lncrna

Lang nie-koderende RNA's (lncRNA) is RNA's langer as 200 nukleotiede met 'n lae koderingspotensiaal maar met kritieke regulatoriese funksies. Die BMKCloud lncRNA-pyplyn is ontwerp om rRNA-uitgeputte biblioteke te analiseer met 'n hoë kwaliteit, goed geannoteerde verwysingsgenoom, deur lncRNA en mRNA uitdrukking saam te analiseer. Na gelees snoei en kwaliteit beheer, word lees in lyn gebring met die verwysing genoom om transkripsies saam te stel, en daaropvolgende geenstruktuur analise openbaar alternatiewe splitsing en nuwe gene. Transkripsies word as mRNA's of lncRNA's geïdentifiseer, en differensiële uitdrukkingsanalise identifiseer differensieel uitgedrukte lncRNA's, hul teikens en differensieel uitgedrukte gene (DEGS). Beide DEG's en differensieel uitgedrukte lncRNA-teikens word funksioneel geannoteer om verrykte funksionele kategorieë te vind.