-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ በሳይንሳዊ ፈጠራዎች ግንባር ቀደም ነው ፣ ይህም ተመራማሪዎች የቦታ አውድ ጠብቀው በቲሹዎች ውስጥ ወደ ውስብስብ የጂን አገላለጽ ዘይቤዎች እንዲገቡ ኃይል ይሰጣል። በተለያዩ መድረኮች መካከል፣ BMKGene BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chipን አዘጋጅቷል፣የተሻሻለ የ3.5µm ጥራትን በመኩራራት፣የሴሉላር ክልልን በመድረስ እና ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንብሮችን ማንቃት። ወደ 4 ሚሊዮን የሚጠጉ ቦታዎችን የያዘው S3000 ቺፕ ማይክሮዌል (ማይክሮዌል) በቦታ ባርኮድ የተቀረጹ የቀረጻ መመርመሪያዎች በተጫኑ ዶቃዎች ተሸፍኗል። በቦታ ባርኮዶች የበለፀገ የሲዲኤንኤ ቤተ-መጽሐፍት ከS3000 ቺፕ ተዘጋጅቶ በመቀጠል በኢሉሚና ኖቫ ሴክ መድረክ ላይ ተዘጋጅቷል። የቦታ ባርኮድ ናሙናዎች እና ዩኤምአይዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ልዩነት ያረጋግጣል። BMKManu S3000 ቺፕስ እጅግ በጣም ሁለገብ ነው፣ ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንጅቶችን ለተለያዩ ህብረ ህዋሶች እና ወደሚፈለጉት የዝርዝሮች ደረጃዎች በጥሩ ሁኔታ ማስተካከል ይችላል። ይህ የመላመድ ችሎታ ቺፑን ለተለያዩ የቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ጥናቶች ምርጥ ምርጫ አድርጎ ያስቀምጠዋል፣ ይህም ትክክለኛ የቦታ ስብስቦችን በትንሹ ጫጫታ ያረጋግጣል። የሕዋስ ክፍፍል ቴክኖሎጂን ከ BMKManu S3000 ጋር መጠቀም የጽሑፍ ግልባጭ መረጃን በሴሎች ወሰን ላይ መወሰን ያስችላል ፣ በዚህም ቀጥተኛ ባዮሎጂያዊ ትርጉም ያለው ትንታኔ ይሰጣል ። በተጨማሪም የተሻሻለው የS3000 ጥራት በአንድ ሴል የተገኙት ከፍተኛ የጂኖች እና UMIs ብዛት ያስገኛል፣ይህም የበለጠ ትክክለኛ የቦታ ግልባጭ ቅጦችን እና የሕዋሶችን ስብስብን ለመመርመር ያስችላል።
-
ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል
ባለአንድ ሕዋስ ቀረጻ እና ብጁ ቤተመፃህፍት ግንባታ ቴክኒኮችን ማሳደግ ከከፍተኛ ደረጃ ቅደም ተከተል ጋር ተዳምሮ በሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ ጥናቶችን አብዮቷል። ይህ ግኝት ውስብስብ የሕዋስ ህዝቦችን በጥልቀት እና በስፋት ለመመርመር ያስችላል, በሁሉም ሴሎች ላይ በአማካይ የጂን አገላለጽ ጋር የተያያዙ ውስንነቶችን በማለፍ እና በእነዚህ ህዝቦች ውስጥ ያለውን እውነተኛ ልዩነት ለመጠበቅ ያስችላል. ነጠላ ሕዋስ አር ኤን ኤ ተከታታይ (scRNA-seq) የማይካድ ጠቀሜታዎች ቢኖሩትም በተወሰኑ ቲሹዎች ውስጥ የአንድ ሴል እገዳ መፈጠር አስቸጋሪ እና ትኩስ ናሙናዎችን የሚፈልግ ከሆነ ተግዳሮቶች ያጋጥሙታል። በ BMKGene፣ ዘመናዊውን የ10X Genomics Chromium ቴክኖሎጂን በመጠቀም ነጠላ-ኒውክሊየስ አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል (snRNA-seq) በማቅረብ ይህንን መሰናክል እንፈታዋለን። ይህ አካሄድ በነጠላ ሴል ደረጃ ወደ ግልባጭ ትንተና የሚቀርቡትን የናሙናዎች ስፔክትረም ያሰፋል።
የኒውክሊየሎችን ማግለል በፈጠራው 10X Genomics Chromium ቺፕ፣ ባለ ስምንት ቻናል የማይክሮ ፍሎይዲክስ ስርዓት ባለ ሁለት ማቋረጫ መንገዶችን ያሳያል። በዚህ ስርዓት ውስጥ ባርኮዶችን፣ ፕሪመርን፣ ኢንዛይሞችን እና አንድ ኒውክሊየስን የሚያካትቱ ጄል ዶቃዎች በናኖላይተር መጠን ያላቸው የዘይት ጠብታዎች ውስጥ ተሸፍነዋል፣ Gel Bead-in-Emulsion (GEM) ይመሰርታሉ። የጂኢኤም ምስረታ ተከትሎ፣ የሴል ሊሲስ እና ባርኮድ መለቀቅ በእያንዳንዱ GEM ውስጥ ይከሰታሉ። በመቀጠል፣ mRNA ሞለኪውሎች 10X ባርኮዶችን እና ልዩ ሞለኪውላር መለያዎችን (UMIs) በማካተት ወደ ሲዲኤንኤዎች በግልባጭ ይገለበጣሉ። እነዚህ ሲዲኤንኤዎች በነጠላ ሴል ደረጃ የጂን አገላለጽ መገለጫዎችን ጠንካራ እና አጠቃላይ ፍለጋን በማመቻቸት ለመደበኛ ቅደም ተከተል ቤተ መፃህፍት ግንባታ ተዳርገዋል።
መድረክ፡ 10× ጂኖሚክስ Chromium እና Illumina NovaSeq Platform
-
10x ጂኖሚክስ ቪዚየም የቦታ ትራንስክሪፕት
ስፓሻል ትራንስክሪፕቶሚክስ ተመራማሪዎች የቦታ አውድ ጠብቀው በቲሹዎች ውስጥ ያሉትን የጂን አገላለጽ ዘይቤዎች እንዲመረምሩ የሚያስችል ቴክኖሎጂ ነው። በዚህ ጎራ ውስጥ አንድ ኃይለኛ መድረክ 10x Genomics Visium ከኢሉሚና ቅደም ተከተል ጋር ተጣምሮ ነው። የ 10X Visium መርህ የቲሹ ክፍሎች የሚቀመጡበት በተሰየመ የመያዣ ቦታ ባለው ልዩ ቺፕ ላይ ነው። ይህ የተቀረጸበት ቦታ ባርኮድ የተደረገባቸው ቦታዎች አሉት፣ እያንዳንዱም በቲሹ ውስጥ ካለው ልዩ የቦታ ቦታ ጋር ይዛመዳል። ከቲሹ ውስጥ የተያዙት አር ኤን ኤ ሞለኪውሎች በተገላቢጦሽ የመገልበጥ ሂደት ውስጥ በልዩ ሞለኪውላዊ መለያዎች (UMIs) ምልክት ይደረግባቸዋል። እነዚህ ባርኮድ የተደረገባቸው ቦታዎች እና ዩኤምአይዎች በአንድ ሴል ጥራት ትክክለኛ የቦታ ካርታ እና የጂን አገላለጽ መጠንን ያነቃሉ። የቦታ ባርኮድ ናሙናዎች እና ዩኤምአይዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ልዩነት ያረጋግጣል። ተመራማሪዎች ይህንን የስፔሻል ትራንስክሪፕቶሚክስ ቴክኖሎጂን በመጠቀም ስለ ሴሎች የቦታ አደረጃጀት እና በቲሹዎች ውስጥ ስለሚፈጠሩት ውስብስብ ሞለኪውላዊ መስተጋብር ጥልቅ ግንዛቤን ሊያገኙ ይችላሉ፣ ይህም ኦንኮሎጂን፣ ኒውሮሳይንስን፣ የእድገት ባዮሎጂን፣ ኢሚውኖሎጂን ጨምሮ በተለያዩ መስኮች ባዮሎጂያዊ ሂደቶችን በተመለከተ በዋጋ ሊተመን የማይችል ግንዛቤን ይሰጣል። , እና የእጽዋት ጥናቶች.
መድረክ: 10X Genomics Visium እና Illumina NovaSeq
