إعادة تسلسل الجينوم البكتيري والفطري
تعتبر مشاريع إعادة تسلسل الجينوم البكتيرية والفطرية محورية في تقدم علم الجينوم الميكروبي من خلال تمكين الانتهاء من الجينومات الميكروبية ومقارنتها. هذا يسهل هندسة التخمير ، وتحسين العمليات الصناعية ، واستكشاف مسارات التمثيل الغذائي الثانوي. علاوة على ذلك ، يعد إعادة التسلسل الفطري والبكتيري أمرًا بالغ الأهمية لفهم التكيف البيئي ، وتحسين السلالات ، والكشف عن ديناميات التطور الوراثي ، مع آثار واسعة في الطب والزراعة والعلوم البيئية.
مزايا الخدمة
●يتضمن التحليل الحيوي الحيوي الاتصال المتغير:توفير رؤى وظيفية في الجينومات المتسلسلة.
● خبرة واسعة: مع وجود الآلاف من مشاريع إعادة التسلسل الميكروبية التي يتم إجراؤها سنويًا ، فإننا نجلب عقدًا من الخبرة ، وفريق تحليل مهارات عالية ، ومحتوى شامل ، ودعم ممتاز بعد البيع.
●دعم ما بعد البيع:يمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من إكمال المشروع مع فترة خدمة ما بعد البيع لمدة 3 أشهر. خلال هذا الوقت ، نقدم متابعة المشروع ، واستكشاف الأخطاء وإصلاحها ، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
مواصفات الخدمة
| منصة التسلسل | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها | ضبط الجودة |
| Illumina Novaseq | PE150 | عمق 100x | Q30≥85 ٪ |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميكرولتر) | المبلغ الإجمالي (نانوغرام) | الحجم (ميكرولتر) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
البكتيريا: ≥1x107 الخلايا
الفطريات أحادية الخلايا: ≥5x106-1x107 الخلايا
الفطريات الكلية: ≥4g
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يشمل التحليل التالي:
- مراقبة جودة البيانات التسلسل
- التوافق مع الجينوم المرجعي
- استدعاء البديل: SNP و indel
- التعليقات التوضيحية المتغيرة
استدعاء المتغير: أنواع SNP
استدعاء المتغير: توزيع طول indel
استكشاف التطورات التي تسهلها خدمات إعادة تسلسل الجينوم الميكروبية من BMKGENE من خلال مجموعة من المنشورات.
جيا ، ي. وآخرون. (2023) "الجمع بين إعادة التسلسل الجينوم الكامل وجينوم جينات مقاومة الأمراض من أجل القمح القزم" ،المجلة الدولية للعلوم الجزيئية، 24 (24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
جيانغ ، م. وآخرون. (2023) "استقلاب الجلوكوز الذي يسيطر عليه الأمبيسيلين يتلاعب بالانتقال من التسامح إلى المقاومة في البكتيريا" ،تقدم العلوم، 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
يانغ ، م. وآخرون. (2022) 'aliidiomarina halalkaliphila sp. نوفمبر ، بكتيريا هالوكالفيليك معزولة عن بحيرة الصودا في منطقة المنغوليا الداخلية المستقلة ، الصين ، الباحث. J. Syst. إيفول.ميكروبول، 72 ، ص. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu ، Z. ، Wu ، R. and Wang ، G.-H. (2024) "تسلسل الجينوم من المكورات العنقودية Nepalensis ZZ-2023A ، معزولة من Nasonia Vitripennis" ،إعلانات موارد علم الأحياء الدقيقة. doi: 10.1128/mra.00802-23.
