-
BMKMANU S3000_Ruimtelike transkriptoom
Ruimtelike transkriptomika staan aan die voorpunt van wetenskaplike innovasie, wat navorsers bemagtig om in ingewikkelde geenuitdrukkingspatrone binne weefsels te delf, terwyl hul ruimtelike konteks bewaar word. Te midde van verskeie platforms het BMKGene die BMKManu S3000 Ruimtelike Transkriptoom-skyfie ontwikkel, wat spog met 'n verbeterde resolusie van 3.5µm, wat die subsellulêre reeks bereik, en multi-vlak resolusie instellings moontlik maak. Die S3000-skyfie, met ongeveer 4 miljoen kolle, gebruik mikroputte wat gelaag is met krale wat gelaai is met ruimtelik-strepieskode-opvangprobes. 'n cDNA-biblioteek, verryk met ruimtelike strepieskodes, word van die S3000-skyfie voorberei en daarna op die Illumina NovaSeq-platform gerangskik. Die kombinasie van ruimtelike strepieskode-monsters en UMI's verseker die akkuraatheid en spesifisiteit van die gegenereerde data. Die BMKManu S3000-skyfie is uiters veelsydig en bied multi-vlak resolusie-instellings wat fyn ingestel kan word op verskillende weefsels en verlangde vlakke van detail. Hierdie aanpasbaarheid posisioneer die skyfie as 'n uitstekende keuse vir uiteenlopende ruimtelike transkriptomika-studies, wat presiese ruimtelike groepering met minimale geraas verseker. Die gebruik van selsegmenteringstegnologie met BMKManu S3000 maak die afbakening van transkripsiedata tot die grense van selle moontlik, wat lei tot 'n analise wat direkte biologiese betekenis het. Verder lei die verbeterde resolusie van S3000 tot 'n groter aantal gene en UMI's wat per sel opgespoor word, wat 'n baie meer akkurate ontleding van die ruimtelike transkripsiepatrone en groepering van selle moontlik maak.
-
Enkelkern-RNA-volgordebepaling
Die ontwikkeling van enkelselvaslegging en pasgemaakte biblioteekkonstruksietegnieke, tesame met hoë-deursetvolgordebepaling, het geenuitdrukkingstudies op selvlak 'n rewolusie laat ontstaan. Hierdie deurbraak maak voorsiening vir dieper en meer omvattende ontleding van komplekse selpopulasies, wat die beperkings oorkom wat verband hou met die gemiddelde geenuitdrukking oor alle selle en die behoud van die ware heterogeniteit binne hierdie populasies. Terwyl enkelsel-RNA-volgordebepaling (scRNA-seq) onmiskenbare voordele het, ondervind dit uitdagings in sekere weefsels waar die skepping van 'n enkelsel-suspensie moeilik blyk te wees en vars monsters vereis. By BMKGene spreek ons hierdie struikelblok aan deur enkelkern-RNA-volgordebepaling (snRNA-seq) aan te bied deur gebruik te maak van die moderne 10X Genomics Chromium-tegnologie. Hierdie benadering verbreed die spektrum van monsters wat vatbaar is vir transkriptoomanalise op enkelselvlak.
Die isolasie van kerne word bewerkstellig deur die innoverende 10X Genomics Chromium-skyfie, met 'n agtkanaal-mikrovloeistofstelsel met dubbele kruisings. Binne hierdie stelsel word gelkrale wat strepieskodes, primers, ensieme en 'n enkele kern bevat, in nanoliter-grootte oliedruppels ingekapsuleer, wat Gel Bead-in-Emulsion (GEM) vorm. Na GEM-vorming vind sellise en strepieskodevrystelling binne elke GEM plaas. Vervolgens ondergaan mRNA-molekules omgekeerde transkripsie in cDNA's, wat 10X strepieskodes en Unieke Molekulêre Identifiseerders (UMI's) insluit. Hierdie cDNA's word dan aan standaardvolgorde-biblioteekkonstruksie onderwerp, wat 'n robuuste en omvattende verkenning van geenuitdrukkingprofiele op enkelselvlak fasiliteer.
Platform: 10× Genomics Chromium en Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Ruimtelike Transkriptoom
Ruimtelike transkriptomika is 'n voorpunt-tegnologie wat navorsers in staat stel om geenuitdrukkingspatrone binne weefsels te ondersoek, terwyl hul ruimtelike konteks bewaar word. Een kragtige platform in hierdie domein is 10x Genomics Visium tesame met Illumina-volgordebepaling. Die beginsel van 10X Visium lê op 'n gespesialiseerde skyfie met 'n aangewese vangarea waar weefselafdelings geplaas word. Hierdie vangarea bevat strepieskode kolle, wat elk ooreenstem met 'n unieke ruimtelike ligging binne die weefsel. Die vasgevang RNA-molekules van die weefsel word dan gemerk met unieke molekulêre identifiseerders (UMI's) tydens die omgekeerde transkripsieproses. Hierdie strepieskode kolle en UMI's maak presiese ruimtelike kartering en kwantifisering van geenuitdrukking by 'n enkelsel-resolusie moontlik. Die kombinasie van ruimtelike strepieskode-monsters en UMI's verseker die akkuraatheid en spesifisiteit van die gegenereerde data. Deur hierdie Ruimtelike Transkriptomika-tegnologie te gebruik, kan navorsers 'n dieper begrip kry van die ruimtelike organisasie van selle en die komplekse molekulêre interaksies wat binne weefsels voorkom, wat waardevolle insigte bied in die meganismes onderliggend aan biologiese prosesse in verskeie velde, insluitend onkologie, neurowetenskap, ontwikkelingsbiologie, immunologie , en botaniese studies.
Platform: 10X Genomics Visium en Illumina NovaSeq
