●መድረኮች፡Illumina NovaSeq 6000 እና NovaSeq X Plus
●የቅደም ተከተል ሁነታዎች፡-PE150 እና PE250
●ከመስተካከሉ በፊት የቤተ-መጻህፍት ጥራት ቁጥጥር
●የውሂብ ቅደም ተከተል QC እና ማድረስ፡የQC ሪፖርት እና ጥሬ መረጃን በፈጣን ፎርማት ማድረስ እና Q30 ን ከተነበበ በኋላ ከዲmultiplexing እና ከተጣራ በኋላ
●የቅደም ተከተል አገልግሎቶች ሁለገብነት፡-ደንበኛው በሌይን፣ በፍሰት ሴል ወይም በሚፈለገው የውሂብ መጠን (የከፊል መስመር ቅደም ተከተል) ቅደም ተከተል መምረጥ ይችላል።
●በኢሉሚና ተከታታይ መድረክ ላይ ሰፊ ልምድ፡-ከተለያዩ ዝርያዎች ጋር በሺዎች ከሚቆጠሩ የተዘጉ ፕሮጀክቶች ጋር.
●የቅደም ተከተል QC ሪፖርት ማድረስ፡-በጥራት መለኪያዎች, የውሂብ ትክክለኛነት እና አጠቃላይ የቅደም ተከተል ፕሮጀክት አፈፃፀም.
●የበሰለ ቅደም ተከተል ሂደት;ከአጭር የማዞሪያ ጊዜ ጋር።
●ጥብቅ የጥራት ቁጥጥርበተከታታይ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን ውጤቶች ለማስረከብ ጥብቅ የ QC መስፈርቶችን እንተገብራለን።
መድረክ | የወራጅ ሕዋስ | ቅደም ተከተል ሁነታ | ክፍል | የሚገመተው ውጤት |
ኖቫሴክ ኤክስ | 10ቢ (8 መስመሮች) | ፒኢ150 | ነጠላ መስመር ከፊል መስመር | 375Gb/ሌን |
25B (8 መስመሮች) | ፒኢ150 | ነጠላ መስመር ከፊል መስመር | 1000 ጊባ/ሌን | |
ኖቫሴክ 6000 | SP ፍሰት ሕዋስ (2 መስመሮች) | ፒኢ250 | የወራጅ ሕዋስ ነጠላ መስመር ከፊል መስመር | 325-400 M ያነባል / ሌን |
S4 ወራጅ ሕዋስ (4 መስመሮች) | ፒኢ150 | የወራጅ ሕዋስ ነጠላ መስመር ከፊል መስመር | ~ 800 ጊባ / ሌይን |
የውሂብ መጠን (X) | ትኩረት (qPCR/nM) | መጠን | |
ከፊል ሌይን ቅደም ተከተል
| X ≤ 10 ጊባ | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
10 ጊባ <X ≤ 50 ጊባ | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
50 ጊባ <X ≤ 100 ጊባ | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
X > 100 ጊባ | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
የሌይን ቅደም ተከተል | በሌይን | ≥ 1.5 nM/የላይብረሪ ገንዳ | ≥ 25 μl / የቤተ መፃህፍት ገንዳ |
ከትኩረት እና ከጠቅላላው መጠን በተጨማሪ ተስማሚ የሆነ ከፍተኛ ንድፍ ያስፈልጋል.
ማስታወሻ፡ የዝቅተኛ ስብጥር ቤተ-መጻሕፍት የሌይን ቅደም ተከተል ጠንካራ የመሠረት ጥሪን ለማረጋገጥ PhiX spike-in ያስፈልገዋል።
በቅድሚያ የተዋሃዱ ቤተ-መጻሕፍት እንደ ናሙና እንዲያቀርቡ እንመክራለን። BMKGENE የቤተ መፃህፍት መዋሃድ ለመስራት ከፈለጉ፣ እባክዎን ይመልከቱ
ለከፊል ሌይን ቅደም ተከተል የቤተ-መጻህፍት መስፈርቶች.
ዋናው ጫፍ ከ300-450 ቢፒፒ ውስጥ መሆን አለበት።
ቤተ-መጻሕፍት አንድ ዋና ጫፍ፣ ምንም የአስማሚ ብክለት እና የፕሪመር ዲመሮች መኖር የለባቸውም።
የቤተ መፃህፍቱ ጥራት ላይ ሪፖርት ከመደረጉ በፊት፣ የቤተ መፃህፍቱን መጠን ከመገምገም እና ከመከፋፈል በፊት ቀርቧል።
ሠንጠረዥ 1. መረጃን በቅደም ተከተል በተመለከተ ስታትስቲክስ.
የናሙና መታወቂያ | BMKID | ጥሬ ያነባል። | ጥሬ ውሂብ (ቢፒ) | ንጹህ ንባቦች (%) | Q20(%) | Q30(%) | ጂሲ(%) |
ሲ_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
ሲ_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
ምስል 1. በእያንዳንዱ ናሙና ውስጥ የተነበበ የጥራት ስርጭት
ምስል 2. የመሠረት ይዘት ስርጭት
ምስል 3. የተነበበ ይዘቶችን በቅደም ተከተል ውሂብ ማሰራጨት