Genoom

Chromosoomskaal-samestelling en ontleding van biomassa gewas Miscanthus Lutarioriparius genoom
Nanopore -volgorde | Illumina | Hi-c | RNA-volgorde | Filogenie
In hierdie studie het Biomarker Technologies tegniese ondersteuning verleen oor nanopore-volgorde, de novo-genoomvergadering, HI-C-ondersteunde montering, ens.
Abstrak
Miscanthus, 'n risomomatiese meerjarige plant, het 'n groot potensiaal vir bio -energieproduksie vir sy hoë biomassa en stresverdraagsaamheid. Ons rapporteer 'n chromosoomskaal-vergadering vanMiscanthus LutarioripariusGenoom deur Oxford Nanopore-volgorde en HI-C-tegnologieë te kombineer. Die 2,07 GB-samestelling beslaan 96,64% van die genoom, met Contig N50 van 1,71 MB. Die sentromere- en telomere -reekse word onderskeidelik vir al 19 chromosome en chromosoom 10 saamgestel. Lotetraploïede oorsprong van die M. lutarioriparius word met behulp van sentromere satellietherhalings verwar. Die tetraploïede genoomstruktuur en verskeie chromosomale herrangskikkings relatief tot sorghum word duidelik aangetoon. Tandem duplikaat gene vanM. Lutarioripariusis funksioneel verryk, nie net in terme wat verband hou met stresrespons nie, maar ook selwandbiosintese. Genesfamilies wat verband hou met weerstand teen siektes, biosintese van die selwand en metaalioonvervoer word baie uitgebrei en ontwikkel. Die uitbreiding van hierdie gesinne kan 'n belangrike genomiese basis wees vir die verbetering van merkwaardige eienskappe vanM. Lutarioriparius.
Belangrike statistieke van genoomvergadering


Figuur. Oorsig van die M. Lutarioriparius Genome Assembly
Nuus en hoogtepunte Die doel om die nuutste suksesvolle gevalle met biomerketegnologieë te deel, om nuwe wetenskaplike prestasies te bepaal, sowel as prominente tegnieke wat tydens die studie toegepas is.
Postyd: Jan-05-2022