16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
مميزات الخدمة
● منصة التسلسل: Illumina NovaSeq.
● تضخيم المناطق القصيرة 16S و18S وITS، من بين أهداف التضخيم الأخرى.
● خيارات مرنة من amplicon.
● خبرة المشروع السابقة مع أهداف تضخيم متعددة.
مزايا الخدمة
●خالية من العزلة:التعرف السريع على التركيب الميكروبي في العينات البيئية.
●دقة عالية: في مكونات قليلة وفيرة في العينات البيئية.
●قابلة للتطبيق على نطاق واسع: دراسات المجتمع الميكروبي المتنوعة.
●التحليل الشامل للمعلومات الحيوية: أحدث حزمة QIIME2 (رؤية كمية للبيئة الميكروبية) مع تحليلات متنوعة من حيث قاعدة البيانات والتعليقات التوضيحية وOTU/ASV.
●خبرة واسعة: من خلال 150 ألف مشروع تسلسل amplicon يتم إجراؤها سنويًا، تتمتع BMKGENE بخبرة تزيد عن عقد من الزمن، وفريق تحليل ذو مهارات عالية، ومحتوى شامل، ودعم ممتاز لما بعد البيع.
مواصفات الخدمة
| مكتبة | استراتيجية التسلسل | البيانات الموصى بها |
| أمبليكون | الومينا بي اي 250 | 50/100/300 ألف علامة (أزواج القراءة) |
متطلبات الخدمة
| التركيز (نانوغرام/ميليلتر) | المبلغ الإجمالي (نانوغرام) | الحجم (ميليلتر) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● التربة/الحمأة: 1-2 جرام
● المحتوى المعوي-الحيواني: 0.5-2 جرام
● محتويات الأمعاء-الحشرة: 0.1-0.25 جرام
● سطح النبات (الرواسب المخصبة): 0.1-0.5 جم
● مرق التخمير المخصب الرواسب): 0.1-0.5 جم
● البراز (الحيوانات الكبيرة): 0.5-2 جرام
● البراز (الفار): 3-5 حبات
● سائل غسل الحويصلات الرئوية: ورق ترشيح
● المسحة المهبلية: 5-6 مسحات
● مسحة الجلد/الأعضاء التناسلية/اللعاب/الأنسجة الرخوة عن طريق الفم/مسحة البلعوم/مسحة المستقيم: 2-3 مسحات
● الكائنات الحية الدقيقة السطحية: ورق الترشيح
● الجسم المائي/الهواء/الأغشية الحيوية: ورق الترشيح
● النابتات الداخلية: 1-2 جرام
● لوحة الأسنان: 0.5-1 جرام
تدفق عمل الخدمة
تسليم العينة
بناء المكتبة
التسلسل
تحليل البيانات
خدمات ما بعد البيع
يتضمن التحليل التالي:
- مراقبة جودة البيانات الخام
- تجميع OTU / إزالة الضوضاء (ASV)
- شرح OTU
- تحليل تنوع ألفا: فهارس متعددة، بما في ذلك شانون وسيمبسون وإيس.
- تحليل التنوع بيتا
- التحليل بين المجموعات
- تحليل الارتباط: بين العوامل البيئية وتكوين وتنوع OUT
- 16S التنبؤ الجيني الوظيفي
رسم بياني للتوزيع التصنيفي
خريطة الحرارة العنقودية للوفرة التصنيفية
تحليل تنوع ألفا: منحنى الخلخلة
تحليل تنوع بيتا: NMDS
تحليل Intergroup: اكتشاف العلامات الحيوية LEFSE
استكشف التطورات التي سهلتها خدمات تسلسل الأمبليكون من BMKGene مع Illumina من خلال مجموعة منسقة من المنشورات.
دونغ، C. وآخرون. (2022) “التجميع والميكروبات الحيوية الأساسية ووظيفة تربة ريزوسفير وميكروبات اللحاء في Eucommia ulmoides”، الحدود في علم الأحياء الدقيقة، 13. دوى: 10.3389/FMICB.2022.855317/FULL.
لي، Y. وآخرون. (2023) "زرع اتحادات بكتيرية اصطناعية لعلاج التهاب المهبل البكتيري الناجم عن الغاردنريلة المهبلية في الفئران"، Microbiome، 11 (1)، ص 1-14. دوى: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. and Liu, H. (2022) 'الميكروبات من غبار الهواء التي تم جمعها أثناء تجربة دعم الحياة الحيوية المتجددة المغلقة على الأرض "Lunar Palace 365"، الميكروبات البيئية، 17(1)، ص. 1-20. دوى: 10.1186/S40793-022-00399-0/FIGURES/8.
يين، S. وآخرون. (2022) "وفرة الجينات الوظيفية المعتمدة على المواد الأولية والمتعلقة بتحويل النيتروجين، والتي تسيطر على فقدان النيتروجين في التسميد"، تكنولوجيا الموارد الحيوية، 361، ص. 127678. دوى: 10.1016/J.BIORTECH.2022.127678.
