16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
مميزات الخدمة
● منصة التسلسل: PacBio Revio
● وضع التسلسل: CCS (قراءة HiFi)
● تضخيم المنطقة المستهدفة متبوعًا بالربط الترادفي للأمبليكونات قبل إعداد مكتبة جرس HiFi SMRT
مزايا الخدمة
●دقة تصنيفية أعلى: Tهان تسلسل قصير amplicon,تمكين معدلات تصنيف OTU أعلى على مستوى الأنواع.
●استدعاء قاعدة دقيقة للغاية: تسلسل وضع PacBio CCS (يقرأ HiFi).
●خالية من العزلة: التعرف السريع على التركيب الميكروبي في العينات البيئية.
●قابلة للتطبيق على نطاق واسع: دراسات المجتمع الميكروبي المتنوعة.
●تحليل شامل للمعلومات الحيوية: أحدث حزمة QIIME2 (رؤية كمية للبيئة الميكروبية) مع تحليلات متنوعة من حيث قاعدة البيانات والتعليقات التوضيحية وOTU/ASV.
●خبرة واسعة: مع الآلاف من مشاريع تسلسل amplicon التي يتم إجراؤها سنويًا، تتمتع BMKGENE بخبرة تزيد عن عقد من الزمن، وفريق تحليل ذو مهارات عالية، ومحتوى شامل، ودعم ممتاز لما بعد البيع.
مواصفات الخدمة
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها |
| أمبليكون | باكبيو ريفيو | علامات 10/30/50 K (CCS) |
متطلبات العينة
| التركيز (نانوغرام/ميليلتر) | المبلغ الإجمالي (ميكروغرام) | الحجم (ميليلتر) |
| ≥5 | ≥0.3 | ≥20 |
أوصى تسليم العينة
قم بتجميد العينات في النيتروجين السائل لمدة 3-4 ساعات وتخزينها في النيتروجين السائل أو -80 درجة للحفظ على المدى الطويل. مطلوب شحن العينة مع الثلج الجاف.
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
● مراقبة جودة البيانات الأولية
● تجميع/إزالة الضوضاء OTU (ASV)
● شرح OTU
● تحليل تنوع ألفا: فهارس متعددة، بما في ذلك شانون وسيمبسون وإيس.
● تحليل التنوع بيتا
● التحليل بين المجموعات
●تحليل الارتباط: بين العوامل البيئية وتكوينها وتنوعها
●16S التنبؤ الجيني الوظيفي
رسم بياني للتوزيع التصنيفي
توزيع المجتمع شجرة النشوء والتطور
تحليل تنوع ألفا: ACE
فِهرِس
تحليل تنوع بيتا: PCoA
التحليل بين المجموعات: ANOVA
استكشف التطورات التي سهلتها خدمات تسلسل الأمبليكون من BMKGene مع PacBio من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
Gao, X. and Wang, H. (2023) "تحليل مقارن للملامح والوظائف البكتيرية للكرش أثناء التكيف مع ظواهر مختلفة (Regreen vs. Grassy) في أغنام ميرينو في جبال الألب مع مرحلتين للنمو في مرج جبال الألب"، التخمير، 9( 1)، ص. 16. دوى: 10.3390/التخمير9010016/S1.
لي، S. وآخرون. (2023) "التقاط المادة المظلمة الميكروبية في التربة الصحراوية باستخدام علم الميتاجينوميات القائم على الثقافة والتحليل عالي الدقة"، npj Biofilms and Microbiomes 2023 9:1، 9(1)، الصفحات من 1 إلى 14. دوى: 10.1038/s41522-023-00439-8.
مو، L. وآخرون. (2022) "تأثيرات أملاح الأحماض الدهنية على خصائص التخمير والتنوع البكتيري والثبات الهوائي للسيلاج المختلط المحضر بالبرسيم الحجازي وقش الأرز ونخالة القمح"، مجلة علوم الأغذية والزراعة، 102(4)، ص 1475- 1487. دوى: 10.1002/JSFA.11482.
يانغ، J. وآخرون. (2023) "التفاعل بين المؤشرات الحيوية للإجهاد التأكسدي وميكروبات الأمعاء في التأثيرات المضادة للأكسدة للمستخلصات من Sonchus brachyotus DC. في الإجهاد التأكسدي المعوي الناجم عن الأوكسازولون لدى أسماك الزرد البالغة، مضادات الأكسدة 2023، المجلد. 12، الصفحة 192، 12(1)، ص. 192. دوى: 10.3390/ANTIOX12010192.
