● تحديد هوية الأقمار الصناعية الصغيرة (SSR)
تحليل بوسكو
تحليل الربط البديل
التحليل البديل بعديد الأدينيلات (APA)
الشرح الوظيفي للنصوص الرواية
استكشف التطورات التي سهلتها خدمات تسلسل mRNA كاملة الطول من BMKGene's Nanopore في هذا المنشور المميز.
ما، Y. وآخرون. (2023) "تحليل مقارن لطرق تسلسل PacBio وONT RNA لتحديد سم Nemopilema Nomurai"، علم الجينوم، 115(6)، ص. 110709. دوى: 10.1016/J.YGENO.2023.110709.
تشاو، س. وآخرون. (2019) "الديناميكيات التنموية لنسخة جذع الحوذاء"، مجلة التكنولوجيا الحيوية النباتية، 17(1)، الصفحات من 206 إلى 219. دوى: 10.1111/PBI.12958.
دينغ، H. وآخرون. (2022) "التغيرات الديناميكية في محتوى حمض الأسكوربيك أثناء تطور الثمار ونضج الأكتينيديا لاتيفوليا (محصول فواكه غني بالأسكوربات) والآليات الجزيئية المرتبطة بها"، المجلة الدولية للعلوم الجزيئية، 23(10)، ص. 5808. دوى: 10.3390/IJMS23105808/S1.
هوا، X. وآخرون. (2022) "التنبؤ الفعال لجينات المسار التخليقي الحيوي المشاركة في البوليفيلين النشط بيولوجيًا في بوليفيلا باريس"، بيولوجيا الاتصالات 2022 5:1، 5(1)، الصفحات من 1 إلى 10. دوى: 10.1038/s42003-022-03000-z.
ليو، M. وآخرون. (2023) "التحليل المشترك لـ PacBio Iso-Seq وIllumina RNA-Seq لجينات Tuta absoluta (Meyrick) Transcriptome وCytochrome P450"، الحشرات، 14(4)، ص. 363. دوى: 10.3390/INSECTS14040363/S1.
وانغ، ليجون وآخرون. (2019) "دراسة استقصائية لتعقيد النسخ باستخدام التحليل في الوقت الحقيقي لجزيء واحد من PacBio مع تسلسل Illumina RNA لفهم أفضل للتخليق الحيوي لحمض الريسينوليك في Ricinusommunis"، BMC Genomics، 20(1)، الصفحات من 1 إلى 17. دوى: 10.1186/S12864-019-5832-9.
