-
Gereedskapstelle
BMKCloud is 'n toonaangewende bio-informatiese platform wat eenstop-oplossing vir genomiese programme bied, wat wyd vertrou word deur navorsers in verskeie arena, insluitend mediese, landbou-, omgewings-, ens. , rekenaarhulpbronne, publieke databasis, bioinformtiese aanlynkursusse, ens. annotasie, evolusionêre genetiese gereedskap, ncRNA, datakwaliteitbeheer, samestelling, belyning, data-onttrekking, mutasies, statistieke, figuurgenerator, volgorde-analise, ens.
-
De novo Bakteriële Genoom Vergadering
Ons bied 'n volledige bakteriese genoom-samestellingsdiens, wat 0 gapings waarborg. Dit is moontlik deur die integrasie van langleesvolgordebepalingtegnologieë, soos Nanopore en PacBio vir samestelling en kortleesvolgordebepaling met Illumina vir samestellingvalidering en foutkorreksie van ONT-lesings. Ons diens bied die volledige bioinformatiese werkvloei van samestelling, funksionele annotasie en gevorderde bioinformatiese analise, wat spesifieke navorsingsdoelwitte vervul. Hierdie diens maak die ontwikkeling van presiese verwysingsgenome vir verskeie genetiese en genomiese studies moontlik. Daarbenewens vorm dit die basis vir toepassings soos stamoptimalisering, genetiese ingenieurswese en mikrobiese tegnologie-ontwikkeling, wat betroubare en gapingsvrye genomiese data verseker wat noodsaaklik is vir die bevordering van wetenskaplike insigte en biotegnologiese innovasie.
-
klein RNA
Klein RNA's is tipe kort nie-koderende RNA met 'n gemiddelde lengte van 18-30 nt, insluitend miRNA, siRNA en piRNA. Daar is grootliks berig dat hierdie klein RNA's betrokke is by verskeie biologiese prosesse soos mRNA-afbraak, translasie-inhibisie, heterochromatienvorming, ens. Klein-RNA-volgordebepalingsanalise is wyd toegepas in studies oor dier-/plantontwikkeling, siektes, virus, ens. volgordeontledingsplatform bestaan uit standaardanalise en gevorderde data-ontginning. Op grond van RNA-volgorde-data kan standaardanalise miRNA-identifikasie en -voorspelling, miRNA-teikengeen-voorspelling, annotasie en uitdrukkingsanalise bewerkstellig. Gevorderde analise maak gepasmaakte miRNA soek en onttrekking, Venn diagram generering, miRNA en teiken geen netwerk bou moontlik.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS is 'n hele genoom hervolgorde-analise platform, wat ontwikkel is op grond van 'n ryk ervaring in Biomarker Technologies. Hierdie maklik-om-te-gebruik platform laat 'n vinnige indiening van 'n geïntegreerde analise-werkvloei toe deur eenvoudig 'n paar basiese parameters in te stel, wat pas by DNA-volgordedata wat gegenereer word vanaf beide Illumina-platform en BGI-volgordebepalingsplatform. Hierdie platform word op hoëwerkverrigting rekenaarbediener ontplooi, wat hoogs doeltreffende data-analise in baie beperkte tyd bemagtig. Gepersonaliseerde data-ontginning is beskikbaar op grond van standaardanalise, insluitend gemuteerde geennavraag, PCR-primerontwerp, ens.
-
mRNA (verwysing)
Transkriptoom is die skakel tussen genomiese genetiese inligting en die proteoom van biologiese funksie. Transkripsievlakregulering is die belangrikste en die mees bestudeerde reguleringsmodus van organismes. Transkripsievolgordebepaling kan die transkripsie op enige tydstip of onder enige toestand volgorde, met 'n resolusie akkuraat tot 'n enkele nukleotied. Dit kan die vlak van geentranskripsie dinamies weerspieël, seldsame en normale transkripsies gelyktydig identifiseer en kwantifiseer, en die strukturele inligting van monster spesifieke transkripsies.
Tans word transkripsievolgordebepalingstegnologie wyd gebruik in agronomie, medisyne en ander navorsingsvelde, insluitend diere- en plantontwikkelingsregulering, omgewingsaanpassing, immuuninteraksie, geenlokalisering, spesie-genetiese evolusie en opsporing van tumor- en genetiese siektes.
-
Metagenomika (NGS)
Hierdie ontledingsplatform is ontwerp vir haelgeweer metagenomiese data-analise op grond van jare se ondervinding. Dit bestaan uit geïntegreerde werkvloei wat verskeie algemeen benodigde metagenomiese ontledings bevat, insluitend dataverwerking, spesievlakstudies, geenfunksievlakstudies, metagenoombinning, ens. Daarbenewens is pasgemaakte data-ontginningnutsmiddels beskikbaar op standaardanalise-werkvloei, insluitend geen- en spesienavraag , parameterinstelling, gepersonaliseerde figuurgenerering, ens.
-
LncRNA
Lang nie-koderende RNA's (lncRNA) is 'n tipe transkripsies met lengte langer as 200 nt, wat nie in staat is om proteïene te kodeer nie. Akkumulatiewe bewyse dui daarop dat die meeste lncRNA's baie waarskynlik funksioneel sal wees. Hoë-deurset-volgordebepalingstegnologieë en bioinformatiese ontledingsinstrumente bemagtig ons om lncRNA-volgordes en posisioneringsinligting meer doeltreffend te openbaar en lei ons om lncRNA's met deurslaggewende regulatoriese funksies te ontdek. BMKCloud is trots daarop om ons kliënte 'n lncRNA-volgorde-analise-platform te voorsien om vinnige, betroubare en buigsame lncRNA-analise te bewerkstellig.
-
GWAS
Genoomwye assosiasiestudie (GWAS) het ten doel om genetiese variante (genotipe) te identifiseer wat met spesifieke eienskappe (fenotipe) geassosieer word. GWA-studies ondersoek genetiese merkers wat die hele genoom van groot aantal individue kruis en voorspel genotipe-fenotipe assosiasies deur statistiese analise op bevolkingsvlak. Heel-genoom hervolgorde kan potensieel alle genetiese variante ontdek. Gekoppel aan fenotipiese data, kan GWAS verwerk word om fenotipe-verwante SNP's, QTL's en kandidaatgene te identifiseer, wat moderne diere-/plantteling sterk ondersteun. SLAF is 'n self-ontwikkelde vereenvoudigde genoomvolgordebepalingstrategie, wat genoomwydverspreide merkers, SNP, ontdek. Hierdie SNPs, as molekulêre genetiese merkers, kan verwerk word vir assosiasiestudies met geteikende eienskappe. Dit is 'n koste-effektiewe strategie om komplekse eienskappe wat verband hou met genetiese variasies te identifiseer.
-
Nanopore Vollengte transkriptomika
Komplekse en veranderlike alternatiewe isovorme in organismes is belangrike genetiese meganismes vir die regulering van geenuitdrukking en proteïendiversiteit. Akkurate identifikasie van transkripstrukture is die basis vir in-diepte studie van geenuitdrukking reguleringspatrone. Nanopore-volgordebepalingsplatform het transkriptomiese studie suksesvol na isovormvlak gebring. Hierdie ontledingsplatform is ontwerp om RNA-Seq-data wat op Nanopore-platform gegenereer word, te analiseer op grond van verwysingsgenoom, wat kwalitatiewe en kwantitatiewe ontledings op beide geenvlak en transkripsievlak bereik.
-
circ-RNA
Sirkulêre RNA (sirkulêre RNA) is 'n tipe nie-koderende RNA wat onlangs gevind is om 'n belangrike rol te speel in regulatoriese netwerke betrokke by ontwikkeling, omgewingsweerstand, ens. Verskil van lineêre RNA-molekules, bv. mRNA, lncRNA, 3' en 5' punte van circRNA word saamgevoeg om 'n sirkelvormige struktuur te vorm, wat hulle van vertering van eksonuklease red en meer stabiel is as die meeste van lineêre RNA. Daar is gevind dat CircRNA uiteenlopende funksies het in die regulering van geenuitdrukking. CircRNA kan presteer as ceRNA, wat miRNA mededingend bind, bekend as miRNA-spons. CircRNA volgorde analise platform bemagtig circRNA struktuur en uitdrukking analise, teiken voorspelling en gesamentlike analise met ander tipes RNA molekules
-
BSA
Bulked Segregant Analysis platform bestaan uit een-stap standaard analise en gevorderde analise met pasgemaakte parameter instelling. BSA is 'n tegniek wat gebruik word om vinnig fenotipe-geassosieerde genetiese merkers te identifiseer. Hoofwerkvloei van BSA bevat: 1. seleksie van twee groepe individue met uiters opponerende fenotipes; 2. die samevoeging van die DNA, RNA of SLAF-volgorde (Ontwikkel deur Biomarker) van alle individue om twee massas DNA te vorm; 3. identifisering van differensiële volgordes teen verwysingsgenoom of tussenin, 4. voorspelling van kandidaat-gekoppelde streke deur ED en SNP-indeks algoritme; 5. Funksionele analise en verryking van gene in kandidaatstreke, ens. Meer gevorderde ontginning van data, insluitend genetiese merker sifting en primer ontwerp is ook beskikbaar.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platform is ontwikkel met jare se ondervinding in mikrobiese diversiteit projek analise, wat gestandaardiseerde basiese analise en persoonlike analise bevat: basiese analise dek die hoofstroom analise inhoud van huidige mikrobiese navorsing, die analise inhoud is ryk en omvattend, en ontledingsresultate word in die vorm van projekverslae aangebied; Die inhoud van gepersonaliseerde analise is uiteenlopend. Monsters kan gekies word en parameters kan buigsaam gestel word volgens die basiese ontledingsverslag en navorsingsdoel, om persoonlike vereistes te verwesenlik. Windows-bedryfstelsel, eenvoudig en vinnig.
-
Evolusionêre Genetika
Evolusionêre Genetika is 'n omvattende volgordebepalingdiens wat ontwerp is om 'n insiggewende interpretasie van die evolusie binne 'n groot groep individue te bied, gebaseer op genetiese variasies, insluitend SNP's, InDels, SV's en CNV's. Hierdie diens sluit alle noodsaaklike ontledings in wat nodig is om die evolusionêre verskuiwings en genetiese kenmerke van bevolkings toe te lig, insluitend assesserings van bevolkingstruktuur, genetiese diversiteit en filogenetiese verwantskappe. Boonop delf dit in studies oor geenvloei, wat ramings van effektiewe bevolkingsgrootte en divergensietyd moontlik maak. Evolusionêre genetikastudies lewer waardevolle insigte oor die oorsprong en aanpassings van spesies.
By BMKGENE bied ons twee maniere om evolusionêre genetikastudies op groot populasies uit te voer: die gebruik van heelgenoomvolgordebepaling (WGS) of kies vir 'n verminderde verteenwoordiging genoomvolgordebepalingsmetode, die intern-ontwikkelde Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF). Terwyl WGS kleiner genome pas, kom SLAF na vore as 'n koste-effektiewe alternatief vir die bestudering van groter populasies met langer genome, wat opeenvolgingskoste effektief verminder.
