የተቀነሰ ውክልና Bisulfite ቅደም ተከተል (RRBS)
የተቀነሰ ውክልና Bisulfite Sequencing (RRBS) በዲኤንኤ ሜቲሊየሽን ጥናት ውስጥ ከሙሉ ጂኖም Bisulfite Sequencing (WGBS) ጋር ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ ሆኖ ወጥቷል። WGBS ሙሉውን ጂኖም በአንድ የመሠረት ጥራት በመመርመር አጠቃላይ ግንዛቤዎችን ሲያቀርብ፣ ከፍተኛ ወጪው የሚገድብ ምክንያት ሊሆን ይችላል። RRBS የጂኖም ተወካይ ክፍልን በመምረጥ ይህንን ፈተና በዘዴ ይቀንሳል። ይህ ዘዴ በሲፒጂ ደሴት የበለጸጉ ክልሎችን በ MspI ስንጥቅ በማበልጸግ እና ከ200-500/600 bps ቁርጥራጮች መጠን ምርጫን ይከተላል። ስለዚህ፣ ለሲፒጂ ደሴቶች ቅርበት ያላቸው ክልሎች ብቻ በቅደም ተከተል የተቀመጡ ሲሆኑ፣ ሩቅ የሲፒጂ ደሴቶች ያላቸው ከመተንተን የተገለሉ ናቸው። ይህ ሂደት ከ bisulfite ቅደም ተከተል ጋር ተጣምሮ ከፍተኛ ጥራት ያለው የዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን ለመለየት ያስችላል, እና ቅደም ተከተል አቀራረብ, PE150, በተለይም ከመሃል ይልቅ በመክተቻዎቹ ጫፎች ላይ ያተኩራል, ይህም የሜቲላይዜሽን ፕሮፋይል ቅልጥፍናን ይጨምራል. RRBS በዋጋ ሊተመን የማይችል መሳሪያ ሲሆን ወጪ ቆጣቢ የዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን ምርምርን እና የኤፒጄኔቲክ ዘዴዎችን እውቀት ያሳድጋል።
የአገልግሎት ባህሪዎች
● የማጣቀሻ ጂኖም ያስፈልገዋል።
● ላምዳ ዲ ኤን ኤ የቢሰልፋይት መለዋወጥን ውጤታማነት ለመቆጣጠር ይጠቅማል።
● የ MspI የምግብ መፈጨት ቅልጥፍና ቁጥጥር ይደረግበታል።
● ለዕፅዋት ናሙናዎች ድርብ ኢንዛይም መፈጨት።
● በ Illumina NovaSeq ላይ ቅደም ተከተል.
የአገልግሎት ጥቅሞች
●ወጪ ቆጣቢ እና ቀልጣፋ አማራጭ ከ WGBS: ትንታኔው በዝቅተኛ ወጪ እና በዝቅተኛ ናሙና መስፈርቶች እንዲካሄድ ማስቻል።
●የተሟላ መድረክ፡ከናሙና ማቀነባበር፣ ቤተመፃህፍት ግንባታ እና ቅደም ተከተል እስከ ባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና ድረስ አንድ-ማቆም ጥሩ አገልግሎት መስጠት።
●ሰፊ ዕውቀትበ RRBS ተከታታይ ፕሮጄክቶች በተለያዩ ዝርያዎች በተሳካ ሁኔታ ተጠናቅቋል ፣ BMKGENE ከአስር ዓመታት በላይ ልምድ ፣ ከፍተኛ ችሎታ ያለው የትንታኔ ቡድን ፣ አጠቃላይ ይዘት እና ጥሩ የድህረ-ሽያጭ ድጋፍን ያመጣል።
የአገልግሎት ዝርዝሮች
| ቤተ መፃህፍት | የቅደም ተከተል ስልት | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት | የጥራት ቁጥጥር |
| MspI ተፈጭተው እና Bisulfite መታከም ቤተ መጻሕፍት | ኢሉሚና PE150 | 8 ጊባ | Q30 ≥ 85% የBisulfite ልወጣ > 99% MspI የመቁረጥ ውጤታማነት > 95% |
ናሙና መስፈርቶች
| ትኩረት (ng/µL) | ጠቅላላ መጠን (µg) |
| |
| ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ | ≥ 30 | ≥ 1 | የተገደበ መበላሸት ወይም ብክለት |
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
የሚከተለውን ትንታኔ ያካትታል።
● ጥሬ ቅደም ተከተል የጥራት ቁጥጥር;
● የማጣቀሻ ጂኖም ካርታ መስራት;
● የ 5mC methylated bases እና motif ለይቶ ማወቅ;
● የሜቲሌሽን ስርጭት እና የናሙና ንጽጽር ትንተና;
● የተለያየ የሜቲካል ክልሎች ትንተና (ዲኤምአር);
● ከዲኤምአር ጋር የተያያዙ ጂኖች ተግባራዊ ማብራሪያ።
የጥራት ቁጥጥር፡ የምግብ መፈጨት ቅልጥፍና (በጂኖም ካርታ ስራ)
የጥራት ቁጥጥር፡ bisulfite ልወጣ (በሜቲሌሽን መረጃ ማውጣት)
Methylation ካርታ፡ 5mC ሜቲሌሽን ጂኖም-ሰፊ ስርጭት
የናሙና ንጽጽር፡ ዋና አካል ትንተና
ልዩነት ሜቲላይትድ ክልሎች (ዲኤምአር) ትንተና፡ የሙቀት ካርታ
በ BMKGene አጠቃላይ የጂኖም ቢሰልፋይት ቅደም ተከተል አገልግሎቶች የተቀናጁ የሕትመቶችን ስብስብ በመጠቀም ያመቻቹትን የምርምር ግስጋሴዎች ያስሱ።
ሊ, ዜድ እና ሌሎች. (2022) በ CRISPR ማግበር እና በፓራክሪን ፋክተሮች ወደ ላይዲግ መሰል ህዋሶች ውስጥ ከፍተኛ ታማኝነት እንደገና ማደራጀት ፣PNAS Nexus፣ 1(4)። doi: 10.1093 / PNASNEXUS / PGAC179.
ቲያን, ኤች እና ሌሎች. (2023) በቻይንኛ ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ውስጥ ያለው የሰውነት ስብጥር ጂኖም-ሰፊ ዲ ኤን ኤ ሜቲላይዜሽን ትንተና ፣የአውሮፓ ጆርናል ክሊኒካዊ ምርመራ, 53 (11), ገጽ. እ14055. doi: 10.1111 / ECI.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'ዲ ኤን ኤ ሜቲላይሽን እና ከወገብ ወደ ዳሌ ጥምርታ፡ በቻይና ሞኖዚጎቲክ መንትዮች ላይ የተደረገ የኤፒጂኖም ሰፊ ማህበር ጥናት'፣ኢንዶክሪኖሎጂካል ምርመራ ጆርናል, 45 (12), ገጽ. 2365-2376. doi: 10.1007 / S40618-022-01878-4.
