mRNA-volgorde (NGS) met verwysingsgenoom
RNA-seq is 'n standaardhulpmiddel oor lewens- en gewaswetenskappe, wat die gaping tussen genome en proteome oorbrug. Die krag daarvan lê daarin om nuwe transkripsies te ontdek en die uitdrukking daarvan in een toets te kwantifiseer. Dit word wyd gebruik vir vergelykende transkriptomiese studies, wat lig werp op gene wat verband hou met verskeie eienskappe of fenotipes, soos om mutante met wilde-tipes te vergelyk of geenuitdrukking onder spesifieke toestande te openbaar. BMKCloud mRNA(Reference) APP integreer uitdrukkingskwantifisering, differensiële uitdrukkingsanalise(DEG) en volgordestruktuurontledings in die mRNA-seq(NGS) bioinformatika pyplyn en amalgameer die sterk punte van soortgelyke sagteware, wat gerief en gebruikersvriendelikheid verseker. Gebruikers kan hul RNA-seq-data na die wolk oplaai, waar die App 'n omvattende, eenstop-bioinformatiese analise-oplossing bied. Boonop prioritiseer dit klante-ervaring, en bied persoonlike bedrywighede aangepas by gebruikers se spesifieke behoeftes. Gebruikers kan parameters stel en self die pyplynmissie indien, die interaktiewe verslag nagaan, data/diagramme bekyk en data-ontginning voltooi, soos: teikengeneseleksie, funksionele groepering, diagrammering, ens.
Platform:Illumina, MGI
Strategie:RNA-Seq
Uitleg: Gepareerde, skoon data.
Biblioteek tipe:fr-ongestrand, fr-eerstestrand of fr-tweedestrand
Lees lengte:150 bp
Lêertipe:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz of *.fq.gz. Die stelsel salkoppel outomaties die .fastq-lêers volgens hul lêername,bv *_1.fastq gepaard met *._2.fastq.
Aantal monsters:Daar is geen beperkings op die nommer nievan monsters, maar die ontledingstyd sal toeneem namate die aantalmonsters groei.
Aanbevole databedrag:6G per monster