Exclusive Agency for Korea

BMKCloud ግባ

ምርቶች

BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome

የመገኛ ቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ በሳይንሳዊ ፈጠራዎች ግንባር ቀደም ነው ፣ ይህም ተመራማሪዎች የቦታ አውድ ጠብቀው በቲሹዎች ውስጥ ወደ ውስብስብ የጂን አገላለጽ ዘይቤዎች እንዲገቡ ኃይል ይሰጣል። በተለያዩ መድረኮች መካከል፣ BMKGene BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chipን አዘጋጅቷል፣የተሻሻለ የ3.5µm ጥራትን በመኩራራት፣የሴሉላር ክልልን በመድረስ እና ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንብሮችን ማንቃት። ወደ 4 ሚሊዮን የሚጠጉ ቦታዎችን የያዘው S3000 ቺፕ ማይክሮዌል (ማይክሮዌል) በቦታ ባርኮድ የተቀረጹ የቀረጻ መመርመሪያዎች በተጫኑ ዶቃዎች ተሸፍኗል። በቦታ ባርኮዶች የበለፀገ የሲዲኤንኤ ቤተ-መጽሐፍት ከS3000 ቺፕ ተዘጋጅቶ በመቀጠል በኢሉሚና ኖቫ ሴክ መድረክ ላይ ተዘጋጅቷል። የቦታ ባርኮድ ናሙናዎች እና ዩኤምአይዎች ጥምረት የተፈጠረውን መረጃ ትክክለኛነት እና ልዩነት ያረጋግጣል። BMKManu S3000 ቺፕስ እጅግ በጣም ሁለገብ ነው፣ ባለብዙ ደረጃ ጥራት ቅንጅቶችን ለተለያዩ ህብረ ህዋሶች እና ወደሚፈለጉት የዝርዝሮች ደረጃዎች በጥሩ ሁኔታ ማስተካከል ይችላል። ይህ የመላመድ ችሎታ ቺፑን ለተለያዩ የቦታ ትራንስክሪፕቶሚክስ ጥናቶች ምርጥ ምርጫ አድርጎ ያስቀምጠዋል፣ ይህም ትክክለኛ የቦታ ስብስቦችን በትንሹ ጫጫታ ያረጋግጣል። የሕዋስ ክፍፍል ቴክኖሎጂን ከ BMKManu S3000 ጋር መጠቀም የጽሑፍ ግልባጭ መረጃን በሴሎች ወሰን ላይ መወሰን ያስችላል ፣ በዚህም ቀጥተኛ ባዮሎጂያዊ ትርጉም ያለው ትንታኔ ይሰጣል ። በተጨማሪም የተሻሻለው የS3000 ጥራት ከፍተኛ ቁጥር ያላቸውን ጂኖች እና UMIs በአንድ ሴል የተገኙ ሲሆን ይህም የቦታ ግልባጭ ንድፎችን እና የሕዋሶችን ስብስብ የበለጠ ትክክለኛ ትንታኔ እንዲኖር ያስችላል።

ያግኙን

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ባዮኢንፎርማቲክስ

የማሳያ ውጤቶች

በ S3000 እና S1000 መካከል ያሉ ልዩነቶች

BMKMANU S3000 የቦታ ትራንስክሪፕት ቴክኒካል እቅድ

ባህሪያት

ጥራት፡ 3.5µM

- ስፖት ዲያሜትር: 2.5 µM

- የቦታዎች ብዛት: በግምት 4 ሚሊዮን

- 3 የሚቀረጹ የአካባቢ ቅርጸቶች፡ 6.8 ሚሜ * 6.8 ሚሜ፣ 11 ሚሜ * 11 ሚሜ ወይም 15 ሚሜ * 20 ሚሜ

- እያንዳንዱ ባርኮድ ዶቃ በ 4 ክፍሎች የተውጣጡ ፕሪመር ተጭኗል።

• ፖሊ(ዲቲ) ጅራት ለኤምአርኤን ፕሪሚንግ እና ሲዲኤንአ ውህደት፣

• የማጉላት አድሏዊነትን ለማስተካከል ልዩ ሞለኪውላር መለያ (UMI)

• የቦታ ባርኮድ

• ከፊል ንባብ 1 ተከታታይ ፕሪመር አስገዳጅ ቅደም ተከተል

- H&E እና ክፍሎች መካከል ፍሎረሰንት ቀለም

- የሕዋስ ክፍፍል ቴክኖሎጂን የመጠቀም ዕድል፡ የH&E ቀለም ውህደት፣ የፍሎረሰንት ቀለም እና አር ኤን ኤ ቅደም ተከተል የእያንዳንዱን ሕዋስ ወሰን ለመወሰን እና ለእያንዳንዱ ሕዋስ የጂን መግለጫን በትክክል መመደብ። በሴል ቢን ላይ የተመሰረተ የታችኛው የቦታ መገለጫ ትንታኔን በማካሄድ ላይ።

- ባለብዙ ደረጃ ጥራት ትንተናን ለማሳካት የሚቻል፡ ተለዋዋጭ ባለ ብዙ ደረጃ ትንተና ከ 100um እስከ 3.5 um ድረስ የተለያዩ የቲሹ ባህሪያትን በጥሩ ጥራት ለመፍታት።

የ BMKMANU S3000 ጥቅሞች

-የተያዙ ቦታዎች በእጥፍ ወደ 4 ሚሊዮን: በተሻሻለ የ 3.5 uM ጥራት, ወደ ከፍተኛ ጂን እና UMI በአንድ ሴል ውስጥ እንዲገኝ ያደርጋል. ይህ በጽሑፍ ግልባጭ መገለጫዎች ላይ ተመስርተው የተሻሻሉ የሕዋስ ስብስቦችን ያስገኛል፣ ከቲሹዎች አወቃቀሩ ጋር የሚዛመድ በጣም ጥሩ ዝርዝር።

- ንዑስ-ሴሉላር ጥራት;እያንዳንዱ የተቀረጸ ቦታ>2 ሚሊዮን የስፔሻል ባርኮድ ስፖትስ በ2.5µm ዲያሜትር እና በቦታ ማዕከሎች መካከል ያለው የ 5 μm ክፍተት፣የቦታ ግልባጭ ትንተና በንዑስ ሴሉላር ጥራት (5 μm) ያስችላል።

-ባለብዙ-ደረጃ ጥራት ትንተና;ከ100 μm እስከ 5 μm የሚደርስ ተለዋዋጭ ባለብዙ ደረጃ ትንተና የተለያዩ የቲሹ ባህሪያትን በጥሩ ጥራት ለመፍታት።

-የ"ሶስት በአንድ ስላይድ" የሕዋስ ክፍፍል ቴክኖሎጂን የመጠቀም ዕድል፡-በአንድ ስላይድ ላይ የፍሎረሰንት ቀለም፣ የH&E ቀለም እና የአር ኤን ኤ ቅደም ተከተል በማጣመር የእኛ "ሶስት በአንድ" የትንታኔ ስልተ-ቀመር ለቀጣይ ሴል ላይ ለተመሰረቱ ትራንስክሪፕቶሚክስ የሕዋስ ወሰኖችን የመለየት ኃይል ይሰጣል።

-ከብዙ ተከታታይ መድረኮች ጋር ተኳሃኝ: ሁለቱም NGS እና ረጅም-የተነበበ ቅደም ተከተል ይገኛሉ።

-የ1-8 ንቁ የመያዣ ቦታ ተለዋዋጭ ንድፍየተቀረፀው ቦታ መጠን ተለዋዋጭ ነው ፣ 3 ቅርፀቶችን መጠቀም ይቻላል (6.8 ሚሜ * 6.8 ሚሜ ፣ 11 ሚሜ * 11 ሚሜ እና 15 ሚሜ * 20 ሚሜ)

-አንድ-ማቆሚያ አገልግሎትክሪዮ-ሴክሽን፣ ቀለም መቀባት፣ የቲሹ ማመቻቸት፣ የቦታ ባርኮዲንግ፣ የቤተ መፃህፍት ዝግጅት፣ ቅደም ተከተል እና ባዮኢንፎርማቲክስን ጨምሮ ሁሉንም ልምድ እና በክህሎት ላይ የተመሰረቱ እርምጃዎችን ያዋህዳል።

-አጠቃላይ ባዮኢንፎርማቲክስ እና ለተጠቃሚ ምቹ የውጤቶች እይታ፡ጥቅሉ 29 ትንታኔዎችን እና 100+ ከፍተኛ ጥራት ያላቸውን አሃዞች ያካትታል፣ ከውስጣዊ የተሻሻለ ሶፍትዌር አጠቃቀም ጋር ተዳምሮ የሕዋስ ክፍፍልን እና የቦታ ክላስተርን ለማየት እና ለማበጀት።

-ብጁ የመረጃ ትንተና እና እይታለተለያዩ የምርምር ጥያቄዎች ይገኛል።

-ከፍተኛ ችሎታ ያለው የቴክኒክ ቡድንሰው፣ አይጥ፣ አጥቢ እንስሳ፣ አሳ እና እፅዋትን ጨምሮ ከ250 በላይ የቲሹ አይነቶች እና 100+ ዝርያዎች ልምድ ያለው።

-በጠቅላላው ፕሮጀክት ላይ የእውነተኛ ጊዜ ዝመናዎች: የሙከራ እድገትን ሙሉ ቁጥጥር በማድረግ.

-አማራጭ የጋራ ትንተና ከአንድ-ሴል mRNA ቅደም ተከተል ጋር

የአገልግሎት ዝርዝሮች

ናሙና መስፈርቶች

ቤተ መፃህፍት

የቅደም ተከተል ስልት

ውሂብ ይመከራል

የጥራት ቁጥጥር

በ OCT-የተከተቱ ክሪዮ ናሙናዎች

(የተሻለ ዲያሜትር: በግምት.

6×6×6 ሚሜ³)

በአንድ ናሙና 2 ብሎኮች

1 ለሙከራ፣ 1 ለመጠባበቂያ

S3000 ሲዲኤንኤ ላይብረሪ

ኢሉሚና ፒኢ150

160K PE በ100υM (250 ጊባ) ይነበባል

RIN > 7

ስለ ናሙና ዝግጅት መመሪያ እና የአገልግሎት የስራ ሂደት ለበለጠ ዝርዝር፣ እባክዎን ለማነጋገር ነፃነት ይሰማዎ ሀBMKGENE ባለሙያ

የአገልግሎት ሥራ ፍሰት

በናሙና ዝግጅት ደረጃ ከፍተኛ ጥራት ያለው አር ኤን ኤ ማግኘት መቻሉን ለማረጋገጥ የመጀመሪያ ደረጃ የጅምላ አር ኤን ኤ ማውጣት ሙከራ ይካሄዳል። በቲሹ ማመቻቸት ደረጃ ክፍሎቹ ቀለም የተቀቡ እና የሚታዩ ናቸው እና ኤምአርኤን ከቲሹ ውስጥ ለመልቀቅ የመተላለፊያ ሁኔታዎች ይሻሻላሉ። ከዚያም የተመቻቸ ፕሮቶኮል በቤተ መፃህፍት ግንባታ ወቅት ይተገበራል፣ ከዚያም ቅደም ተከተል እና የውሂብ ትንተና ይከተላል።

የተሟላው የአገልግሎት የስራ ፍሰት ምላሽ ሰጪ የግብረመልስ ዑደትን ለመጠበቅ፣ የፕሮጀክት አፈፃፀምን ለስላሳ ጊዜ ለማረጋገጥ የእውነተኛ ጊዜ ማሻሻያዎችን እና የደንበኛ ማረጋገጫዎችን ያካትታል።

ቀዳሚ፡ DNBSEQ አስቀድሞ የተሰሩ ቤተ-መጻሕፍት

ቀጣይ፡-

በ BMKMANU S3000 የመነጨው መረጃ የሚተነተነው በሶፍትዌሩ "BSTMatrix" ነው፣ እሱም በራሱ በ BMKGENE የተነደፈ፣ የሕዋስ ደረጃ እና ባለብዙ ደረጃ ጥራት የጂን ኤክስፕሬሽን ማትሪክስ። ከዚህ በመነሳት የመረጃ ጥራት ቁጥጥር፣ የውስጠ-ናሙና ትንተና እና የቡድን ትንተናን ያካተተ መደበኛ ሪፖርት ተፈጥሯል።

- የውሂብ ጥራት ቁጥጥር;

- የውሂብ ውፅዓት እና የጥራት ውጤት ስርጭት

- በየቦታው ጂን መለየት

- የሕብረ ሕዋስ ሽፋን

- የውስጠ-ናሙና ትንተና;

- የጂን ብልጽግና

- የቦታ ስብስብ፣ የተቀነሰ የልኬት ትንታኔን ጨምሮ

- በክላስተር መካከል ያለው ልዩነት አገላለጽ ትንተና-አመልካች ጂኖችን መለየት

- ተግባራዊ ማብራሪያ እና የጠቋሚ ጂኖች ማበልጸግ

- የቡድን ትንተና

- ከሁለቱም ናሙናዎች (ለምሳሌ የታመሙ እና ቁጥጥር) እና እንደገና ክላስተር ነጠብጣቦችን እንደገና ማዋሃድ

- ለእያንዳንዱ ዘለላ የጠቋሚ ጂኖችን መለየት

- ተግባራዊ ማብራሪያ እና የጠቋሚ ጂኖች ማበልጸግ

- በቡድኖች መካከል የአንድ ዓይነት ክላስተር ልዩነት መግለጫ

በተጨማሪም BMKGene የፈጠረው "BSTViewer" ለተጠቃሚ ምቹ የሆነ መሳሪያ ሲሆን ተጠቃሚው የጂን አገላለጽ እንዲታይ እና በተለያዩ ጥራቶች እንዲሰበሰብ ያደርጋል።

BMKGene የቦታ መገለጫ አገልግሎቶችን በነጠላ ሕዋስ ጥራት (በሴል ቢን ወይም ባለብዙ ደረጃ ስኩዌር ቢን ከ100um እስከ 3.5um ላይ የተመሰረተ) ያቀርባል።

በS3000 ስላይድ ላይ ከሚገኙ የቲሹ ክፍሎች የተገኘ የቦታ መገለጫ መረጃ ከዚህ በታች በጥሩ ሁኔታ ተከናውኗል።

የጉዳይ ጥናት 1፡ የመዳፊት አንጎል

የአይጥ አንጎል ክፍል ከ S3000 ጋር የተደረገ ትንተና ~94 000 ሴሎችን በመለየት ~2000 ጂኖች በአንድ ሴል መካከለኛ ቅደም ተከተል ያለው። የተሻሻለው የ3.5 uM ጥራት እጅግ በጣም ዝርዝር የሆነ የሕዋስ ስብስቦች በጽሑፍ ግልባጭ ላይ ተመስርተው፣የሴሎች ዘለላዎች የአንጎልን ልዩ ልዩ አወቃቀሮችን በመኮረጅ አስከትሏል። ይህ በቀላሉ በግራጫ እና በነጭ ቁስ ውስጥ ብቻ የሚገኙ እንደ oligodendrocytes እና microglia ህዋሶች የተሰባሰቡ ሴሎች ስርጭትን በማየት በቀላሉ ይስተዋላል።

xv (1)

ጉዳይ ጥናት 2: የመዳፊት ሽል

xv (1)

ከS3000 ጋር የመዳፊት ሽል ክፍል ትንተና ~ 2200 000 ሴሎችን በመለየት ~ 1600 ጂኖች በአንድ ሴል አማካይ ቅደም ተከተል ተገኝቷል። የተሻሻለው የ3.5 uM ጥራት በጽሑፍ ግልባጭ ላይ ተመስርተው እጅግ በጣም ዝርዝር የሆነ የሕዋስ ስብስቦችን አስገኝቷል፣ በአይን አካባቢ 12 ዘለላዎች እና 28 በአንጎል አካባቢ ስብስቦች።

xv (1)

የውስጠ-ናሙና ትንተና የሕዋስ ስብስብ፡

xv (1)

የጠቋሚ ጂኖች መለየት እና የቦታ ስርጭት፡

xv (1)

- ከፍ ያለ የንዑስ ሴሉላር ጥራት፡ ከS1000 ስላይድ ጋር ሲነጻጸር፣ እያንዳንዱ የS3000 የተቀረጸ ቦታ>4 ሚሊዮን የቦታ ባርኮድ ስፖቶች በ2.5µm ዲያሜትር እና በቦታ ማዕከሎች መካከል 3.5 µm ርቀት ያለው፣የቦታ ግልባጭ ትንተና ከፍ ባለ ንዑስ-ሴሉላር ጥራት ጋር ይይዛል። (ካሬ ቢን: 3.5 µm)

- ከፍተኛ የቀረጻ ቅልጥፍና፡ ከS1000 ስላይድ ጋር ሲነጻጸር፣ Median_UMI ከ30% ወደ 70%፣ Median_Gene ከ30% ወደ 60% ጨምሯል።

የ S1000 ቺፕ እቅድ: