የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ
የአገልግሎት ጥቅሞች
ታካጊ እና ሌሎች.የእፅዋት መጽሔት, 2013
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክ ትንታኔ;የዝርያዎችን የዝግመተ ለውጥ አቅም የሚያንፀባርቀው የጄኔቲክ ልዩነት ግምትን ማስቻል እና አነስተኛ የተቀናጀ የዝግመተ ለውጥ እና ትይዩ የዝግመተ ለውጥ ተፅእኖ ባላቸው ዝርያዎች መካከል አስተማማኝ የፍየልጄኔቲክ ግንኙነትን ያሳያል።
●አማራጭ ብጁ ትንተናእንደ ኑክሊዮታይድ እና አሚኖ አሲዶች ደረጃ ላይ ባሉ ልዩነቶች ላይ በመመርኮዝ የልዩነት ጊዜ እና ፍጥነት ግምት።
●ሰፊ ልምድ እና የህትመት መዛግብትBMKGene በሕዝብ እና በዝግመተ ለውጥ የጄኔቲክስ ፕሮጄክቶች ውስጥ ከ15 ዓመታት በላይ ሰፊ ልምድ ያከማቻል፣ በሺዎች የሚቆጠሩ ዝርያዎችን ወዘተ የሚሸፍን እና በNature Communications፣ Molecular Plants፣ Plant Biotechnology Journal, etc. ላይ ታትሞ ከ1000 በላይ ከፍተኛ ፕሮጀክቶችን አበርክቷል።
● ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን እና አጭር የትንታኔ ዑደትበከፍተኛ የጂኖሚክስ ትንተና ጥሩ ልምድ ያለው የBMKGene ቡድን ፈጣን የመመለሻ ጊዜ ጋር አጠቃላይ ትንታኔዎችን ያቀርባል።
● የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ፡የእኛ ቁርጠኝነት ከፕሮጀክት መጠናቀቅ ባለፈ ከሽያጭ በኋላ ባለው የ3 ወር የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመፍታት የፕሮጀክት ክትትልን፣ መላ ፍለጋን እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የአገልግሎት መስፈርቶች እና መስፈርቶች
| የቅደም ተከተል አይነት | የሚመከር የህዝብ ብዛት | የቅደም ተከተል ስልት | ኑክሊዮታይድ መስፈርቶች |
| አጠቃላይ የጂኖም ቅደም ተከተል | ≥ 30 ግለሰቦች፣ ከእያንዳንዱ ንዑስ ቡድን ≥ 10 ግለሰቦች ጋር
| 10x | ትኩረት፡ ≥ 1 ng/µL ጠቅላላ መጠን≥ 30ng የተገደበ ወይም ምንም መበስበስ ወይም ብክለት የለም። |
| የተወሰነ-Locus Amplified Fragment (SLAF) | የመለያ ጥልቀት፡ 10x የመለያዎች ብዛት፡- <400 ሜባ፡ WGS ይመከራል <1Gb፡ 100ሺህ መለያዎች 1 ጊባ > 2ጂቢ፡ 300ሺህ መለያዎች ከፍተኛው 500k መለያዎች | ትኩረት ≥ 5ng/µL ጠቅላላ መጠን ≥ 80 ng ናኖድሮፕ OD260/280 = 1.6-2.5 Agarose gel: የለም ወይም የተገደበ መበላሸት ወይም መበከል
|
የአገልግሎት ሥራ ፍሰት
የሙከራ ንድፍ
ናሙና መላኪያ
የቤተ መፃህፍት ግንባታ
ቅደም ተከተል
የውሂብ ትንተና
ከሽያጭ በኋላ አገልግሎቶች
አገልግሎቱ የሕዝብን አወቃቀር (የሥርዓተ-ሥርዓት ዛፍ፣ ፒሲኤ፣ የሕዝብ ገለጻ ሰንጠረዥ)፣ የሕዝብ ብዝሃነት እና የሕዝብ ምርጫ (የግንኙነት አለመመጣጠን፣ ጠቃሚ ቦታዎችን መምረጥ) ትንታኔን ያካትታል። አገልግሎቱ ብጁ ትንታኔንም ሊያካትት ይችላል (ለምሳሌ የልዩነት ጊዜ፣ የጂን ፍሰት)።
*እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች ሁሉም በ BMKGENE የታተሙ ጂኖም ናቸው።
1.የዝግመተ ለውጥ ትንተና በጄኔቲክ ልዩነቶች ላይ የተመሰረተ የፍየልጂኔቲክ ዛፍ, የህዝብ አወቃቀር እና PCA ግንባታ ይዟል.
የፋይሎኔቲክ ዛፍ የጋራ ቅድመ አያት ባላቸው ዝርያዎች መካከል የታክስኖሚክ እና የዝግመተ ለውጥ ግንኙነቶችን ይወክላል።
PCA ዓላማው በንዑስ ሕዝብ መካከል ያለውን ቅርበት ለማየት ነው።
የህዝብ አወቃቀር በጄኔቲክ የተለየ ንዑስ-ሕዝብ በ allele frequencies ውስጥ መኖሩን ያሳያል።
ቼን ፣ ወዘተ. አል.ፒኤንኤኤስ, 2020
2.የተመረጠ መጥረግ
የተመረጠ መጥረግ የሚያመለክተው ጠቃሚ ቦታ የሚመረጥበት እና የተገናኙት ገለልተኛ ጣቢያዎች ድግግሞሾች የሚጨመሩበት እና ያልተገናኙ ድረ-ገጾች የሚቀነሱበት ሂደት ሲሆን ይህም ክልላዊ እንዲቀንስ ያደርጋል።
በተመረጡ ጠረጋ ክልሎች ላይ ጂኖም-ሰፊ ማወቂያ የሚከናወነው በተወሰነ ደረጃ (10 ኪባ) ውስጥ የሁሉንም SNPs የህዝብ ጀነቲካዊ መረጃ ጠቋሚ (π, Fst, Tajima's D) በማስላት ነው.
የኑክሊዮታይድ ልዩነት (π)
የታጂማ ዲ
የመጠገን መረጃ ጠቋሚ (ኤፍኤስ)
Wu፣ et. አል.ሞለኪውላዊ ተክል, 2018
3.የጂን ፍሰት
Wu፣ et. አል.ሞለኪውላዊ ተክል, 2018
4. የስነሕዝብ ታሪክ
ዣንግ፣ ወዘተ. አል.ተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021
5.Divergence ጊዜ
ዣንግ፣ ወዘተ. አል.ተፈጥሮ ኢኮሎጂ እና ዝግመተ ለውጥ, 2021
በBMKGene የዝግመተ ለውጥ ጀነቲክስ አገልግሎቶች በተዘጋጁ የሕትመቶች ስብስብ አማካኝነት ያመቻቹትን እድገቶች ያስሱ፡
ሀሰንያር፣ ኤኬ እና ሌሎች (2023) 'የ SNP ሞለኪውላር ማርከሮች እና እጩ ጂኖች ከሳክብሮድ ቫይረስ መቋቋም ጋር የተቆራኙ በApis cerana cerana Larvae በጠቅላላ ጂኖም ሪሴኬሲንግ'፣የሞለኪውላር ሳይንስ ዓለም አቀፍ ጆርናል24(7)። doi: 10.3390 / IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) 'የዱር ፣ በጄኔቲክ ንፁህ የቻይናውያን ግዙፍ ሳላማንደር ግኝት አዲስ የጥበቃ እድሎችን ይፈጥራል'የእንስሳት ምርምር, 2022, ጥራዝ. 43፣ ቁጥር 3፣ ገጾች፡ 469-480፣ 43(3)፣ ገጽ 469–480። doi: 10.24272 / J.ISSN.2095-8137.2022.101.
ሃን, ኤም እና ሌሎች. (2022) 'የፊሎጂዮግራፊያዊ ንድፍ እና የህዝብ ዝግመተ ለውጥ ታሪክ ተወላጁ ኤሊመስ ሲቢሪከስ L. በ Qinghai-Tibet Plateau ላይ'፣በዕፅዋት ሳይንስ ውስጥ ድንበር, 13, ገጽ. 882601. doi: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX.
ዋንግ, ጄ እና ሌሎች. (2022) 'ከክሮሞሶም-ደረጃ ጂኖም ስብስብ እና የ Longan accessions የህዝብ ጂኖም ወደ ሎንግአን ዝግመተ ለውጥ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች'፣የሆርቲካልቸር ምርምር, 9. doi: 10.1093 / HR / UHAC021.
