DNBSEQ voorafgemaakte biblioteke
Kenmerke
●Platform:MGI-DNBSEQ-T7
●Volgorde-modusse:PE150
●Oordrag van Illumina biblioteke naMGI:wat volgordebepaling van hoë datavolumes teen lae koste moontlik maak.
●Gehaltebeheer van biblioteke voor volgordebepaling.
●Opeenvolging van data QC en aflewering:aflewering van QC verslag en rou data in fastq formaat na demultipleksing en filter Q30 lees.
Voordele
●Veelsydigheid van volgordebepalingdienste:die kliënt kan kies om volgens baan of hoeveelheid data te volgorde.
●Hoë data-uitset:1500 Gb/baan
●Lewering van volgorde QC-verslag:met kwaliteit statistieke, data akkuraatheid en algehele prestasie van die volgordebepaling projek.
●Volwasse volgordebepaling proses:met kort omkeertyd.
●Streng kwaliteitbeheer: ons implementeer streng QC-vereistes om die lewering van konsekwent hoë kwaliteit resultate te waarborg.
Voorbeeldvereistes
| Databedrag (X) | Konsentrasie (qPCR/nM) | Volume | |
| Gedeeltelike baan
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Enkelbaan | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Biblioteekpoel | ≥ 25 μl / Biblioteek swembad |
Benewens konsentrasie en totale hoeveelheid, word 'n geskikte piekpatroon ook vereis.
Let wel: Laan-volgordebepaling van biblioteke met 'n lae diversiteit vereis PhiX-spit-in om robuuste basisoproepe te verseker.
Ons beveel aan dat vooraf saamgevoegde biblioteke as voorbeelde ingedien word. As jy BMKGENE benodig om biblioteekpoel uit te voer, verwys asseblief na die
biblioteekvereistes vir gedeeltelike baanvolgordebepaling.
Biblioteekgrootte (Piekkaart)
Hoofpiek moet binne 300-450 bp wees.
Biblioteke moet 'n enkele hoofpiek hê, geen adapter kontaminasie en geen primer dimers nie.
Dienswerkvloei
Biblioteek QC verslag
'n Verslag oor die kwaliteit van die biblioteek word verskaf voor opeenvolging, assessering van biblioteekhoeveelheid en fragmentering.
Volgorde QC verslag
Tabel 1. Statistiek oor volgordebepalingsdata.
| Voorbeeld ID | BMKID | Rou lees | Rou data (bp) | Skoon lees (%) | Q20(%) | V30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22 870 120 | 6 861 036 000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14 717 867 | 4 415 360 100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figuur 1. Kwaliteitverspreiding langs leesstukke in elke monster
Figuur 2. Basisinhoudverspreiding
Figuur 3. Verspreiding van leesinhoud in volgordebepalingdata
