● ሁለት የኤክሶም ፓነሎች በዒላማ ማበልጸግ ላይ ተመስርተው ይገኛሉ፡ Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) እና xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)።
● በ Illumina NovaSeq ላይ ቅደም ተከተል.
● ባዮኢንፎርማቲክ የቧንቧ መስመር ወደ በሽታ ትንተና ወይም እጢ ትንተና የሚመራ።
●ዒላማ ፕሮቲን ኮድ ክልልየፕሮቲን ኮድ መስጫ ክልሎችን በመያዝ እና በቅደም ተከተል በመያዝ hWES ከፕሮቲን አወቃቀር ጋር የተያያዙ ልዩነቶችን ለማሳየት ይጠቅማል።
●ወጪ ቆጣቢ፡hWES በግምት 85% ከሰዎች በሽታ ጋር የተያያዘ ሚውቴሽን ከ 1% የሰው ልጅ ጂኖም ያመጣል.
●ከፍተኛ ትክክለኛነትበከፍተኛ ቅደም ተከተል ጥልቀት፣ hWES ሁለቱንም የተለመዱ ተለዋጮች እና ብርቅዬ ልዩነቶችን ከ1% በታች ድግግሞሾችን ለመለየት ያመቻቻል።
●ጥብቅ የጥራት ቁጥጥር: በሁሉም ደረጃዎች አምስት ዋና የመቆጣጠሪያ ነጥቦችን እንተገብራለን, ከናሙና እና ቤተመፃህፍት ዝግጅት እስከ ቅደም ተከተል እና ባዮኢንፎርማቲክስ. ይህ ጥንቃቄ የተሞላበት ክትትል በተከታታይ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን ውጤቶች ማድረስ ያረጋግጣል.
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና: የቧንቧ መስመራችን ከበሽታዎች ወይም ከዕጢ ትንተና ጋር በተያያዙ የጄኔቲክ ገጽታዎች ላይ ልዩ የምርምር ጥያቄዎችን ለመፍታት የተነደፈ የላቀ ትንታኔን ስለሚያካትት ወደ ማጣቀሻው ጂኖም ልዩነቶችን ከመለየት አልፏል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ;የእኛ ቁርጠኝነት ከፕሮጀክት መጠናቀቅ ባለፈ ከሽያጭ በኋላ ባለው የ3 ወር የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመፍታት የፕሮጀክት ክትትልን፣ መላ ፍለጋን እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የኤክሶን ቀረጻ ስትራቴጂ | የቅደም ተከተል ስልት | የሚመከር የውሂብ ውፅዓት |
እርግጠኛ ምረጥ Human All Exon v6 (Agilent) ወይም xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)
| ኢሉሚና NovaSeq PE150 | 5-10 ጊባ ለሜንዴሊያን መታወክ / ብርቅዬ በሽታዎች: > 50x ለዕጢ ናሙናዎች፡ ≥ 100x |
የናሙና ዓይነት
| መጠን(Qubit®)
| ትኩረት መስጠት | መጠን
| ንፅህና(NanoDrop™) |
ጂኖሚክ ዲ ኤን ኤ
| ≥ 50 ንግ | ≥ 6 ng/μL | ≥ 15 μl | OD260/280 = 1.8-2.0 መበላሸት, መበከል የለም
|
የ hWES-በሽታ ናሙናዎች ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔ የሚከተሉትን ያጠቃልላል
● የውሂብ ቅደም ተከተል QC
● የማጣቀሻ ጂኖም አሰላለፍ
● SNPs እና InDels መለየት
● የ SNPs እና InDels ተግባራዊ ማብራሪያ
ስለ ዕጢ ናሙናዎች ባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔ የሚከተሉትን ያጠቃልላል ።
● የውሂብ ቅደም ተከተል QC
● የማጣቀሻ ጂኖም አሰላለፍ
● SNPs፣ InDels እና somatic ልዩነቶችን መለየት
● የጀርም መስመር ልዩነቶችን መለየት
● ሚውቴሽን ፊርማዎች ትንተና
● በተግባራዊ ሚውቴሽን ላይ የተመሰረተ ድራይቭ ጂኖችን መለየት
● ሚውቴሽን ማብራሪያ በመድኃኒት ተጋላጭነት ደረጃ
● የተለያየ ትንተና - የንጽህና እና የፕሎይድ ስሌት
ውሂብ QC - የ Exome ቀረጻ ስታቲስቲክስ
ተለዋጭ መለያ - InDels
የላቀ ትንተና፡- አጥፊ SNPs/InDels መለየት እና ማሰራጨት – Circos plot
ዕጢ ትንተና-የሶማቲክ ሚውቴሽን መለየት እና ማከፋፈል - የሰርኮስ ሴራ
ዕጢ ትንተና: clonal lineages