●ሰፊ ልምድ እና የህትመት መዛግብትBMKGene ከተጠራቀመ ጋር ከ90 በላይ የንፅፅር ጂኖሚክስ ፕሮጄክቶችን ያጠናቀቀ ሲሆን ድምር ውጤት 900 ደርሷል።
●አጠቃላይ የባዮኢንፎርማቲክስ ትንተና: የትንታኔዎች ጥቅል ስምንት በጣም የተለመዱ ትንታኔዎችን ይዟል, በጥሩ ሁኔታ የተነደፉ ለህትመት ዝግጁ የሆኑ አሃዞችን ያቀርባል እና ውጤቶቹን በቀላሉ እንዲተረጎም ያስችላል.
●ከፍተኛ ችሎታ ያለው የባዮኢንፎርማቲክስ ቡድን እና አጭር የትንታኔ ዑደትበንፅፅር ጂኖሚክስ ትንተና ጥሩ ልምድ ያለው ፣የ BMKGene ቡድን በአጭር ጊዜ ውስጥ የተለያዩ ግላዊ ትንተና ፍላጎቶችን ያሟላል።
●የድህረ-ሽያጭ ድጋፍ;የእኛ ቁርጠኝነት ከፕሮጀክት መጠናቀቅ ባለፈ ከሽያጭ በኋላ ባለው የ3 ወር የአገልግሎት ጊዜ ይዘልቃል። በዚህ ጊዜ ከውጤቶቹ ጋር የተያያዙ ማንኛቸውም ጥያቄዎችን ለመፍታት የፕሮጀክት ክትትልን፣ መላ ፍለጋን እና የጥያቄ እና መልስ ክፍለ ጊዜዎችን እናቀርባለን።
የተገመተው የማዞሪያ ጊዜ | የዝርያዎች ብዛት | ይተነትናል። |
30 የስራ ቀናት | 6 - 12 | የጂን ቤተሰብ ስብስብ የጂን ቤተሰብ መስፋፋት እና መኮማተር የፋይሎኔቲክ ዛፍ ግንባታ የልዩነት ጊዜ ግምት(የቅሪተ አካል ልኬት ያስፈልጋል) LTR ማስገቢያ ጊዜ (ለእፅዋት) ሙሉ ጂኖም ብዜት (ለእፅዋት) የተመረጠ ግፊት የሲንታይን ትንተና |
● የጂን ቤተሰብ
● ፊሎሎጂኔቲክስ
● የመለያየት ጊዜ
● የተመረጠ ግፊት
● የሲንታይን ትንተና
ለቲሹ
ዝርያዎች | ቲሹ | የዳሰሳ ጥናት | PacBio CCS |
እንስሳ | Visceral ቲሹ | 0.5 ~ 1 ግ | ≥ 3.5 ግ |
የጡንቻ ሕዋስ | |||
≥ 5.0 ግ | |||
≥ 5.0 ሚሊ ሊትር | |||
የአጥቢ እንስሳት ደም | |||
≥ 0.5 ሚሊ ሊትር | |||
የዶሮ እርባታ / የዓሳ ደም | |||
ተክል | ትኩስ ቅጠል | 1 ~ 2 ግ | ≥ 5.0 ግ |
ፔታል/ግንድ | 1 ~ 2 ግ | ≥ 10.0 ግ | |
ሥር/ ዘር | 1 ~ 2 ግ | ≥ 20.0 ግ | |
ሕዋሳት | የዳበረ ሕዋስ | - | ≥ 1 x 108 |
የጂኖም ቅደም ተከተል ፋይሎች (.ፋስታ) እና የማብራሪያ ፋይሎች (.gff3) በቅርብ ተዛማጅ ዝርያዎች
*እዚህ የሚታዩት የማሳያ ውጤቶች ሁሉም በባዮማርከር ቴክኖሎጂዎች የታተሙ ጂኖም ናቸው።
1.LTR የማስገባት ጊዜ ግምት፡- ስዕሉ ከሌሎች ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር በ LTR-RTs ውስጥ ልዩ የሆነ የቢሞዳል ስርጭት በWeining Rye ጂኖም ውስጥ ያሳያል። በጣም የቅርብ ጊዜ ከፍተኛው ከ 0.5 ሚሊዮን ዓመታት በፊት ታየ።
ሊ ጓንግ እና ሌሎች.የተፈጥሮ ጄኔቲክስ, 2021
2. ቻዮቴ (ሴቺየም ኢዱሌ) ላይ ፊሎጅኒ እና የጂን ቤተሰብ ትንታኔ፡- ቻዮት እና ሌሎች 13 ተዛማጅ ዝርያዎችን በጂን ቤተሰብ ውስጥ በመተንተን ቻዮት ከእባቡ ጎደር (Trichosanthes anguina) ጋር በጣም የተቆራኘ ሆኖ ተገኝቷል። በ27-45 ማያ አካባቢ ከእባቡ ጓድ የተገኘ ቻዮት እና ሙሉ የጂኖም ብዜት(WGD) በ25±4 ማያ ውስጥ በቻዮት ታይቷል፣ይህም በcucuibitaceae ሶስተኛው የWGD ክስተት ነው።
ፉ ኤ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021
3.Synteny ትንተና: ፍሬ ልማት ውስጥ phytohormones ጋር የተያያዙ አንዳንድ ጂኖች chayote, እባብ ጎርድ እና ስኳሽ ውስጥ ተገኝተዋል. በቻይዮት እና በስኩዊድ መካከል ያለው ዝምድና በ chayote እና በእባብ ጎመን መካከል ካለው ትንሽ ከፍ ያለ ነው።
ፉ ኤ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021
4.Gene ቤተሰብ ትንተና፡- የ KEGG የጂን ቤተሰብ መስፋፋት እና መኮማተር በG.thurberi እና G.davidsonii ጂኖም ውስጥ የስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ እና ብራሲኖስቴሮይድ ባዮሲንተሲስ ተዛማጅ ጂኖች መስፋፋታቸውን ያሳያል።
ያንግ ዚ እና ሌሎች፣BMC ባዮሎጂ, 2021
5.ሙሉ የጂኖም ብዜት ትንተና፡- 4DTV እና Ks ስርጭት ትንተና ሙሉ የጂኖም ብዜት ክስተት አሳይቷል። የተባዛ ክስተቶች ታይተዋል። የልዩነት ክውነቶች የታዩት የኢንተርስፔይሲዎች ጫፎች። ትንታኔው እንደሚያመለክተው ከሌሎቹ ሦስት የቅርብ ተዛማጅነት ያላቸው ዝርያዎች ጋር ሲነጻጸር፣ O. europaea በቅርቡ ትልቅ የጂን ብዜት ውስጥ እንደገባ ነው።
ራኦ ጂ እና ሌሎችየሆርቲካልቸር ምርምር, 2021
BMK መያዣ
ሮዝ ያለ ፕሪክል፡- ከእርጥበት መላመድ ጋር የተገናኘ የጂኖሚክ ግንዛቤዎች
የታተመ ብሔራዊ ሳይንስ ግምገማ, 2021
የቅደም ተከተል ስልት፡
' ባሴእሾህ የሌለው(አር.ዊቹራይናን) ጂኖም;
በግምት. 93 X PacBio + በግምት። 90 X ናኖፖር + 267 X ኢሉሚና
ቁልፍ ውጤቶች
1.ከፍተኛ ጥራት ያለው R.wichuraiana ጂኖም የተገነባው ለረጅም ጊዜ የተነበበ ተከታታይ ቴክኒኮችን በመጠቀም ሲሆን ይህም 530.07 ሜጋ ባይት (የተገመተው የጂኖም መጠን 525.9 ሜባ በፍሰት ሳይቶሜትሪ እና 525.5 በጂኖም ዳሰሳ ነበር; Heterozygosity 1.03%) ነበር. BUSCO ግምት 93.9 በመቶ ነበር። ከ "አሮጌው ብሉሽ" (haploOB) ጋር በማነፃፀር, የዚህ ጂኖም ጥራት እና ሙሉነት በመነሻ ነጠላ-ቤዝ ትክክለኛነት እና LTR የመገጣጠሚያ መረጃ ጠቋሚ (LAI=20.03) ተረጋግጧል. R.wichuraiana ጂኖም 32,674 የፕሮቲን ኮድ ጂኖች ይዟል።
2.Multi-omics መገጣጠሚያ ትንተና፣ ንፅፅር ጂኖሚክስ፣ ትራንስክሪፕቶሚክስ፣ QTL የጄኔቲክ ህዝብ ትንታኔን ያካተተ፣ በ R. wichuraiana እና Rosa chinensis መካከል ያለውን ወሳኝ ልዩነት አሳይቷል። እንዲሁም፣ በQTL ውስጥ ያሉ ተዛማጅ ጂኖች አገላለጽ ከግንድ ፕሪክል ጥለት ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።
በ Basye's Thornless እና Rosa chinensis መካከል ያለው የንፅፅር ጂኖሚክስ ሲንተኒ ትንተና፣ የጂን ቤተሰብ ክላስተር፣ የማስፋፊያ እና የመቀነስ ትንተናን ጨምሮ በጽጌረዳዎች ውስጥ ካሉት ወሳኝ ባህሪያት ጋር የተያያዙ ብዙ ልዩነቶችን አሳይቷል። በNAC እና FAR1/FRS የጂን ቤተሰብ ውስጥ ያለው ልዩ መስፋፋት ከጥቁር ቦታ መቋቋም ጋር የተያያዘ ሊሆን ይችላል።
በ BT እና haploOB ጂኖም መካከል ያለው የንፅፅር ጂኖሚክስ ትንተና።
Zhong, M., እና ሌሎች. "ከእርጥበት መላመድ ጋር የተገናኘ ሮዝ ያለ ፕሪክል: የጂኖሚክ ግንዛቤዎች"ብሔራዊ ሳይንስ ግምገማ, 2021;, nwab092.