تسلسل Amplicon (16S/18S/ITS)

يعد تسلسل Amplicon (16S/18S/ITS) مع Illumina طريقة لتحليل التنوع الميكروبي من خلال تحديد الملامح الميكروبية وفقًا لتسلسلها ثم محاولة فك تشفير ثراء المجتمع وتنوعه داخل كل عينة وبين العينات. يسمح خط أنابيب BMKCloud Amplicon (NGS) بتحليل 16S و 18S والجينات الوظيفية المتعددة. إنه يبدأ بقراءة القراءة وتجميع القراءة المقترنة وتقييم الجودة ، تليها تجميع القراءات المماثلة لإنشاء وحدات تصنيفية تشغيلية (OTUs) المستخدمة في ستة أقسام تحليل مختلفة. يوفر التعليق التوضيحي التصنيفي معلومات عن الوفرة النسبية وتكوين كل عينة ، بينما تركز تحليلات تنوع Alpha و Beta على التنوع الميكروبي داخل العينات وبينها ، على التوالي. يجد التحليل التفاضلي بين المجموعات OTUs التي تختلف باستخدام كل من الاختبارات البارمية وغير البارامترية ، في حين أن تحليل الارتباط يتعلق بهذه الاختلافات بالعوامل البيئية. أخيرًا ، من المتوقع أن يكون وفرة الجينات الوظيفية بناءً على وفرة الجينات العلامة ، مما يوفر نظرة ثاقبة على الوظيفة والبيئة في كل عينة ..