Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ግባ

ምርቶች

Hi-C ላይ የተመሰረተ Chromatin መስተጋብር

Hi-C የጂኖሚክ ውቅረትን ለመያዝ የተነደፈ ዘዴ ነው ፕሮቢንግ በቅርበት ላይ የተመሰረቱ መስተጋብሮችን እና ከፍተኛ-ሂደትን ቅደም ተከተል በማጣመር። ዘዴው የተመሰረተው ክሮማቲን ከፎርማለዳይድ ጋር በማገናኘት ሲሆን በመቀጠልም የምግብ መፈጨት እና እንደገና በማዋሃድ በ covalently የተገናኙ ቁርጥራጮች ብቻ የሊጌሽን ምርቶችን ይፈጥራሉ። እነዚህን የሊጅንግ ምርቶች በቅደም ተከተል በማስቀመጥ የጂኖም 3D ድርጅትን ማጥናት ይቻላል. Hi-C በትንሹ የታሸጉትን (A ክፍልፋዮች፣ euchromatin) እና በይበልጥ ወደ ጽሁፍ ግልባጭ የመሆን ዕድላቸው ያላቸውን የጂኖም ክፍሎችን እና በይበልጥ የታሸጉትን ክልሎች (B ክፍሎች፣ Heterochromatin) ስርጭትን ለማጥናት ያስችላል። Hi-C በተጨማሪም ቶፖሎጂያዊ ተያያዥነት ያላቸው ጎራዎች (TADs)፣ የታጠፈ መዋቅር ያላቸውን እና ተመሳሳይ የአገላለጽ ዘይቤ ሊኖራቸው የሚችሉትን የጂኖም ክልሎች፣ እና chromatin loops፣ የዲኤንኤ ክልሎችን በፕሮቲኖች የተገጠሙ እና በፕሮቲኖች የተደረደሩትን ለመለየት ሊያገለግል ይችላል። ብዙውን ጊዜ በተቆጣጣሪ አካላት የበለፀገ። የ BMKGene ሃይ-ሲ ቅደም ተከተል አገልግሎት ተመራማሪዎች የጂኖም ቁጥጥርን እና በጤና እና በበሽታ ላይ ያለውን አንድምታ ለመረዳት አዳዲስ መንገዶችን በመክፈት የጂኖም ስፋቶችን እንዲመረምሩ ኃይል ይሰጣቸዋል።

ያግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ባዮኢንፎርማቲክስ

የማሳያ ውጤቶች

ተለይተው የቀረቡ ህትመቶች

የአገልግሎት ባህሪዎች

● በኢሉሚና ኖቫሴክ ላይ በPE150 ቅደም ተከተል ማስያዝ።

● አገልግሎት ከፎርማለዳይድ ጋር ለመገናኘት እና የዲኤንኤ እና ፕሮቲን መስተጋብርን ለመጠበቅ ከተመረቱ ኑክሊክ አሲዶች ይልቅ የቲሹ ናሙናዎችን ይፈልጋል።

● የ Hi-C ሙከራ የሚጣበቁትን ጫፎች በባዮቲን መገደብ እና መጨረሻ መጠገንን ያካትታል፣ በመቀጠልም ግንኙነቶቹን በመጠበቅ የተፈጠሩትን ጠፍጣፋ ጫፎች ክብ ማድረግ። ከዚያም ዲ ኤን ኤው በ streptavidin ዶቃዎች ይጎትታል እና ለቀጣይ የቤተመፃህፍት ዝግጅት ይጸዳል።

የአገልግሎት ጥቅሞች

●ምርጥ ገደብ የኢንዛይም ዲዛይንበተለያዩ ዝርያዎች ላይ እስከ 93% ትክክለኛ የመስተጋብር ጥንዶች ከፍተኛ የ Hi-C ቅልጥፍናን ለማረጋገጥ።

●ሰፊ ልምድ እና የህትመት መዝገቦች፡-BMKGene በ> 2000 Hi-C ተከታታይ ፕሮጀክቶች ከ 800 የተለያዩ ዝርያዎች እና የተለያዩ የፈጠራ ባለቤትነት ጋር ሰፊ ልምድ አለው. ከ900 በላይ የሆነ የተጠራቀመ ተፅዕኖ ያለው ከ100 በላይ የታተሙ ጉዳዮች።

●ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን፡በቤት ውስጥ የፈጠራ ባለቤትነት እና የሶፍትዌር የቅጂ መብቶች ለ Hi-C ሙከራዎች እና የውሂብ ትንተና እና በራስ-የተገነባ ምስላዊ መረጃ ሶፍትዌር።

●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ;የእኛ ቁርጠኝነት ከፕሮጀክት መጠናቀቅ ባለፈ ከሽያጭ በኋላ ባለው የ3 ወር የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመፍታት የፕሮጀክት ክትትልን፣ መላ ፍለጋን እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።

●አጠቃላይ ማብራሪያ: በርካታ የምርምር ፕሮጀክቶች ላይ ግንዛቤዎችን በመስጠት ጂኖቹን በተግባራዊ ሁኔታ ከተለዩ ልዩነቶች ጋር ለማብራራት እና ተዛማጅ የማበልጸጊያ ትንታኔዎችን ለማድረግ ብዙ የውሂብ ጎታዎችን እንጠቀማለን።

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ቤተ መፃህፍት

የቅደም ተከተል ስልት

የሚመከር የውሂብ ውፅዓት

ሃይ-ሲ ሲግናል ጥራት

ሃይ-ሲ ቤተ-መጽሐፍት

ኢሉሚና PE150

Chromatin loop: 150x

ታድ፡ 50x

Chromatin Loop: 10Kb

ታድ፡ 40 ኪባ

የአገልግሎት መስፈርቶች

የናሙና ዓይነት	የሚፈለገው መጠን
የእንስሳት ቲሹ	≥2ግ
ሙሉ ደም	≥2ml
ፈንገሶች	≥1ግ
ተክል - ወጣት ቲሹ	1g/aliquot፣2-4 aliquotes ይመከራል
ያደጉ ሕዋሳት	≥1x10⁷

ቀዳሚ፡ TGuide ስማርት መግነጢሳዊ ተክል አር ኤን ኤ ኪት

ቀጣይ፡- DNBSEQ አስቀድሞ የተሰሩ ቤተ-መጻሕፍት

የሚከተለውን ትንተና ያካትታል:

● ጥሬ መረጃ QC;

● የካርታ ስራ እና ሃይ-ሲ ቤተ-መጽሐፍት QC፡ ትክክለኛ የመስተጋብር ጥንዶች እና መስተጋብር የሚበላሹ ኤክስፖነንት (IDEs);

● የጂኖም-ሰፊ መስተጋብር መገለጫ፡ cis/trans analysis እና Hi-C መስተጋብር ካርታ;

● የ A / B ክፍል ስርጭት ትንተና;

● TADs እና chromatin loops መለየት;

● በናሙናዎች መካከል በ3D chromatin መዋቅር አካላት ላይ ልዩነት ትንተና እና ተያያዥ ጂኖች ተዛማጅ ተግባራዊ ማብራሪያ።

Cis እና ትራንስ ተመጣጣኝ ስርጭት

በናሙናዎች መካከል ያለው የክሮሞሶም ግንኙነት የሙቀት ካርታ

የ A/B ክፍሎች ጂኖም-ሰፊ ስርጭት

የ chromatin loops ጂኖም-ሰፊ ስርጭት

የ TAD ዎች እይታ

በBMKGene Hi-C ተከታታይ አገልግሎቶች የተቀናጁ የሕትመቶችን ስብስብ በመጠቀም ያመቻቹትን የምርምር ግስጋሴዎች ያስሱ።

ሜንግ, ቲ. እና ሌሎች. (2021) 'ንፅፅር የተቀናጀ የብዝሃ-omics ትንተና CA2ን ለ chordoma ልብ ወለድ ኢላማ አድርጎ ይለያል'፣ኒውሮ-ኦንኮሎጂ, 23 (10), ገጽ. 1709-1722. doi: 10.1093 / NEUONC / NOAB156.

Xu, L. et al. (2021) 'የ3D አለመደራጀት እና የጂኖም ማስተካከል ስለ NAFLD በሽታ አምጪ ተህዋሲያን በተቀናጀ Hi-C፣ Nanopore እና RNA sequecing'Acta Pharmaceutica ሲኒካ ቢ, 11 (10), ገጽ. 3150-3164. doi: 10.1016 / J.APSB.2021.03.022.