WGS (Nanopore)

Heelgenoomhervolgordebepaling met Nanopore is 'n gewilde metode om genomiese variante te identifiseer, veral strukturele variante (SV's), wat meer akkuraat genoem word deur langleesvolgordebepaling as deur kortleesvolgordebepaling. Die BMKCloud TGS-WGS (Nanopore) pyplyn is ontwerp om data van WGS-projekte met Nanopore te ontleed deur 'n hoë-gehalte, goed geannoteerde verwysingsgenoom te gebruik. Die analise begin met leesafkorting en kwaliteitbeheer, gevolg deur belyning na die verwysingsgenoom, SV-roeping en deur funksionele annotasie van SV-geassosieerde gene deur gebruik te maak van veelvuldige databasisse.