مجموعة الجينوم البكتيرية دي نوفو
نحن نقدم خدمة كاملة لتجميع الجينوم البكتيري، مما يضمن عدم وجود أي فجوات. وهذا ممكن من خلال دمج تقنيات تسلسل القراءة الطويلة، مثل Nanopore وPacBio للتجميع وتسلسل القراءة القصيرة مع Illumina للتحقق من صحة التجميع وتصحيح الأخطاء في قراءات ONT. توفر خدمتنا سير عمل المعلومات الحيوية الكامل بدءًا من التجميع والتعليق الوظيفي والتحليل المعلوماتي الحيوي المتقدم، مما يحقق أهدافًا بحثية محددة. تتيح هذه الخدمة تطوير جينومات مرجعية دقيقة لمختلف الدراسات الجينية والجينومية. بالإضافة إلى ذلك، فهو يشكل الأساس لتطبيقات مثل تحسين السلالة، والهندسة الوراثية، وتطوير التكنولوجيا الميكروبية، مما يضمن بيانات جينومية موثوقة وخالية من الثغرات حاسمة لتعزيز الرؤى العلمية والابتكار في مجال التكنولوجيا الحيوية.
مميزات الخدمة
● مع خيارين ممكنين للاختيار من بينهما اعتمادًا على الدرجة المطلوبة من اكتمال الجينوم.
● خيار مسودة الجينوم: تسلسل القراءة القصيرة باستخدام Illumina NovaSeq PE150.
● استكمال 0 الجينوم الفجوة.
● التسلسل طويل القراءة على Nanopore PromethION 48 أو PacBio Revio لتجميع الجينوم.
● تسلسل قصير القراءة على Illumina NovaSeq للتحقق من صحة الجينوم وتصحيح الأخطاء (Nanopore) أو لإنشاء مسودة الجينوم.
مزايا الخدمة
●ضمان انعدام الفجوة الجينية: ويرجع ذلك إلى تكامل تسلسل Illumina مع تسلسل القراءة الطويلة (Nanopore أو PacBio).
●استكمال سير عمل المعلوماتية الحيوية:يتضمن ذلك تجميع الجينوم والتنبؤ بالعناصر الجينومية المتعددة، والشرح الجيني الوظيفي، وتصورات الجينوم مثل مؤامرة سيركوس.
●خبرة واسعة: مع تجميع أكثر من 20000 جينوم ميكروبي، تتمتع BMKGENE بخبرة تزيد عن عقد من الزمن، وفريق تحليل ذو مهارات عالية، ومحتوى شامل، ودعم ممتاز لما بعد البيع.
●دعم ما بعد البيع:ويمتد التزامنا إلى ما هو أبعد من استكمال المشروع بفترة خدمة ما بعد البيع مدتها 3 أشهر. خلال هذا الوقت، نقدم متابعة المشروع، والمساعدة في استكشاف الأخطاء وإصلاحها، وجلسات أسئلة وأجوبة لمعالجة أي استفسارات تتعلق بالنتائج.
●استراتيجيات التسلسل المتعددة المتاحة:لمختلف أهداف البحث ومتطلبات اكتمال الجينوم.
مواصفات الخدمة
| خدمة | استراتيجية التسلسل |
| مشروع الجينوم | الومينا بي اي 150 100x |
| 0 فجوة الجينوم | نانوبور 100x + إلومينا PE150 100x Or باكبيو هاي فاي 30x + إلومينا PE150 100x (اختياري) |
متطلبات العينة:
| التركيز (نانوغرام/ميليلتر) | المبلغ الإجمالي (ميكروغرام) | الحجم (ميليلتر) | أود260/280 | أود260/230 | |
| باكبيو | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| نانوبور | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| إلومينا | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· البكتيريا: ≥3.5x1010 الخلايا
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
● تسلسل مراقبة جودة البيانات
● تجميع الجينوم
● تحليل مكونات الجينوم: التنبؤ بـ CDS والعناصر الجينومية المتعددة
● شرح وظيفي مع قواعد بيانات عامة متعددة (GO، KEGG، إلخ) وقواعد بيانات متقدمة (CARD، VFDB، إلخ)
● تصور الجينوم
نحن نقدم الجينوم بتنسيق Fasta الذي يمكن الوصول إليه بسهولة وملف التعليقات التوضيحية للجينوم (gff).
شرح الجينات – GO
الشرح الجيني - الكربوهيدرات CAZY
تصور الجينوم – مؤامرة السيرك
استكشف التطورات التي سهلتها خدمات تجميع الجينوم البكتيري من BMKGene من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
داي، دبليو وآخرون. (2023) "اكتشاف البكتيريا المتجانسة F18-22 باعتبارها بكتيريا بروبيوتيك آمنة ومبتكرة لعلاج التهاب القولون التقرحي من القولون البشري السليم"،المجلة الدولية للعلوم الجزيئية، 24(19)، ص. 14669. دوى: 10.3390/IJMS241914669/S1.
كانغ، س. وآخرون. (2021) "عزلات Proteus mirabilis المقاومة للأدوية المتعددة والتي تحمل blaOXA-1 وblaNDM-1 من الحياة البرية في الصين: زيادة المخاطر على الصحة العامة"،علم الحيوان التكاملي، 16(6)، الصفحات من 798 إلى 809. دوى: 10.1111 / 1749-4877.12510.
وانغ، تي تي وآخرون. (2017) "تسلسل الجينوم الكامل للنبات الداخلي Bacillus flexus KLBMP 4941 يكشف عن آلية تعزيز نمو النبات والأساس الجيني لتحمل الملح"،مجلة التكنولوجيا الحيوية، 260، ص 38-41. دوى: 10.1016/J.JBIOTEC.2017.09.001.
وانغ، X. وآخرون. (2021) "البلازميدات المقاومة للنسخ المتعدد للكليبسيلا تتوسط في النشر الواسع النطاق للجينات المضادة للميكروبات"،الحدود في علم الأحياء الدقيقة، 12، ص. 754931. دوى: 10.3389/FMICB.2021.754931/BIBTEX.
